Candidatus Hepatoplasma scabrum: HPPSJP_4540
Help
Entry
HPPSJP_4540 CDS
T09843
Symbol
rpoC
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta'
KO
K03046
DNA-directed RNA polymerase subunit beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
hsg
Candidatus Hepatoplasma scabrum
Pathway
hsg03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsg00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
HPPSJP_4540 (rpoC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
hsg03021
]
HPPSJP_4540 (rpoC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
hsg03400
]
HPPSJP_4540 (rpoC)
Enzymes [BR:
hsg01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
HPPSJP_4540 (rpoC)
Transcription machinery [BR:
hsg03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
HPPSJP_4540 (rpoC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
hsg03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
HPPSJP_4540 (rpoC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
DUF2180
ATG17_like
RUBY_RBDX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDV03733
LinkDB
All DBs
Position
complement(498112..502089)
Genome browser
AA seq
1325 aa
AA seq
DB search
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3978 nt
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+upstream
nt +downstream
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DBGET
integrated database retrieval system
