KEGG   Acetivibrio saccincola: HVS_00825
Entry
HVS_00825         CDS       T05223                                 
Name
(GenBank) ski2-like helicase
Organism
hsc  Acetivibrio saccincola
SSDB
Motif
Pfam: DEAD HIRAN ResIII Helicase_C DEXQc_Suv3
Other DBs
NCBI-ProteinID: AUG56141
UniProt: A0A2K9EI04
LinkDB
Position
155307..158777
AA seq 1156 aa
MDKIIDMNKLYLCLKDIIENKKEVERVREVIIDLHFYIQRIILNRKEVDNIDRTSMESIS
MYLLSLLTNVTSEEMKRYTQDFYIEGLNIAGLIFELLADVEFEDFEKKRQYLFYSSVSYS
LSDKEASAAVIGRRLKSIIENDKIPSLGIDVKKSWIYICLTLGREFKTIYKDRNQLDLSI
KLSKNTIWDFLNRILILNARSFVDGLDNKIIFENMEELKNFLIQLDDIETLFYISLLSEV
LHRMHSKSVWSILLREGFTNEYIKVLTKYDSRNVYELWKSQLDALRCNNKGFNYLSENIK
RVLISMPTSAGKSFVAELAIVKSLQLSEDKVCIYVTPTRALMSEIEGNLFYRLRKIGYNV
TSVLDTDENEYENDLLSQANVLVVTPEKLDLLLRRHKEFIERIKLIIFDEFHKVADNSRG
WLLETLITWFMIKQQQYSFKIILMSAIVSNSEEVNVWLENDEFRPIVSEWTPSRRVYGVL
IPDTDRTKYIRISDKKRQKITPYRLIYKYLERRRAIEDVITDIIVEYKNSNRRWKKSNNK
YDTKYDRCFKFINTLNNGKVLVYFFTKIDLERFIEYAEKYLPLKEDVRINKLKEFLDSRL
GSEHPLVNSILYGVAYHHGDLPIEVRKEIEKAYKENLINVLACTTTLSDGVNLPIKNFVL
GSFTSYGGEHKLSIADFKNIVGRAGRAYIDTEGNIFLICHPEYYFNNDKISYFRRLLFCE
SQETNVSSSMIEKFDKIYSIIDQLEEVIEISIQDVEKSLLDFIDRLQVFIFSLYEEHIDY
INGYDDLYELLKHSLFAKQADDKVLDKFDKVCIKYYNFVRELDKSIIEKFNRTGLSFRSN
RVLLEIVDEISKNESGFDFDLQKIITPEIFKKIIELKEISPKQYFYKVGNKNVNYKVDNY
KAFISWISGESFLKIRDSIFYEDNNISNRTQTCVNYINDMFLYKLPWAFSSLYALAKDRL
MFADFILKDLPAKIKYGVENLEAVKLCTLGIESRELANTLAAMYENDSSKDPEWTIDKWI
LEKRFYELEKGIKGIDDISIRQIARVRTKLRKRTSFLKDTGKIRCDVRGLRYYDYFNLYR
NKSINKNTQLLLNHEPKNLYDEFAIEVRTNKGEKIGYVPAEYSEEIFEYIQGDHILEVEI
IRLAPRTVKIMIKVNN
NT seq 3471 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacaaaattatcgatatgaataagttatatctttgcttaaaagatattatcgagaat
aaaaaagaagttgaaagggttagggaagttattattgaccttcatttttacatacaaaga
attatacttaatagaaaagaagtagataatatagaccgtacttctatggaaagtatttca
atgtatttactttccttgttaacaaatgtaacaagtgaagaaatgaaaagatatactcaa
gacttttatatcgaagggttaaatattgctggtctaatatttgagttgcttgcagatgta
gagtttgaagactttgaaaaaaagcgacagtacttattttattcatcagtttcatacagt
ttgtcagataaagaagcaagtgcagcggtcataggtagaaggttgaagtcgattattgaa
aatgacaaaatacccagtttgggtattgatgtaaaaaaatcatggatatatatttgtctt
actttaggtagagaatttaaaacaatatataaagatagaaatcaactggatttatcaatt
aaattatctaaaaatactatatgggattttttaaacagaatcttaatcttaaatgctcgt
tcatttgttgacgggcttgataataaaatcatatttgaaaatatggaagaattaaagaat
tttttaatacaactagatgatatagagaccttattttatatttcattattgagtgaagtg
ttacacagaatgcacagtaaaagtgtgtggtcaatacttctacgtgaaggctttacaaat
gaatatataaaagttctcacaaagtatgatagtagaaatgtatatgaattatggaaatcc
caattagatgctttgagatgcaataataaaggatttaattatcttagcgaaaatataaaa
agagtacttatttctatgcctacaagtgcaggaaaaagttttgtcgcagaattagcgata
gtgaagtcgctacagttatcggaagataaggtatgtatatatgtaaccccaacacgagca
cttatgtcggagattgaaggtaacttgttctataggttaagaaaaattggatataatgtt
acatcagttcttgataccgatgaaaatgaatatgagaatgatttattaagccaagcaaat
gttcttgtagtaactcctgaaaaacttgatttattgttacggagacataaagaatttatt
gaaagaataaagttaattattttcgatgagtttcataaagtggctgataacagtaggggt
tggttgttagaaacactaattacatggtttatgattaaacaacaacaatatagttttaaa
attattctaatgtcggctattgttagcaatagtgaagaagttaatgtttggctcgaaaat
gatgagtttaggcctatagtatcggaatggactccaagcaggagagtttatggtgtatta
attcctgatactgaccgtactaaatatataagaattagtgataaaaaaagacaaaaaata
actccatatcgccttatttataaatatcttgaaagaagaagggctatagaagacgtaatt
acagatataatagttgaatataaaaattcaaataggcggtggaaaaaaagcaataataaa
tatgatacaaaatatgaccgttgttttaagttcatcaatacattgaataacggtaaagtg
ttggtatatttttttaccaaaatagatttagagcgtttcattgaatatgctgaaaaatat
cttcctttgaaagaagatgtgagaataaataaactaaaagaatttttagatagccgacta
ggaagtgaacatcctctagtcaatagcatattatatggggttgcttatcatcatggagat
ttacctattgaagtaagaaaagaaatagaaaaagcatataaagaaaatttaataaatgtt
ttagcatgtaccacaacattatctgatggggtaaatttaccaatcaaaaattttgtttta
ggttcttttacatcgtatggaggagaacataaattatccattgcagattttaaaaatata
gttggcagggctggaagagcctatattgatactgaaggaaatatatttttaatttgtcat
ccagaatactattttaataatgataaaataagttacttcagacgacttttattttgcgaa
tctcaagaaactaatgtttcaagttcgatgattgaaaaatttgataaaatatactcaatt
atcgaccagttagaggaagtaatagaaatatccatacaggatgtggagaaatccctatta
gattttattgataggttacaggtatttatttttagtttatatgaagagcatatagactat
ataaatggttatgacgatttatatgaactattaaaacattcactatttgcaaaacaagca
gatgataaagtattagataagtttgataaagtgtgtattaagtattataactttgttagg
gaattggataaaagcattattgaaaaatttaataggacgggactaagttttaggtccaat
cgtgttttattagaaattgttgacgagatttcaaaaaatgaaagtggattcgattttgat
ttacaaaaaattattactccagaaatatttaaaaagataattgaattaaaggaaataagt
cctaaacaatacttttataaagtgggcaataaaaacgttaactataaagtcgacaattat
aaggcttttataagttggattagtggtgaaagttttctcaaaattcgggactctatattc
tatgaagacaataatatctcaaacagaactcagacctgtgtcaattatatcaatgatatg
tttttatataaactaccttgggcttttagttctctatatgctttagccaaagatagatta
atgtttgctgattttatcttgaaggatttacctgctaaaataaaatatggcgtggagaat
ttggaagcagtcaaattatgtacattaggtattgaatctcgagaattggctaatacattg
gcagcgatgtacgagaatgattcgtccaaagaccctgaatggactatagataagtggatt
ttagaaaagagattttacgagttagaaaaagggataaaaggaatagatgatatttctata
aggcaaattgcgagggttagaactaaattgagaaagagaacttcatttctgaaagacaca
ggtaaaattagatgtgatgtaagaggtttacggtattatgattatttcaatttgtacaga
aataaaagtataaataagaatacgcaactgttattaaatcatgagcctaaaaacttatac
gatgaatttgctattgaagttagaactaataagggagaaaaaattggatatgtgcctgct
gaatattcagaagaaatatttgagtatattcaaggtgaccatattttagaagtagaaatt
attaggttagcaccaagaacagtaaaaataatgataaaagttaataattaa

DBGET integrated database retrieval system