Herbinix luporum: SD1D_0093
Help
Entry
SD1D_0093 CDS
T04072
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hsd
Herbinix luporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sigma70_r4_2
Sigma70_r2
Sigma70_r4
WG_beta_rep
Sigma70_ECF
DUF134
Phage_antitermQ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUH91655
UniProt:
A0A0K8J2I2
LinkDB
All DBs
Position
I:90243..92552
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MGKVVETYERNYKEEDQKLFRAIINLKEGDQDSFEQVYKLSEKYIYSIIYRIVRDNDKTA
DLMQETYIQIYNKLDTLDNVESFLVWAGRIATNKTLRYIQKYSKEVLLDEEETDFVFENV
RDDKEEFLPEDILLNKEKKEKIYNIINNLSSEQKITIQYYYFHEMSVGEISKIMQCSPGT
VKSRLNYARKQIKQAVIDTEKKEGIKLYSLSGLPLFWLLFREEAAACMVPEVISSSVIKG
IGDTVGIKIVETVGNEIAKVGKKGLKELIHKFFDTTAGKIVSSVAVVSVAGTVAVSQIPK
TLYTTTNTIIDVQKSSNEIQNPEDCHNQYLIDGKYIVLENDKDQRGVYTIKGKEILPSAF
DKIEYNEYTGGLFRVSKDDMWAYYNKSGEIICDKMYDELGPVIDKMFWCYDEESDKYKVY
SVDGYQVSDSSYDYIGEMANGLVVVKRDLKCGLLSIDGTLLFDIKYDDIFLGDGEYIVLN
EELNDAYRRTVLDSSLNVVFTEDYDNKYMPLCFGSGFYNGVVELSGFQNLFTPIYVPTKV
DGTWIFNPIDTDFLPYNFELYPNGYFSYYNDNLEKSVLFNTNGEEIAIADYSSFYYLDNK
FILSDDRKYSLIDEKASVIISDYDMIWSHYKGKYYVCQEGNYYDLYKDDGTILYNDATYH
IASIGSEMFKCESDSETIIVDGVSGKSFVLSPEESIISYFCDGYAIKYTCDDIIKIGEIN
YKYEIIDRKGKVVYTIDIPKEGGLDNPIVLKEGVYSYENEGKCYIKTWK
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaaaggtagtagaaacttatgaaagaaattataaagaagaagaccagaagctgttt
cgggcaattattaatttaaaagagggagatcaagattcttttgagcaagtgtataagtta
tcggaaaagtatatttactccattatatatagaattgtaagggataatgataaaaccgca
gacttaatgcaagagacttatattcaaatatacaataaattagatacattggataatgta
gagtcttttcttgtatgggcgggaaggatagcaaccaataaaactttaagatatatccag
aaatatagtaaagaagtattattagatgaagaagagacggattttgtttttgaaaatgta
agggatgataaagaagaattcctgccggaagatattttattaaataaagaaaagaaagaa
aaaatatataatattataaataatttgtccagtgaacaaaagataactattcaatattat
tattttcatgaaatgtcagtgggcgaaatttctaagataatgcaatgttcccctggtaca
gtaaaatccagattgaattatgcaagaaaacaaattaagcaagccgttatagatactgag
aaaaaagaaggaattaagttatatagtctatcagggttaccactgttttggttattattc
cgtgaagaggctgcagcttgcatggtgccagaagtaatatcctctagtgtaataaaagga
ataggagatactgtaggtataaaaatagtagaaacagtgggaaatgaaatagctaaagta
ggtaagaaaggattaaaagaactaatacataagttttttgacactactgccggtaaaatt
gtaagtagtgtggcggtagtatcagtagcagggactgtggcagtaagtcaaataccaaaa
accttatataccacaactaataccataatagatgtacaaaaatcatcaaacgaaatacaa
aaccctgaagattgccacaaccaatatcttattgatggtaagtacatagtattggaaaat
gataaggatcaaagaggggtatatactattaaggggaaagaaatattaccatctgcattt
gataaaatagaatataatgagtataccggaggattatttagggtaagtaaagatgacatg
tgggcttattataataaatccggagaaataatttgtgacaaaatgtatgatgaactaggt
cctgttattgataaaatgttttggtgctacgatgaagaaagtgataaatataaagtttat
tcagtagatggatatcaggtatccgattcttcctatgattatattggtgagatggctaat
ggcctggttgttgttaaaagggatcttaaatgtgggcttttaagtatagacggtacactt
ttatttgatattaagtatgatgatattttcttaggtgatggtgaatacatagttctaaat
gaagaacttaatgatgcatataggcgaactgtacttgatagttctttgaatgtggttttc
acagaagattatgataataaatatatgcccttatgttttggaagtggattttataatggt
gttgttgaattatcaggctttcaaaatctttttacacctatatatgtacctacaaaagta
gatggcacctggatttttaatcccattgatacagattttctaccttataattttgaatta
tatccaaacggctatttttcttattataatgataatttagaaaagagtgtattgtttaat
actaatggagaggaaattgcaattgctgattactcgtcattttactatttagataataaa
ttcattttaagtgatgataggaagtatagtttaatagatgaaaaggctagtgtaattata
tctgattatgatatgatttggagccattataaagggaaatattatgtgtgccaagaagga
aattattatgatttgtataaagatgatggtactattttatataatgacgctacttatcat
atagctagtataggcagcgaaatgtttaaatgtgaatcagatagtgaaacaataatagta
gatggggtgagcggaaaaagttttgttctatctccggaagaaagtattatatcatatttt
tgtgatggctatgccataaagtatacatgtgatgatataataaaaattggcgagattaac
tataaatacgaaataatagatagaaagggaaaggtggtatatactattgatatacctaag
gaaggggggctagataatcctatagtattaaaagagggggtttattcttatgaaaatgag
gggaaatgttacataaaaacctggaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
