KEGG   Candidatus Hepatoplasma scabrum: HPPSJP_4040
Entry
HPPSJP_4040       CDS       T09843                                 
Symbol
parC
Name
(GenBank) DNA topoisomerase 4 subunit A
  KO
K02621  topoisomerase IV subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
hsg  Candidatus Hepatoplasma scabrum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hsg00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:hsg03032]
    HPPSJP_4040 (parC)
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:hsg03036]
    HPPSJP_4040 (parC)
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:hsg02048]
    HPPSJP_4040 (parC)
Enzymes [BR:hsg01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     HPPSJP_4040 (parC)
DNA replication proteins [BR:hsg03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   HPPSJP_4040 (parC)
Chromosome and associated proteins [BR:hsg03036]
 Prokaryotic type
  Chromosome partitioning proteins
   Other chromosome partitioning proteins
    HPPSJP_4040 (parC)
Prokaryotic defense system [BR:hsg02048]
 Toxin-antitoxin system (TA system)
  Type II TA system
   Type II TA system related factors
    HPPSJP_4040 (parC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C WH1
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDV03683
LinkDB
Position
complement(446860..449400)
AA seq 846 aa
MKNKHSSFKNEKIIIKNLDKLIGEKFGDYSKYIIQERALPDLRDGLKPVQRRILFAMNQL
KLNYDTNYKKSARIVGDVIGKYHPHGDTSVYDALIRMSQGWKSSIPLIDMHGNNGSIDGD
SAAAMRYTEARLSKISFFLMQDIEKKIVPFTNNFDDSELEPVILPAKIPNLLINGAIGIA
SGYSTNIPPHNFTEVINALIYALKNENFSVSDLRRIIHGPDFPTGGIIESKLGIKEAYHT
GKGKIVIKANVISDQNNNQIIIDQIPFEVNKADLVRKIDEFIIQDKIPGLISIRDDTDRN
GLQMTLSTRKNVNHDAIINFLFKNTDLRKNYYINMIVIKDKKPQLVTLVNIIDDFKEFQF
LIYQNLFKYELDKYQKRLLVIKALIQISSDIDMIIDIIKSSLNKSEAKLNLIKKYKFNDY
QAEAIVNLRLYRLTATDIGRLIDEHKSLLNLINHYQKGLKDKKYLAAIIITDLNKIKEQF
KIKRRSLIKDKIEEISISEKELVIEDFFYLCLTKKGYIKLVSTKSKSSSNVEHFTFLDGD
IPISKEIKVSNLNNLFLFTSKGKFYRIPIYKLNQHKYKDIGDHLSKYISITTNETIISFT
LTKKNIDNLNLNFVIATKRGVIKQTKFSNLNFNVSKAGQKFIKLEDDDSVVAINFVKTNQ
KYVVITFTENGYYLQYNLDKIPTTNFNSIGVKNIKLLPFDYVLNNFVILQKDFSEGKSKF
LIFTKLGKGKRIRAKDLKEGKRNLRGNLILRQVKAYEDKLIGVYQTDFEEKVNIMYSNNK
IKLFENPNEIILSDLISGFSKFSNKKIKLIQNDLYINFKQFLKEEILKSRSKVEKLDIEE
ILKLKI
NT seq 2541 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaataaacattcatcatttaaaaatgaaaaaattattattaaaaatttggataaa
ttaattggtgaaaaatttggtgattattctaaatatattattcaagagcgagctcttcct
gatttaagagatggtttaaaaccggttcaacgaagaattctttttgcaatgaatcaattg
aaattaaactatgatacaaactataagaaatcagcaagaattgtcggtgatgtaattgga
aaatatcatccccatggcgatacttcagtttatgatgcattgataagaatgtctcaagga
tgaaaatcatcaatccccttgattgatatgcatggtaataatggatcgattgatggtgat
tcagcggctgcaatgcgatatacagaagcaagactttctaaaattagttttttcttaatg
caagatatcgaaaaaaaaatagttccttttaccaataatttcgatgattctgaattagag
ccggtaattttaccggctaaaattcctaatcttttaataaatggcgcaattggaattgct
tcaggatattcaacaaatatccctcctcataattttaccgaagtgataaacgctttgatt
tatgctcttaaaaatgaaaatttttctgtttctgacttaagaagaataattcatggacct
gattttccaaccggtggaattattgaatcaaaattaggaattaaggaagcttaccatact
ggaaaaggtaaaatcgtaattaaagcaaatgttatttcagatcaaaataataatcagata
ataatcgatcaaattccttttgaggtaaataaagccgatcttgttcgtaaaattgatgaa
tttattattcaagataaaattccaggattaatttcaattcgtgatgataccgatcgtaat
ggattacagatgactttatcgacaaggaaaaatgtaaatcatgatgcgataattaatttt
ctttttaaaaatacagatttaagaaaaaattattacatcaatatgatcgtaataaaggat
aaaaaaccacaattagttacattggttaatataattgatgattttaaagaatttcaattt
ttaatttatcaaaatttatttaaatatgaattagataagtatcaaaaaagactattagtt
attaaagctttaattcaaataagttctgatatcgatatgattattgatattattaaaagt
tcattgaataaaagtgaagctaaattaaatttaattaaaaaatataaatttaatgattat
caagcagaagctattgttaatctgcgtttatatcgattgacagcaacagatattggtaga
ttaattgatgaacataaatcattattaaatctgataaatcattatcaaaagggattaaaa
gataaaaaatatcttgctgcaattattattacagatttaaataaaattaaagagcaattt
aagattaaacgaagaagtttgataaaagataaaattgaagaaatttcaattagcgaaaag
gaattagtaattgaggattttttctatctttgccttactaaaaaaggatatataaaactt
gtaagtactaaatcaaagagtagttcaaatgttgaacattttacctttttagatggtgat
attccgatttcaaaagaaattaaagtttccaatttaaataatctttttttatttacttca
aaagggaaattttatcgaataccaatttataaattaaatcaacataaatataaagatatc
ggtgatcatctttcaaagtatatttcaatcacaacaaatgagacaattatttcctttact
cttactaaaaaaaatatcgataatctaaatttaaattttgtgatcgcaaccaaaagaggg
gtaattaagcaaacaaaattttctaatttaaattttaatgtttctaaagcaggacaaaaa
tttattaaattagaagatgatgattctgttgtggcgattaattttgttaaaaccaatcaa
aaatatgttgtaataacatttacggaaaatggttattatttacaatataatttagataaa
attccaacaacaaattttaatagtatcggtgttaaaaatattaaattactaccatttgat
tatgttcttaataattttgtcattttgcaaaaagatttttcagaaggaaagagtaagttt
ttaatttttacaaaattgggaaaaggtaaaaggattagggcaaaagatcttaaagaaggt
aagagaaatttgagaggtaatttaattttgaggcaagttaaggcatatgaagataaattg
attggcgtttatcaaacagattttgaagaaaaagttaatattatgtatagcaataataaa
attaaactttttgaaaatccaaatgaaattatactatctgatcttataagtggtttttct
aaatttagtaataagaagataaagttaattcaaaatgatctttatataaattttaaacag
tttttaaaagaagagattttgaaaagtagaagtaaagttgaaaaattagatattgaagaa
attttgaagctaaaaatttaa

DBGET integrated database retrieval system