Herbinix luporum: SD1D_2018
Help
Entry
SD1D_2018 CDS
T04072
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hsd
Herbinix luporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUH93554
UniProt:
A0A0K8J7Y9
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2177843..2180389)
Genome browser
AA seq
848 aa
AA seq
DB search
MKTKFFKKLSFVLVVAMVLSVFYPAAGAFAAAKKPTLNSTNKYLHLGVEGKNKFNFNINN
KQSGWKYYWESADEDIAVVNSKNGVTRATGVGKTTVTVTITDKNKEVVTKLYAKVTVRDN
IKTVKITNIPEGNKLAVGQENDFNRSFVTVSGSTKETSAITRWTVDSDKANISEKGVFVA
NEAGEYTITARSFQSNAKYEDWKKDADTYAKYVLAEDTVKITVAPSIVEVSQVDLETVDV
VFDSAMADADKNISVYELIGKAEVKQLVKKVTMSDDKKTATVQLYVPFKAGATYVVKYTD
LEPESFVAATTNEEDVAKIDITTSTVVYNEATKVEFKLYNANGVDITTDKLANRVTMKSS
EGAGTYFNTDTNELTIFGKNASTTITATYHTYKYDSEGNEVGVVEDEAIIIGVDKDATNI
TGLKAWTIETIDESTTEPTFKDVNQVLALNDNNVRLFVQFNTKTGSKEATINSFAEEGMF
DFTSSDKNILIVDNKGNLFPVKEGNVVVVVSYGEGDSKTPIGAISITVHPERTVGVLSLS
NTNVVLSNNPDVDDKAEVKISVKDQLGTKMEKDDFTYSVEKMSGSPADDLTDEKSNATGD
TIEFSAKDMAVGTYYYKVTVGKKAAVVTVKVLDGKTDTNVAYYKLQLEDTFVDLKVKEGE
INKTLGIELFGYNSNGVKVSRGVLNSGSDYILKIDSPEDKWDENNFDSSENKFTLVKVGE
GGAIEKAPKGSYKVTAFDNKEVVLDIVQFSVDDTQVAPVLAEVKNRLFEQNGVNPSNKED
TNLIAAVKECFKFTLNGKDVTDNIVEVVAVGTADEFNVRTVTIKETIDEASGAFINHEVK
VGLTITKK
NT seq
2547 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaccaaattcttcaagaagttgtctttcgtgcttgtagtagcgatggtactttca
gtattctatcctgctgcaggagcattcgctgctgctaagaagcctactcttaactctact
aacaagtacttacatcttggtgtagaaggcaaaaacaagttcaacttcaacattaacaac
aaacaaagtggttggaaatactattgggaatctgctgacgaagatattgcagtagttaac
tccaagaacggtgttactagagcaactggcgttggtaaaacaacagtaactgttacaatc
acagataagaacaaggaagttgttactaaactttacgcaaaagtaacagtaagagataac
atcaaaactgttaaaatcacaaacattcctgagggcaacaaacttgcagttggccaagag
aatgactttaacagaagctttgtaactgtatctggaagcacaaaggagacatccgctatc
acaagatggacagtagactctgataaggctaatatcagtgaaaagggtgtattcgtagct
aacgaagctggtgagtatacaatcactgctcgttcattccagtccaacgctaaatatgaa
gattggaaaaaagacgctgacacatatgctaaatatgtattagcagaagataccgtaaag
atcactgttgctccttctattgtagaagttagtcaggtagatcttgaaactgttgacgta
gtatttgattctgctatggcagatgctgacaagaatatatcagtatacgagttaattggt
aaagcagaagttaaacagcttgttaaaaaggttaccatgagtgatgataaaaagacagct
actgttcaattatatgttcctttcaaagctggtgctacttatgtagttaagtatactgat
ttagagcctgaaagcttcgttgctgctacaacaaatgaagaagatgtagctaagatagat
attaccacttctacagttgtatataacgaggctactaaggtagagtttaagttatacaac
gctaatggtgttgatattacaacagataaattagcaaatagagtaaccatgaagtcttct
gaaggcgctggtacttactttaatactgatactaatgagttaactatatttggcaaaaat
gcttcaacaactattactgctacttatcatacttataagtatgactctgaaggtaatgaa
gttggtgtagtagaagatgaagcaattatcataggtgttgataaagatgcaacaaatatt
actggattaaaagcttggaccattgagaccattgatgagtctacaacagaacctactttt
aaggatgtaaatcaggttcttgctcttaatgacaataatgttagactgttcgtacagttt
aatacaaagactggttcaaaagaagctactattaatagctttgctgaagaaggaatgttc
gatttcacatcctctgataagaatattttaattgttgataataagggtaatttattccct
gttaaggaaggtaatgttgtagtagttgtatcctatggtgaaggtgattcaaaaactcct
atcggtgcaatttctataactgtacatcctgagagaactgtaggtgttttatctttaagc
aataccaatgttgtattatctaacaatccagacgttgacgacaaggcagaagtgaaaatt
tctgttaaagatcaactaggaactaagatggaaaaagacgactttacatattcagttgaa
aagatgagtggaagtcctgctgatgatttaacagatgaaaaatctaacgctacaggtgac
acaattgaattttcagctaaagacatggcagtaggaacttattattacaaagttactgtt
ggtaagaaggcagctgttgttacagtaaaagttctagatggtaaaacagatacaaatgtt
gcttactacaaacttcagttagaagatacatttgttgatcttaaagttaaagaaggtgaa
atcaacaaaactcttggaatcgaattattcggttataacagcaatggtgttaaagtatca
agaggggtattgaacagtggttctgattacattcttaagattgattcacctgaagacaaa
tgggatgaaaacaactttgattctagtgaaaacaaatttaccttagtaaaagttggagaa
ggaggagctatagagaaggctcctaaaggtagctataaagttactgcttttgataataaa
gaagttgttttagatattgtacagtttagtgtagacgatactcaagttgctccagtatta
gctgaagttaagaatcgtttatttgaacagaacggagttaatccaagtaacaaagaagat
acgaatttgatcgcagctgttaaggaatgcttcaagttcacattaaatggaaaagacgtt
actgacaatattgtcgaagttgtcgcagtaggtactgctgatgagtttaacgtaagaact
gtaactatcaaagaaactattgatgaggcttctggtgcttttataaatcacgaagtaaaa
gttggtttaaccatcactaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system