Acetivibrio saccincola: HVS_03505
Help
Entry
HVS_03505 CDS
T05223
Symbol
atl1
Name
(GenBank) Bifunctional autolysin precursor
Organism
hsc
Acetivibrio saccincola
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PG_binding_1
LysM
Glucosaminidase
ATG17_like
PG_binding_3
CCDC171
DUF8567
Phage_HK97_TLTM
LysM3_LYK4_5
LIP-1
LysM1_NFP_LYK
Cortex-I_coil
DUF7440
RecO_N
NNF2_middle
Shootin
CCDC89
LysM3_NFP
COG3_N
YPL277C_C
EzrA
T4SS_LegC2C7
TBCA_PH
ApoLp-III
Tho2
COG6_N
Uso1_p115_C
BORCS6
Prominin
CCDC39
DUF3584
MJ1674_2nd
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUG56649
UniProt:
A0A2K9DZV3
LinkDB
All DBs
Position
761369..763564
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MSYMSIDINSLKDIEKRVNSLSKSIEKIKSSLSSVRSNIDSTVRNRSGIDSSMSSLIREV
GERERIMNNVKQFLNEAVKQYEDMEKELRRESDRIIENSTPKTGIIKSILNGLKSIGKKL
GNLLKTIAKNSILLSPIIIGTAVRSIGKMLIERGFIITNKPIEIVKRDDIGLPILNGILS
YNPDEYSPYVVLLQKRLIELGYGDGLEVNGIFNSDTLEAVNRYKEDYGLWNFGEYEGKVG
ETTWNHLFNNQKVPYLTIDNVERDSMGIPVFNSILSYNPWEYNIYVVFLQKRLIELGYGD
DIEVNGIFDSKTLEAVNRYKKDYGLWNFGEYEGKVGETTWNHLFNNQKVPYVANSTQNNI
PVSDEMRTYVIPISLDQAVKNEYNAKWVSNTGEITYACVKSGGDKWVRASEDDIRYYLDP
KNFINHDVYKYQFLVLENVPGMEITDENRTRLIDEINKILEGKGVLHGMGAAFVRAAEET
GLALPYLVAHCILETGWGTSKLARGIDANGNYTGYHNMYGIAAYDNAPLTNGLNKARSSN
WNSVEEAIVGGAHWIKDNYAGNPNKNTIYKMKWQPTDPLGLGQYATDVAWAVKQCEVIKK
LYELFPDAELRFEIPQYVDSKSGDNVGQPVQQSTPSGNGVSKTTNVIEYVVKSGDTLTKI
AKMYNTTVEELAKFNNIENVNLIIVGQVIKIPVKTADTSLPTSQGGTATKKGCRTSKSTN
FKFKWFRWTFI
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcatacatgtctattgatattaattctttaaaagatatagaaaaaagggttaattct
ctttcaaaaagcattgaaaagataaagagcagtctttcttccgtaagaagcaatatagat
tcgacagttcggaacagaagcgggatagacagcagtatgtcaagccttatcagagaagtt
ggcgaaagagaacgtataatgaataatgtaaagcaatttttaaatgaagcggttaaacaa
tatgaagatatggaaaaagaacttagaagagaatcagacagaataattgaaaacagcact
ccaaagaccggtataataaaaagcatattaaacggtttaaaatcaattggtaaaaaacta
ggaaatcttttaaagacaattgcaaaaaattcaatacttttaagtcctataataattgga
acggcagtccgttcaataggaaaaatgctgatagagagaggttttataataaccaataaa
ccaattgaaattgtaaaaagagatgatataggtttaccgatattaaacggaatattaagt
tataatccggatgagtatagcccatatgtggtacttttgcagaaaagattaattgagctg
gggtatggggacggtcttgaagtcaatggtatatttaattcagatacacttgaggcggta
aacaggtataaagaggattatgggctttggaactttggtgagtatgaaggtaaggtgggg
gaaactacctggaatcatttatttaataatcagaaggtaccttatcttacaattgacaat
gtagaaagagatagcatgggtataccggtttttaacagcatactaagctataatccatgg
gaatataacatttatgtagtatttctgcaaaaaaggttaattgaattaggatacggagat
gatatagaagtaaatggaatatttgactcaaagacacttgaagcggtaaacagatataaa
aaggattatgggctttggaattttggtgaatatgaaggcaaggtgggagaaactacctgg
aaccatttattcaataatcaaaaagtaccgtatgtagcaaactctacacagaacaatatt
ccggtttctgatgaaatgagaacttatgtgatacctataagccttgatcaggcagtgaaa
aatgaatataatgcaaaatgggtttcaaatactggtgaaataacttatgcatgtgtaaaa
agcggaggcgacaagtgggtaagagcttcagaagatgatataaggtattatctggatcct
aaaaattttataaatcacgatgtttataaataccaatttttagtattggaaaacgtaccg
ggcatggaaataaccgatgaaaacaggactagattaatagatgaaattaataaaatatta
gagggtaaaggtgtattgcacggtatgggtgcggcttttgtaagagctgcggaggaaacg
gggcttgcacttccttaccttgttgcgcattgtattcttgagacaggatgggggacaagc
aaattagcacgtggaattgacgcaaacggtaattataccggatatcacaacatgtatgga
atagcggcatatgataatgcacctttaacaaacggtttaaataaggccagaagttctaat
tggaattcagttgaagaagccattgtcggaggtgctcattggattaaagataattatgcg
ggaaatcccaataaaaatactatatataaaatgaaatggcagccaactgatccgttagga
ttaggccaatatgctactgatgttgcttgggcggtaaaacagtgtgaagttattaaaaaa
ttgtatgagttatttccagatgcagaattaagatttgaaatacctcaatatgtggacagt
aaaagtggtgataatgtcgggcagccggtgcaacaatcaacaccttccggaaatggtgtt
tcaaaaacaacaaatgtaatagaatatgtagtaaagagtggtgatacattaactaaaata
gcaaaaatgtataatacaactgttgaagaattggctaaatttaataatatagaaaatgta
aatttgattattgtagggcaggtaataaaaataccggttaaaacagcagatacttctttg
cctacaagtcagggaggaactgcaacaaaaaaaggatgcagaacaagcaaaagcaccaat
ttcaagttcaagtggttccggtggactttcatataa
DBGET
integrated database retrieval system