Herbinix luporum: SD1D_2228
Help
Entry
SD1D_2228 CDS
T04072
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hsd
Herbinix luporum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NPCBM_assoc
DUF4832
CARDB
TRAP_beta
DUF11
DUF7507
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CUH93743
UniProt:
A0A0K8J902
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2392026..2394479)
Genome browser
AA seq
817 aa
AA seq
DB search
MKKNTKRFVTCFLSALLLLTFVLANSKPAAAQEVHVINPDPEIIVLVPGETTKVKVPIRA
VGSYISSPIILADATGTPYTVSQPVLRTNGIDVPMNIIYEFLDQYVEFDVTVAETAKIGN
YPIKLNIYGTSPGDEKVTTELVVNTQILQEKEPAQLTVNKVTYDNTTIGKNMNLSFTVKN
EGEITARNVYVSIDYGESGMVAGYSTKKIKVEDVASKKEVPINLPIRILPTASPGMNTIT
VNLTYKSEEGENITDSQDIYISLKANDSSPNLVLGKFNYTNKAKPGEKLGLVLEIKNDGA
NTAYRPRLSVDESSIGTENFIKNYYTDYIELKNIKSNNTIKVEVPLTISKEAKGGLKELK
LNLVYFDQQGVEYKAPVTIYPFIEAEGISQDGTPVIVVKNVKQSPSKPVAGGRLEVSFDM
ENKSSIGLSDLKIGLQDLSGDTFIPVESDPYKYIGELKAGATKRITIPLKLSENIQEGLN
TLTIGYSYAGGSDKVDIPVLNVENDLGSASKPRLIVSDYNADIEVIKAGSVFNFNFEVRN
THSSVAAKNIIISVSGKSPQDQSEIFTVTQGSNSFFVSKIGPGETVSNTLELKAKSDAAT
FAYPLTVSIEYEYDGIEPNPTTGQIGEKEEHELTLQVVENARPVVDYVQVYSYDGQVVMG
NPATVYFDFFNMGKSTLNNVIATIEGDFTSTSGNMYFIGNVNAGESSSAEFEVIPNIEGM
AQGIVKITYEDSNGDEQVYTKEFETTVMGEMTWDPGFDEGSDVFNPMIPEPKKAILPTWA
FILIQVAIFAIFVPVTRKVIISLYKSRLLKKEEEMYQ
NT seq
2454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaaaatacaaaaaggttcgtaacatgttttttatcggccttgctattactgact
tttgttttagctaatagcaagccggcagctgcacaggaagttcatgtaattaatcctgat
ccggagattattgtactggtacccggtgagacaaccaaggtaaaagtgcccattagagcg
gtaggttcttatataagttcaccgattattttagccgatgccactggtaccccatatacc
gtatcacagccggtacttcgaacaaacggaatagatgtaccgatgaatataatttatgaa
ttcctagaccagtatgtagagtttgatgttaccgttgcagagaccgctaagataggaaat
tatcctattaagctgaatatttacggtacttcaccgggagatgaaaaagttacgacagag
cttgttgtaaatacacagatacttcaggaaaaggaaccggcccagttaacggttaataaa
gtaacttatgataatacaacaatcggaaagaatatgaatttatcctttacagtaaaaaac
gagggtgaaattacagcaagaaatgtgtatgtaagtatagattatggcgagtcaggtatg
gtagccggctattccactaaaaaaattaaggtggaggatgtggccagcaaaaaggaagtg
ccgataaatcttcctattcgtattttgcccacggcaagccccggtatgaatactataact
gtaaatctaacatacaaatcggaggaaggggagaatataaccgacagtcaagatatttat
ataagtttaaaggcaaacgacagtagccctaaccttgttttgggtaaatttaattatacc
aataaagccaaacccggtgaaaagctaggattggttttagaaataaaaaatgacggtgcc
aatacagcttacagaccccgtctttctgtggatgaatccagtattggaacagagaatttt
attaaaaattattatacagattacatagaattaaaaaatataaaatctaataacactatt
aaagtggaagttccccttactatttcaaaggaggcaaaagggggattaaaggaattaaag
cttaatctggtttattttgaccaacaaggggtggaatataaggctcccgtaaccatatat
ccctttatcgaagcagagggtataagccaagacggaaccccagttatagtggtaaagaat
gttaagcaaagtcccagtaagcctgtggccgggggaaggctggaagtttcctttgatatg
gagaataaaagttccatcggtttaagtgaccttaaaattggattacaagatctgtccggt
gatacatttattccggttgaatctgacccttacaaatatatcggtgagcttaaggccgga
gcaactaagagaataactatcccccttaagttatcggagaacattcaagagggtttaaat
acccttaccataggatacagctatgcagggggtagtgataaagtagatattccggtacta
aatgtagaaaatgatttgggtagtgccagcaagccaaggctgattgtaagtgattacaat
gctgatattgaagtgattaaagccggttctgtatttaatttcaattttgaagtaagaaat
acccattcttcagtggcggctaagaatattattatatcagtcagcggtaaatcaccacaa
gatcagtcagagatatttactgttactcaaggaagcaatagcttttttgtcagtaaaata
ggaccgggagaaacagtatctaataccttggagctgaaggctaaatcggatgcggcaact
tttgcttatcccttaacagtatcaatcgaatacgaatatgacggaattgagcctaatcct
actaccggtcaaatcggagaaaaagaggaacatgaattaaccttacaggttgttgaaaat
gccagacctgtagttgattatgtacaggtatattcatatgacggtcaagtagtaatggga
aatcccgcaactgtatattttgatttctttaatatgggaaaatccaccttgaacaatgta
atagcaactatagaaggtgactttacaagtaccagcggtaatatgtactttataggaaat
gttaatgccggtgaaagttcatctgccgagtttgaagtaataccaaatatagaaggtatg
gcacagggaattgttaagattacatatgaagacagcaatggggatgaacaagtttataca
aaggaatttgagactacggttatgggtgaaatgacctgggatccgggatttgatgaggga
agtgacgtatttaatcctatgatacccgagcctaagaaagctatccttcccacatgggcc
tttatcttaatacaggttgccatatttgcaatatttgtacctgtgaccagaaaggttatt
attagcttatataagagcagacttctaaaaaaggaagaggaaatgtatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system