Candidatus Hepatoplasma scabrum: HPPSJP_5240
Help
Entry
HPPSJP_5240 CDS
T09843
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hsg
Candidatus Hepatoplasma scabrum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
MTES_1575
AAA_19
AAA_30
DEAD
Viral_helicase1
nSTAND_NTPase5
NAT10_TcmA_helicase
AAA_22
IstB_IS21
FtsK_SpoIIIE
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDV03803
LinkDB
All DBs
Position
complement(580441..584505)
Genome browser
AA seq
1354 aa
AA seq
DB search
MKHKEENNLQKIKISEKFKQELENFQKKLTNLNKRNRNIWTSKSTNYNFSISNLQEESLL
KLNSFLKKDIKNLKVDLKLNIIENKENFIKNFNLFYIKNKEKIYCRKIRKKISSKKTDQE
KNFLIFNNIEKENQKIKNEIGYQTFYFVPYYFLTNFTNINKTIPIRSPIFFVPIILIFDN
NLHKVRMYYDNTRDVIVNNFIIENFLKNKDYYFDYEKSFLSNIKNLFVNFKRNKKEIITY
LESYSDNLDQFKDYSNIEKFNFLFKIEKSFTIGFFDKYDNAVKRDLNLILEKGYFTKQLE
RYSLVNKKNSQKNSQFLFDNHIEKNAYNLDEKGLFYIDNLNNQQFFALKKINENKTNNLV
IWGPPGTGKSQTILSIIYDAILKNKKIALVSEKRAALDVIYQRLNNLNKFAFYLTDMNNK
GDFYQQINQSYEAAKKILETEKFEFINDKKFQEEINKIDNLSDQIVEYLKNMDSIDFYKD
IEFFENKKIYELIEEFYFKFKNFNEFLKESIYDEKINSFILNEGNKNNNFSIFLNKIKEL
FENNLLSKIEQMIKLRDEIANIYGLDFIKKNDGDISDYFNFLINGKKEELKKEKKTISLL
WKDLLQNWNEKKYKDIYEYLRNDRLSSFLIDYPIDRFEQLFKICDDLIYLSVFTPFLVDY
INLVIKNNFVFNIFSNYLKKENIEEKYLNLKNNFFLLKKKFLNSKRKYDRKFAGLKRDLQ
VNQDMTEMITFLQNCLLNLKNYHQTKTKIEDLYNKIFFDNLKNQEKLITKYKKEEQNVTL
KFNKFQIIKNFSEEEFSFLKDFINYIKSQKIKFDKLLQIIEFKIFRERLNKYKYIFKLRD
QIFDWKNNYDKFINLRQTKIKKFSEITKYYLAKQFLINFENSSPQFKRIVFDPKKKWGIK
MFLKTEKDTFKNLYKIWLLNPETISSIFDLKDKFDLVIFDEASQMFIERSLPAIERSKKV
VILGDEKQLAPTNFFVSRNIDQEFEKFEEKNLIDDKLSLLNYAKTKFPHIMLKYHYRSDF
KELIEYSNNIFYNDNLIFISKNGKNKNFQPIEYFELKDSIYKNGLNHNEIDKIIEILYQI
KNNLNLNKKSIGIITMNSKQEKYLSEKLASISYNDFNFSNWINSDDVNLFVKNIENVQGD
ERDIIIFSTLYGRNEEGKISFNFGPINKFGGVNRINVAVTRAKLKMYVITSIRQNDFENF
FIRNQAHKDNLESGIYILYRFLKHCIKSYNNKKIINQNQFSIKNFNSKFEKDLYQELIKI
AKRYNLYVINRDKTYGYKADFLFYDENHKIILLIESDQAIKNSYKSVRERDISKQDFLKE
RGYNFYRIWISNWFNNQKMELNNIEKIIKNTINL
NT seq
4065 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagcataaagaagaaaataatttgcaaaaaataaagatatcagaaaaatttaaacag
gaattagaaaattttcaaaaaaagctaacaaatttaaataagagaaatcgcaatatttga
acatcgaaaagtactaattataatttttcaatttccaatttacaagaagaatcattatta
aaattaaatagctttttaaaaaaagatattaagaatttaaaagttgatttaaaattgaat
attattgaaaataaggaaaattttattaaaaattttaatttattttatataaaaaataaa
gaaaaaatatattgtagaaaaattagaaaaaaaatttctagtaaaaaaacagatcaagaa
aaaaattttttaatttttaataatattgaaaaagaaaatcaaaaaattaaaaatgaaatc
ggttatcaaaccttttattttgtcccttattattttcttacaaattttacaaatataaat
aagacaattcctattagatcaccaattttttttgttccgataattttaatatttgataat
aatttacataaagtaagaatgtattatgataatacaagagatgttatagttaacaatttt
ataattgaaaattttttaaaaaataaagattattattttgattatgaaaaatcattttta
tcaaatattaaaaatttatttgttaattttaaaagaaataaaaaagaaattattacctat
cttgaatcttattctgataatttagatcaatttaaagattatagtaacattgaaaaattt
aattttctttttaagatagaaaaaagttttacaatcggtttttttgataagtatgataat
gctgtaaaaagagatctaaatttaattttagaaaaaggatattttacaaaacaactagaa
agatatagtttagtaaataaaaaaaattcacaaaaaaattctcaatttttgtttgataat
catattgaaaaaaatgcatataatcttgatgaaaaaggattattttatattgataattta
aataatcaacagttttttgctttaaaaaaaataaatgaaaataagactaataatttagtt
atttgaggacctcctggaacaggaaaatcacaaacaattttatcaatcatctatgatgct
attttaaaaaataaaaaaattgctttagtttcagaaaaaagagctgcgcttgatgttatt
tatcaaagattgaataatttaaataaatttgcgttttatcttacagatatgaataataaa
ggtgatttttatcaacagataaatcaatcttatgaagcggcaaaaaaaatattagaaaca
gaaaaatttgaatttattaatgataaaaaatttcaagaagaaattaataagattgacaat
ttatcagatcaaattgtagagtatttaaaaaatatggattcaattgatttttataaagat
attgaattttttgaaaataaaaaaatatatgaattaattgaggagttttattttaaattt
aaaaattttaatgaatttttaaaagagagtatttatgatgaaaaaatcaactcttttatt
ttaaatgaaggaaataaaaataataatttttctatttttttaaataaaataaaagaatta
tttgaaaataatttattatcgaaaattgaacaaatgatcaaattaagagatgaaatagct
aatatttatggtttggattttattaaaaaaaacgatggtgatatttctgattattttaat
tttttgattaatggaaaaaaagaagaattaaaaaaagaaaaaaagacgatatctttatta
tgaaaagatttattacaaaattgaaatgaaaaaaaatataaagatatttatgaatatctt
agaaatgatcgtttaagctcatttctaattgattatccaattgatcgatttgaacaatta
tttaagatttgtgatgatttaatatatctttcagtttttacaccatttttagttgattat
attaatttggtaattaaaaataattttgtttttaatatattttcaaattatttgaaaaag
gaaaatattgaagaaaaatatttaaatttaaaaaacaattttttccttttaaagaaaaaa
tttttaaatagcaaaagaaaatatgatcgaaaattcgccggtttaaaaagagatttacaa
gtaaatcaagatatgacagaaatgattacatttttgcaaaattgtcttttaaatttaaaa
aattatcatcaaactaaaactaaaatagaagatttatataataagattttttttgataat
ttaaaaaatcaggaaaaattaattacaaaatataaaaaagaagagcaaaatgtaactttg
aaatttaacaaatttcaaataataaaaaatttttctgaagaagaattttcatttctaaaa
gattttattaactatataaaaagtcagaaaataaaatttgataaacttttgcaaataata
gaatttaaaatttttcgagaaagacttaataaatataaatatatatttaaattaagagat
caaatatttgattgaaaaaataattatgataaatttataaatttaagacaaacaaaaatt
aaaaaattctcggaaataacaaagtattatttagcaaagcaatttttaataaattttgaa
aattcatcgccccaatttaaaagaatagtttttgatccgaaaaaaaaatgaggtatcaaa
atgtttttaaaaactgaaaaagatacctttaagaatttatataaaatttgattattaaat
cctgagacaatttcaagtatttttgatcttaaggataagtttgatcttgttatttttgat
gaagcttcacagatgtttattgaaagaagtttacctgcgattgaaagatctaaaaaagtt
gtaattttaggagatgaaaagcaattagctccaaccaatttttttgtatcaagaaatatt
gatcaagaatttgaaaaatttgaggagaaaaatttaattgatgataaattgtcattgtta
aattatgcaaaaactaaatttccacatattatgcttaaatatcattatcgttctgatttt
aaggaattaattgaatattcaaataatattttttataatgataatcttatatttattagt
aaaaatggaaaaaataaaaattttcaaccgatagaatattttgaattaaaagattcaatt
tataaaaatggacttaatcataacgagatcgataaaattatagaaattttatatcaaatt
aaaaataatttaaatttaaataaaaaatctattggaattattacaatgaactcaaaacaa
gaaaaatatctttcagagaaattagcaagtataagttataatgattttaatttttctaat
tgaattaatagtgatgatgtcaatctttttgttaaaaatattgaaaatgttcagggggac
gaaagggatataattattttttcaactttgtatggaagaaatgaagaaggaaaaatatct
tttaattttggtccaattaataaatttggcggagtaaatagaattaatgttgcggttaca
agagcaaaattaaaaatgtatgtaattacgtcaattagacaaaatgattttgagaatttt
tttattcgtaatcaagcacataaagataatttagaaagtggaatttatattctttataga
tttttaaaacattgtattaagtcatataataataaaaaaataatcaatcaaaatcaattt
agtattaaaaattttaattctaaatttgaaaaagatttatatcaagaacttataaagata
gcaaaaagatataatttatatgtaataaatagagataaaacttatggatataaagcagat
tttttattttatgatgaaaatcataaaataattcttttgatagaatctgatcaggcgatt
aaaaattcttataaatctgtaagagagagagatatttcaaagcaagactttttaaaagaa
agaggttataatttttatcgtatttgaatttcaaattgatttaataatcaaaaaatggaa
ttaaataatattgaaaaaattattaaaaatactattaatttatag
DBGET
integrated database retrieval system