Acetivibrio saccincola: HVS_11960
Help
Entry
HVS_11960 CDS
T05223
Symbol
ydhD1
Name
(GenBank) Putative sporulation-specific glycosylase YdhD
Organism
hsc
Acetivibrio saccincola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Glyco_hydro_18
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUG58279
UniProt:
A0A2K9E4F5
LinkDB
All DBs
Position
complement(2615928..2618018)
Genome browser
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MKKKIIVLIIFLLLLTLISLNKSYDTGASGQHHIRLSEEYHMKDISDHWSREHINELVYM
GILKGYNLKAQPDSRITRAEFITLLVNAMNLDNYKVDGKEHFKDVKKDKWYYVPIETAYE
NGIVRGYGDNTFLPDRFISREEIVITVVNALKLPQNHLEYSIRFNDIGDNYPYKFHLNAA
AGAGIITGYSDNTFRPKNNALRSEAAVIIKKMLETHIEPGSETNSDAEKLNEEKEDIVNL
VDSYINQYINKKNNLKSDIVFNIENSTGKAKEDNITKSAIIHYFNQKGYRVLENIKNLDI
QVDKISGRIAKATAVYDVNYKRFLNGSGNLGDYSKDYKGKKEFSLIKVNDKWKVYNVKEQ
LFKDGKINMVWEQISVKTPDMSGVEPMEGLNIVSPTWFELRNDDNVLGVKESDPVVFSNR
QGKIHMVDMGDMEYMKWARQNGYDVWGLFRNEFDIEIANKVLNSKESREKMTKLLLDYTW
KYGLDGINVDFENIYFDDRYVLSQFVRELAFVLREQGVITSVDVTKIEPGSWTWSMCYDR
RAFGEAVDYVVLMAYDQNGSWSKKSGSVAQITWVEGSLKGVLEQVAPEKILLGLPFYTVL
WEEQNGKVVKSSVISMKTTQDLIRENNPQLIWDDMSGQYIATYKKGSSTFKIWVEDAASI
RLKASLIDKYGISGVAGWRRGLETPDIWNELNDMLN
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaaaattattgtattgataatatttttgctgttattgactttaatatcatta
aataaatcttatgacacaggtgcatcaggacagcaccacattaggctgtctgaagaatat
catatgaaagatatatctgaccattggtcaagggaacatataaatgaacttgtctatatg
ggaatattaaaaggctataatttaaaggcacagcctgacagcagaataaccagggctgag
tttatcacccttctggtaaatgccatgaatcttgataactacaaagtagacggaaaagag
cattttaaggatgtaaaaaaagacaaatggtactatgttcccattgaaacggcgtacgaa
aacggaatagtaagaggatacggcgacaatacatttcttcctgacaggtttatttccagg
gaagaaatagtgattactgtggtaaatgcccttaaattgccgcaaaaccatttggaatat
tccataagatttaatgatataggtgataactatccttataaatttcacttaaatgcggca
gccggggcaggaataataaccggctatagcgacaatactttcagacctaaaaacaatgct
ttaagatctgaagcggcggttattataaaaaagatgttggagacgcatattgaacctggt
tctgaaactaattctgatgcagaaaaattaaatgaagaaaaagaagatattgtaaattta
gtggatagttatattaaccaatatattaataaaaaaaataatttgaagtccgatatagta
tttaatatagagaattcaacagggaaggcaaaggaagacaacataactaaatcagcaata
atccattattttaaccaaaaaggatatagggttttggaaaatataaaaaacctggatata
caggtggataaaatatccggacgtattgcaaaggcaacagcggtttatgatgtaaattac
aaaaggtttttaaacggttccggaaatttgggggattattcaaaggattataaagggaaa
aaggaatttagtttgataaaagtaaatgacaaatggaaagtgtataatgttaaagagcaa
ttgtttaaagatggcaaaatcaatatggtgtgggaacaaataagtgtaaagactccggat
atgtcaggtgtagagcctatggaaggtttaaacatagtatcccctacatggtttgaacta
agaaatgatgataatgtgctgggggttaaagagtctgaccctgttgtttttagtaacagg
cagggaaaaattcatatggttgacatgggggatatggagtatatgaaatgggcccgtcaa
aacgggtatgatgtttgggggctttttagaaatgaatttgatatagaaattgcaaataag
gttttaaacagcaaagaatcccgtgaaaaaatgacaaagcttctattggactacacctgg
aaatatggattagacgggattaatgttgattttgaaaatatatactttgatgacaggtat
gttttatcccagtttgtaagggagctggcttttgttttgagggagcagggagtgataaca
tcggtggatgttacaaaaattgagccgggaagctggacatggtcaatgtgctatgacaga
agagcatttggggaagcagttgattatgtagttcttatggcatatgaccaaaatggcagc
tggagcaaaaaaagcggttctgttgcccagattacctgggtggaagggtctttaaagggt
gtgttagaacaggtggcaccggagaaaatactcttaggtttgcccttttatacagtactt
tgggaagaacaaaacgggaaggttgtaaaaagctcagttatttcaatgaagacaacacaa
gaccttataagggaaaataacccacagcttatatgggatgatatgagcgggcagtatatt
gccacatataaaaagggcagcagcacatttaaaatatgggttgaagatgcagcctcaatc
aggcttaaggcttctttgattgataaatacggcatttcaggtgtggccggctggaggcgg
ggtcttgaaacacctgacatctggaatgaattgaatgacatgttaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system