Helobdella robusta: HELRODRAFT_84833
Help
Entry
HELRODRAFT_84833 CDS
T03272
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14306
nuclear pore complex protein Nup62
Organism
hro
Helobdella robusta
Pathway
hro03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hro00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
HELRODRAFT_84833
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
hro03019
]
HELRODRAFT_84833
Messenger RNA biogenesis [BR:
hro03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
HELRODRAFT_84833
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nsp1_C
DUF4164
LRR_NXF1-5
BAF1_ABF1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20216391
NCBI-ProteinID:
XP_009023711
JGI:
Helro1_84833
UniProt:
T1G5P4
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
340 aa
AA seq
DB search
MPTPTSTTTTTSTVGGFNLAASLAATTPASSASPQLPLLPLSIPQSSSASATASSSSSVA
ATSTTTTALTSLSATASTTVISSSTTYSQLEDLINKWTTELQEQEKLFLHQATFVNAWDR
VLMENGEKITQLNLDLEKMKMDQSRLDEDLDFVLGQQNELEEILKPLEEKVGSLQKPQGY
YVAHADIERDQIYRLAESTDGQLKVLSSKLKEIIDHINVNEGGDDDNNDSIRQISKILNA
HTDSLQWIDRNTGMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYV
CMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCVCV
NT seq
1023 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaccccgacatcgacgacgacgacaacgtcaaccgtcggcggattcaacctagca
gcatctctggcagcaacaacaccagcttcatcggcatcaccacaacttccactgttgcca
ttatctataccccagtcgtcgtcagcgtcagctacagcgtcgtcgtcatcgtcagtagca
gcaacatcgacgacaacaactgcattgacgtccctatctgcaacggcatcgacaacagtg
atttcatcatcgacgacatacagccagcttgaagatttgattaacaagtggaccaccgaa
ttgcaggagcaggagaaattgttccttcaccaggctacatttgtaaacgcttgggataga
gtactcatggaaaatggtgaaaaaataactcaattaaacttggacctggagaaaatgaag
atggaccagagcagactagacgaggatctggatttcgttttgggccaacagaatgagcta
gaagaaatcctaaagccattggaggagaaagttgggtccttgcaaaaaccccagggctac
tatgtggcccatgctgatattgagagggatcaaatatacagacttgccgagagcacagac
ggacagctgaaagtcttatccagtaagctgaaagaaatcattgaccacatcaacgttaac
gaaggaggggatgatgacaataacgatagcattcgccagatatcaaagatattaaatgca
catacagattctcttcaatggatagatagaaatacaggtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgta
tgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtgcgta
tga
DBGET
integrated database retrieval system