Herbinix luporum: SD1D_1027
Help
Entry
SD1D_1027 CDS
T04072
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hsd
Herbinix luporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4901
SLH
PepSY
Flu_PB2_1st
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUH92573
UniProt:
A0A0K8J5F1
LinkDB
All DBs
Position
I:1108981..1111227
Genome browser
AA seq
748 aa
AA seq
DB search
MGRKILSLFLSGILLAGSASTASVSAEVIANEPYVIAMADTKKDEKADKGLEKSIKAVKT
KIDIPKEYTDFNYYYYGSNTYTNNYWTLIWSNQKDYSYIEVSLDKDNNITYYFKYNGYDK
DKSVPSYLKKELLDEAEDFIKQIAPKLYPKLEFVSSNYDGIYNNSYTYVFNRKENGIIFP
DNLVTISVDAHTGEVKSAYLDWLYDANIPSAHSKITKEEAAKLIGENLNMKLTYKTDYYQ
IFEEGKSEIKKKAFLVYEPDIPYISIDAKSGEVYLTKSEWVEKKVDNPSKEAEEKDDVAK
SPAGVLTEEEIAKIKELENLISKEKALEILRSNPYLYIDENLISFTASLSKSYGANDKES
IYVWTLVLRDERPVDNDRDDYRAFAHATVDAKTGKILSFNASLKNNYDYQTGKWLPVKIK
YDREYGQKVFEKFLNGQIKDRFKKTKLVDQGHDYIAYYKEDNAPVYGGYYYRYNRFNEGV
EFSYNSIYGAIDGVSGKIYSYNCNWDDDIIFESPRNAMTDKDAFDHYISKDGFDLKYEVN
VINQYDPDYKAHKAYYDYSEAYEIRLVYRPDIYPYYISPFTGEQLDDRGQVYKGSKTYAY
NDIADTKENREILILADMNIGFEGENFNPDKLITVSEINQLLESLGYYTKDSEDAMDSSK
LITREELAYSFIKRLGLENVAKLSEIYKTGYYDESHISSKYLGAVALAKGLKLFPNQDSN
NFFPKNNISRREAVQLIINFVSVANESR
NT seq
2247 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaagaaaaattttatcattatttctgtccggtatcttactggcaggctccgctagc
acagctagtgtatctgctgaagttatagcaaatgagccatatgtaatagctatggctgat
actaaaaaagatgaaaaggcagataagggattagaaaaatccattaaagctgtcaagaca
aaaattgatattccaaaagagtatacagattttaattactattactatggttctaacact
tatacaaataattattggactttaatctggagtaatcaaaaggattatagttatattgaa
gttagcttggataaggataataatattacttattactttaaatataatggctacgataaa
gacaaaagtgttccttcttatttgaaaaaagagcttttagatgaggcagaggattttata
aagcaaattgctcctaagctttatcctaagttagaatttgtatcttctaattatgatggc
atctataataactcctatacttatgtctttaataggaaagaaaatggaattatattccct
gataatttagtaacaatcagtgttgatgcccatacaggggaagtaaaatctgcctatcta
gattggttatatgatgctaatataccgtcagcccacagcaaaattactaaagaagaagcc
gctaagcttataggtgaaaatcttaatatgaagctaacttataaaacagactattatcaa
atctttgaagagggtaaaagcgaaataaaaaagaaggcatttttagtttatgagcctgat
attccctatatttcaatagacgccaagtcaggtgaagtatacttaactaaatctgaatgg
gtagagaagaaagttgataatcctagtaaagaagctgaagaaaaagatgatgtagcaaaa
tcccctgcaggtgttcttacagaagaagagatagcaaaaattaaagagttagaaaatctt
attagcaaggaaaaagcattagaaatattaagatctaatccatatctttatatagatgaa
aatcttataagctttactgccagcttaagtaaatcctatggggctaatgataaggaaagc
atatatgtatggactctagttttaagggatgagaggcctgtagataatgatagggacgat
tacagggcctttgcccatgcaacagtggatgccaagacaggaaagattttaagctttaat
gccagtcttaagaataattatgactaccagacaggtaaatggcttccggttaaaattaaa
tatgacagggaatatggacaaaaagtttttgagaaattcctaaatggtcaaataaaagac
aggtttaaaaagactaaactggtagatcaaggccatgattatatagcctattataaagag
gataatgcccctgtatatggcggctattactaccggtataatcgttttaatgaaggtgta
gaattttcctacaacagtatttatggggcgatagacggtgtaagcggtaagatttattca
tataactgcaattgggatgatgatatcatctttgaatcacctagaaatgccatgactgat
aaggatgcatttgaccattatatcagtaaggatggatttgatttaaaatatgaagtaaat
gtaattaatcaatatgatcctgattataaggcccataaagcttattatgattattcagag
gcttatgaaatacgtttagtttatcgtcctgatatctatccttattatatttctcctttt
actggagaacaactagatgacaggggccaagtttataaagggtctaaaacctatgcctat
aatgatatagctgatacaaaagaaaatcgagagatacttatacttgcggatatgaatatc
ggttttgaaggtgagaatttcaatcctgataaattaattaccgtaagtgaaataaatcaa
cttttagaaagtcttggttactatacaaaggacagtgaagatgccatggattcttctaag
ttaattaccagggaagaattggcttatagttttattaaaagacttggtcttgaaaatgtg
gctaaattatcagaaatatataaaaccggctattacgatgaaagccatataagttctaaa
tatcttggggcagtggcactggctaagggcttaaaactgtttccaaaccaggatagtaat
aatttctttccaaagaataatataagcagaagggaagccgtacaactgattataaacttt
gttagcgtagctaatgaaagtagatag
DBGET
integrated database retrieval system