Candidatus Hepatoplasma scabrum: HPPSJP_4380
Help
Entry
HPPSJP_4380 CDS
T09843
Symbol
smc
Name
(GenBank) chromosome partition protein Smc
KO
K03529
chromosome segregation protein
Organism
hsg
Candidatus Hepatoplasma scabrum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
hsg03036
]
HPPSJP_4380 (smc)
Chromosome and associated proteins [BR:
hsg03036
]
Prokaryotic type
Chromosome partitioning proteins
Condensin-like complex
HPPSJP_4380 (smc)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SMC_N
SMC_hinge
AAA_23
AAA_21
AAA_29
AAA_15
ABC_tran
Erf4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDV03717
LinkDB
All DBs
Position
complement(478092..480935)
Genome browser
AA seq
947 aa
AA seq
DB search
MFLKKIELKGFKSFAFPTVVEFKKGLTVIVGPNGSGKSNINDALKWVLGESSKKTLRAKK
TDDMIFSGSLNKEAAEFAEVSLFFDNDNKILEHEANEVIITRKSYRNKNENEYFINKEKV
RRKDVRNLFLDTGLGNTDLSIISQGSVAKIAEARAQDLRALLDEASGVSKYQLHKKEALL
KFEKVKTNLEIFEVKLAELKKQIAPLKKASEQAKNYLQIKEQLAKIELPLIQNILNDDYK
EQEELSQFKLKSDDEKVLIEKNLDKLARELKKDQIDLLKLDQEITELHAKQNNLQNNLNK
AINFKGDKKEFASKIKYSLFAVNDLKEIIKTAEQEEENLNKEIISFKKEMSNLEEQTKDY
SNKLNQIKFQIEYLKKSDKNYNQAVKIILDNKLIFNFIYGTVKDLIKVDKEYQLALEAAI
TNKFQNLIVNNEKTIKEAIAFLKNNKSGVATFIPAENVKGKLLNNELKNVVLKINGFVAI
LSDVIKADQKFKNVISSLTGNIVIFNDLDSALMAAKFIQYRLTIVTLDGDIIYPGFTVKG
GYNNKVKTKNELAKYQLGKEKLEKIIKVNQIKIDNLETNILDFNAKKELIQREIIRSGER
LNHLDHEFMQLLEGYQTTFNEEFNLNQLEQKTKIEKPLSLEKIINQIKNLNAKKHQLSLK
IIGAQDEQQLQNKKWQELLEKVQHAEIRLDKLEREINDNIDILNKDYQLTYDNLKQKKFV
KTKEKLEEIIAKQQQYRSELKAIGYIDQDSIERYQKLEKDYQKLNYEVTDLTEAKNKLIS
TIEIMDQEMIKRIGNTFTKINDRFDAIFKTLFRGGHAKLQFLEPDNLLESGLEIKASAPG
KAVKNLSLYSGGEKSLIAISLIFAINEIRKLPLLLLDEVEAALDEANVERFASFAKILNN
QTQLIIVSHRPGTMEKADILYGVTMQEKGVTSIFNVNLDQIKEEFIN
NT seq
2844 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttaaaaaaaattgagcttaaaggttttaagtcatttgcttttccaacagttgtc
gaatttaaaaagggacttacggtgattgtcggtccaaatggttcaggaaaatcaaatata
aatgacgctttaaagtgagttttgggcgagagctcaaaaaagactttgcgtgctaaaaaa
actgatgatatgatctttagtggttcacttaataaagaagcggctgaatttgcagaggtc
agtcttttttttgataacgataataaaattttagaacatgaggcaaatgaggtaataatt
acaagaaagtcttatcgtaataaaaatgaaaatgaatattttattaataaagaaaaagta
agaagaaaagatgttcgtaatctttttttagatactggattaggtaataccgatctttcg
attatttcacaaggttcggttgctaaaattgcagaagcaagagcgcaagatttacgagca
cttttagatgaagcttcaggagttagcaaatatcaactccataaaaaagaagcgctttta
aaatttgaaaaagtaaagacaaatttagaaatttttgaggtaaaattagcagaattaaaa
aaacaaattgcccctttaaaaaaggcgagtgaacaagccaaaaattatttacaaataaaa
gagcaattagcaaagattgaattaccacttattcaaaatattttaaatgatgattataaa
gaacaagaagaattaagtcaattcaaattaaaaagtgatgatgaaaaggttttaattgaa
aaaaatttagataaattagcaagagaactaaaaaaagatcaaatagatcttttaaaatta
gaccaagaaatcacagaattacatgcaaagcagaataatttacaaaataatttaaataaa
gcaattaatttcaagggtgataaaaaagaatttgctagcaaaattaaatattcgcttttt
gcagtaaatgatttaaaagaaattatcaaaacagcagaacaagaagaagaaaatttaaat
aaggaaataatttcttttaaaaaggaaatgtctaatttagaagagcaaaccaaagattat
agtaataaattgaatcaaataaaatttcagatcgaatatttaaaaaaaagcgataaaaat
tataatcaagccgtaaaaataattttagataataaattaatttttaattttatctatgga
acggtaaaagatcttattaaagttgataaagaatatcaattggcacttgaggcagcaatt
actaataaatttcaaaatttaattgtaaataatgaaaaaacaatcaaagaggcgattgct
tttttaaaaaataataaaagtggagttgcaacatttatccctgctgaaaatgtaaaagga
aaactattaaacaatgaattaaaaaatgttgttttaaaaattaatggttttgttgcaatt
ttaagcgatgtaataaaagctgatcaaaaatttaaaaatgtcatttcttcccttacagga
aatattgttatttttaacgatttagattcagctttaatggctgcaaaatttattcaatat
cgtttaacgatagtaaccttagatggtgatattatctatccaggttttacggtaaagggc
ggatataataataaagttaaaacaaaaaatgaattagcaaaatatcaattgggaaaagaa
aaattagaaaaaattatcaaagtaaatcaaataaaaattgataatctagagacaaatatt
ttagattttaatgccaaaaaagagttaattcaacgagaaattatccgtagtggtgaaaga
ttgaatcatttagatcatgaatttatgcaattattagaaggttatcaaactacgtttaat
gaagaatttaatttaaatcaattagagcaaaaaacaaaaattgaaaagcctttatcactt
gagaaaattatcaatcaaattaaaaatcttaatgctaaaaaacatcaattgtcacttaaa
ataattggtgcgcaagatgagcaacagttacaaaataaaaaatgacaagagcttttagag
aaagtgcaacatgcggaaattagattagataaattagaacgagaaattaatgataatatt
gatattttaaacaaagattatcaattaacatatgataatttaaaacaaaagaaatttgta
aagacaaaagagaaattagaagagataatagcaaaacaacaacaatatcgaagtgaatta
aaagcgattggttatatcgatcaagattcaattgaaagatatcaaaaattagaaaaagat
tatcaaaaattaaattatgaagtgactgatttaacagaggcaaagaataaattaatttct
acgattgaaattatggatcaagaaatgattaaacgaatcggaaatacttttacaaaaata
aatgatcgttttgatgctatttttaaaactttatttagaggtggacatgctaaattacaa
tttttagaaccagataatttattagaatcaggacttgaaataaaagcctccgctcctggg
aaagcggtgaaaaatctttctctttattcaggtggtgaaaaatcattgatcgcaatctca
ttaatttttgccatcaatgagattagaaaattaccacttttattattagatgaagtagaa
gcggcccttgatgaagcaaatgtggaaagatttgcttcatttgctaaaattttaaataat
caaacacaattaattattgtctctcatcgtccaggaacaatggaaaaagcagatattctt
tatggtgttacgatgcaagaaaaaggagttacaagtatttttaatgttaatttagatcaa
attaaagaagaatttatcaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
