KEGG   Histophilus somni 2336: HSM_0377
Entry
HSM_0377          CDS       T00673                                 
Name
(GenBank) YadA domain protein
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
hsm  Histophilus somni 2336
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hsm00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:hsm02000]
    HSM_0377
Transporters [BR:hsm02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   HSM_0377
SSDB
Motif
Pfam: YadA_stalk YadA_head YadA_anchor ESPR
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACA32015
LinkDB
Position
complement(422466..432413)
AA seq 3315 aa
MNKIFKTKYDITTGQCKAVSELASNRHVASSSEKPKCGGVLRTFKVLPLVLVIAGFFGVS
TISNAAWLAIDSSKGTVGIANWQNEYGEKNNNGNIVLGKENLHKVNGQNTKLEKVVVIGA
GDKTKATGEGLVAVGYGAQALRDGATAVGYESIVAGTNGTALGAESKAQGAQATAIGNNV
YAVAQGTALGADVMAAGGASIAIGGDDIFENGNKVNYGEPNLKAGEGGFADRLPEATIKQ
IYGYSGSRASSNVTYNSILNWNDFYKKYVKADDGKDHRMYSPTYAAGVGAIAIGSRSVGY
GNASLAMGTLSFALADRSTAVGVRAFVGLGADGATAIGDSSRVFAKNSYAIGNAAESTAE
GSLSFGSGAKAVGMGSIAIGPNVSSNAKLTDMSAEKFRTQIMQETKLGTVNENQDPHFKT
VTTDINDLKVGDNNEIVKYGFPANHFNGNNKVSELITKLEKANKFEYEKESKVEITTTED
IKKTRQQGNHAISLGYHISNNGDNTIAIGSASYVRGANSVVLGALNNVGKYATNTIAIGI
GTNVHKENSVAIGTGTTILGAGSIGIGSGVGVKKDNSIAIGYGSSAFSESSMALGNDSKI
NENAKNSVALGNNSSSSSENSVALGYRSTTNYFYTGSDKTTASLNEKNAYNASSLEGYVP
EGSSYRIETDTSAGVISVGGWDTTKDAKGGPGSSKGNKNHVGLRRIVNVAPGALDSDVAT
VGQLRALYYVKKEGLVVYYTEENGKKVKLVKSAGDNKFYKVDTRTGEPLANSPAISEDKV
LVGAKGFDEKIGTKDLGNKIQFGNLKDGKIEPNSDQAITGNQLNQLGGSILGLSVNTDKT
KFTTPNFTAVEYISTPESKKGATHTFKDALDETIKAINQGYKFSDGTNQPTTPFYLGSTI
VIKAGDIQSGNSKTHLGKNLKTEFKNDNSKPTFTIGLKDDPEFKTVKLTGNPTDDKHAVN
KKYVDDKFKNVATSFNVNGDNGTFKVTSKLDIKGDNGNIKTNASGSAVTISLKDTLTGIS
SIAGKNGNSGNKIDFTNSDGLKLSSKSGSTITLKRDGLDLGNKKITQLAKGTADTDAANF
GQLKELATTVLGATVNSGGFTKSTFNQLIGSNGATASTPATAKTFKQAIDDNIAKINKGF
IFSDGTTEGTRYFGEKITIQSGVIDGGDFASDNIKTNYGKDQGVFRIGIKKDPRFEKVTV
TENVTDKSPEMTLTTKKYVDDQFKNFSSDLKFETDSGGEKKISLKDGKLKVKGTANQIKT
SVESNDTIKIGLDEKITQKINETATKADKNEQYIATIKTNIEGKITDQVIKYKANSSGDY
TVKLSEGLNFKNGTNTTAVVESNGVVKFNVNEALTNITSIAGKEVANGGSGNVKVKTEIK
FNENGKGNNANTNVVILSNGAKYTFDPKGFHVGNKQITALASGLGLTDTSGSGGSAGNNS
TVIANVLAGDPDKGNNNGNKISNNAINVKDLSEVAKALVEKGLKFQGNDNQDVTRKLGET
LKIVGETAISAAGTTATTQITTAPDNIIVAKKNGTNGKADTLEIKLSKNLTGIASIANGE
KAKIALGGSNGSDNKITFKAGSSEVTLADGKFSGVSEINKADGKGALKLEDGKATLESTK
DGSSIVVDNAGASIKVGTNKASYTFSDSGLDLNSKKLTNLASGLELNGAGGSSGNGNADI
IDKVLAGTLDSTNSGGSSTTIANNAVNVKDLSEVAKAIVQKGLTFAGNTGTDVKASLGDK
ITIKGEGTYLTSKASSNGSGKEITFSLTDKVTNKLAIINVGNGSTNGDNSFALGKNSTWE
GKTTAATSADINVGSASLKFDWNNAGAGADKEVVSVGSQGNERIIKHVAAGSVMPNSTDA
INGGQVYSVIETFGKLGVTVLGAEVDSGTKQFKATTFTKLKDKDGSETSPAPTTFKQAIE
KSIETINKGLKFKGDKSAGSNNEAKQLYLGSTLTIKGAESTAQTPAQGAGVAKHQNITTT
AKDGGILEIALNTNLKDITSIGKDGDNVLTFANGASGSSGGNSAVLKVGGSELTFTKADG
NKVTITGLADGKSDGDAVTVKQLTASQLHYLSVKNGTSNTSTGTRTDNYNNDGAKGDKSI
AIGVNTKTDMGAIGAVALGSGAEVKSEYGVAIGHGTVVGTGAKNSIAISATKDSDKGNLQ
NAEWAISIGNKNNVSGGNDIVALGSNITISKNNGKSNDSVIAIGNTVTLQNAKQSIGVGR
DTKITNAEWAVSIGNNNSITGGNDIVALGSNITVSGSGNDSVLVFGNSAKAESASNSVVI
GREAESKAQSAVVLGKGANVKQNATGAVAIGEGATVEENAGDSVALGKNSKASDKKNAPS
GAEVFAGKNSLKITWASAGTSSDMAKDKTVVSVGDKGSERIITNVAAGKVETGSTDAING
GQLAEVISIFGKLGFDVLGAEKHDTDDGFKQSTFAKVEYKRASQGTQQGQQQEQAKAPTT
FREAINESITAINKGLMFSADQSAVTNGTQNTPHYLGSTLSIVRLGMNQAGSSATPAPAG
TSSQPNIAEFKGDNLITQYTRETNGNAKIEIGFKNAPIFEKVTLSQKQMYENGTGSGSGA
SGSTVGENDLITKGYLEQALNKFKFKVENGSGKPIEIGRGDTLKFTNGQNIQVTVANGNG
SATQPSSSASASAPAPTPAAPAPSPAPAAAPPSASASSTTTTPTTSTTTTGTPTAPTTAV
VTIATTDTLENIKSISSPKGSAGGNGAGSNEEVTKLSLTSENATFQVGTTGAKVNINKEG
IALMPQGANNTGGANGANPFADTASITIKAGAKPVNKDSLESFEKGQEPSITFSTKETDG
KKIGSGKITGLKDLENGADGTSAVNKNYVDEQVKNLNNNRPFDFYLGNEKVVKGADGSFK
KLKDGTLQDISEEEKKQVVIKAEPSTAPIGISNVASGLGLEAQTEEEKKKTQEKSAELTK
AVEEKVKAVSKEAKALSDKAQTFTDLALAVSSLEQAINALPEGNDKTQAEAKLKENQMKL
DEAKKALEQARNDLKEAQTGLTKAEEAYEQNYKGYEKVVELVKPDSSAELTNVATIGDLQ
AVAKSGLKFKGNDDMEIRTALSGTLAIKGEEGANGNKFNSDRTAAGNIKVEMSQDGKGLE
VKLSDQLKNMTSFETREINGKKSRLDSNGLNVENTSTKERSQLNENRLAFYENDKLGLNL
DGKSRALRLGEKSVISINAKGEALVSDLNTSSSGMAIANKNYVDTKDNELRTQLNTTDRN
LRAGIAGALAAAGLPMSSVPGKSMFAASAGTFKGQNALALGYSRVSDNGKITLRLQGTRS
STGDVGGSVGVGYQW
NT seq 9948 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaaaatatttaaaaccaaatacgatattacaacaggtcaatgtaaagccgtttca
gagttggcaagcaaccgccacgtggcgagcagttcggagaaaccaaagtgcggtggggtt
ttacgaacgtttaaggttttaccgttggtgttggtaattgcgggattttttggggtgagt
actatatcaaatgctgcttggttagctattgatagcagtaaaggaactgtaggtatagca
aattggcaaaatgaatatggagaaaaaaataataatggtaatattgtgttagggaaagaa
aatctacataaagtaaatggacaaaacaccaagttggaaaaagttgtagtaataggagca
ggagataaaactaaagcaacaggagaaggactggttgctgtaggatacggagctcaagca
cttcgagatggagcaacagccgtaggatacgaatctatagtagcaggaaccaatggaact
gcattaggagctgaaagtaaggctcaaggtgcacaagcaacagcaatagggaataatgtt
tatgcagtagcacaagggacagccttaggtgcggacgtcatggcggctggtggggcatct
atcgcaataggaggagatgatatatttgaaaatgggaacaaagttaactatggagaacca
aatcttaaagccggtgaaggcggatttgcagatagattacctgaagcgacaatcaaacaa
atttatggatatagtggaagtagagcatctagtaacgttacgtataacagtatattaaat
tggaatgatttttacaaaaaatatgttaaagcagatgacggaaaagaccatagaatgtat
tccccaacctatgcagccggagtgggggcaatcgcaatagggtcaagatcagttggatat
ggaaatgcttcactggctatggggacattatcatttgcattagctgatagatcaacggcg
gtcggtgttcgtgcgtttgtcggtttaggggctgacggagcaacagcaataggagactca
tcaagggtttttgcgaaaaattcttatgccataggaaatgcggctgaatcaaccgcagaa
ggatcattatcctttggttccggagcaaaagcagtgggaatgggttcaatagcgataggt
cctaatgtatcgtcgaatgcaaaattaactgatatgtcagctgagaaattcagaactcaa
attatgcaagaaaccaagcttggtactgtcaatgaaaatcaagatcctcattttaaaact
gtaactactgatattaatgatcttaaagtgggagataacaatgaaattgttaagtatgga
tttcctgccaatcattttaatgggaataataaagtaagcgagttgataactaaacttgaa
aaagcaaataaatttgaatatgaaaaagaaagtaaggtagaaatcaccacaacagaagac
ataaagaaaacgagacaacaaggaaatcatgcaatatccttgggttatcacatttcaaat
aatggagataataccatagccataggtagtgcctcttatgtcaggggagctaattcggtc
gtcttaggggcgttaaataatgttgggaaatatgcaaccaatacaatagccataggtatt
ggaacaaacgtacataaagaaaactcggttgctatcggaaccggtacaacaatattagga
gctggttcaattgggataggctccggagttggggttaagaaagataattcaattgccata
ggatatggttcatctgctttttcagaatcatctatggcactgggaaatgattctaagatt
aatgaaaatgctaaaaactcagtcgcattggggaataattcaagctcatcatccgaaaat
tcagtcgctttaggatatagatcaacgacgaattacttttatactggttcagataaaaca
acagccagtttaaatgaaaaaaatgcctacaatgcctccagtttagaaggatatgtaccg
gaaggttccagttatagaattgaaacggatacatcggcaggggttatttccgttgggggt
tgggatacgacaaaagatgcaaagggcggtcccggttcatctaaaggaaataaaaatcat
gttggattgcgtagaatagtgaatgtcgcaccgggggcattggatagtgatgtcgccact
gtaggacaactaagagcgttatattatgttaaaaaagaaggacttgttgtttactacacc
gaagaaaacggcaagaaagtgaagctggtaaaatcggctggcgacaacaaattctacaaa
gtcgatacccgaaccggcgaaccgttagcaaattctccggcaatttccgaggacaaagta
ttagtcggagcaaaaggcttcgatgaaaaaataggaacaaaagatcttggtaacaaaatc
caattcggcaatttaaaagacggcaaaattgaaccaaactccgatcaagcgattacgggg
aatcagctgaatcagcttggtggtagtatcttagggttgagtgttaacactgataaaaca
aaatttactacccctaattttactgccgtagaatatattagtacaccagaaagtaagaaa
ggtgcaacacatacatttaaggatgcattggacgaaacgattaaggctataaatcaagga
tataaatttagtgatggaacgaatcagccaactacacctttttatttgggttcaactatt
gtaattaaagctggagatattcaatcaggcaattcaaaaacacatctaggtaaaaaccta
aaaacagaatttaaaaatgataattcaaaaccgacattcactatcggcttaaaagatgat
cctgaatttaagactgtaaaacttaccggtaaccctacagatgacaagcatgccgtcaac
aaaaaatacgttgatgataaattcaaaaatgttgctaccagttttaatgtaaatggggat
aacggaacctttaaagtaactagcaaactggatattaaaggagataatggcaatatcaag
acaaacgctagcggtagtgcggttaccatatcgcttaaagacactttaacaggtatttct
tctattgccggtaaaaatggcaatagtggcaataaaattgactttacgaacagtgatggt
cttaaactctcgtcaaaaagcggttcaacgataacattaaaaagagatggcttggactta
ggcaacaaaaaaattacccagttagcaaaaggaacagccgacaccgatgctgccaacttt
ggacaattaaaagagttagcaacaactgtattgggtgcgacagtaaattcaggtggattt
acgaaatcaacattcaatcaattaataggttctaacggagccactgcttcaacaccagct
acagcaaaaacatttaaacaagcgatagatgataatattgctaaaattaataaaggtttt
atttttagtgatggaacaactgaaggtacaagatattttggagaaaaaataacaatacaa
tccggtgttattgacggcggtgattttgccagcgacaacattaagacgaattacggtaag
gatcaaggagtattccgaattggaattaaaaaagatccacgttttgaaaaagtcacagta
actgaaaatgttactgataaaagtcctgaaatgactttgaccactaaaaaatatgtagat
gatcaatttaaaaatttcagctcagacttaaaatttgaaacagacagtggtggtgaaaag
aaaatttcattaaaagatggcaaattgaaagtgaaaggcactgctaatcaaattaaaacc
tctgttgagagtaacgatacgatcaaaattgggctagatgagaaaatcacgcaaaaaatt
aatgaaacggctactaaagcggataaaaacgagcaatatattgcaaccataaaaaccaat
atagagggaaaaattaccgaccaagtcattaaatacaaggcgaatagttcgggtgattat
accgtcaaattaagcgagggtttgaattttaaaaatggcacaaacaccaccgctgtagtg
gaaagtaacggtgttgttaagtttaatgtcaatgaggcattaactaatattacttcgatt
gctggcaaagaagtcgccaatggcggtagcggaaacgttaaagtaaaaactgaaattaag
tttaatgaaaatggtaaaggcaacaatgcgaataccaatgttgtcattctctcaaatggg
gcaaaatatacctttgatccaaaaggattccatgtcggtaataaacaaattaccgcactt
gcgagcggtttaggattgacagatactagcggtagtggtggaagtgccggaaataatagt
acagttattgccaacgttcttgctggcgatcctgataaaggtaataacaacggcaacaaa
atttccaacaatgccatcaatgtaaaagacttatccgaagtggcgaaagcccttgtggaa
aaaggcttgaagttccaaggaaatgacaatcaagatgttaccagaaaactgggagagacg
ttgaaaatagttggagaaacagcaatttcagcagcaggaacaactgcaacaactcaaatt
acaaccgcacctgataatattatcgtggcgaagaaaaacggtacaaatggcaaagcagat
accctagaaattaaattgtctaaaaacttaacaggtattgcgtctattgccaatggcgag
aaggcgaaaattgctttgggtggaagtaatggaagtgataacaaaattactttcaaggca
ggtagttcagaggttaccctagccgatggtaaattcagtggcgtgtctgaaattaataaa
gcagatggcaaaggtgcgttgaaacttgaggacggtaaagctaccttagaaagcacgaaa
gacggttcaagcattgtcgtagacaatgcaggtgcctccattaaagtgggtaccaataaa
gcaagctatacctttagtgacagcggtttagatttaaatagcaaaaaactcactaactta
gcgagcggtttagagttaaatggtgctggtggaagtagcggaaacggaaatgctgacatt
atcgacaaagtccttgctggaactcttgatagcacaaacagcggtggcagtagcacgaca
attgccaacaacgccgtcaatgtgaaagacctgtccgaagtcgctaaagcgattgttcaa
aaaggcttgacctttgcagggaatactggcactgacgttaaagcctcactcggcgataaa
atcacgattaagggcgagggaacgtatttgaccagcaaggcttcttcaaatggtagcggt
aaagaaattacattttctttgacggataaagtaaccaataaattagcgataatcaatgtc
ggcaatgggtctaccaacggcgataattcctttgcgttgggtaaaaattctacatgggaa
gggaaaactaccgctgcgaccagtgcagatattaatgtgggttcagcaagtttgaaattt
gactggaacaatgcaggagcaggggcggataaagaagttgtcagtgtgggtagtcaaggc
aatgaacgcataattaaacatgttgctgctggaagtgtaatgcctaactcaaccgatgcg
attaacggcggacaggtgtatagcgtgattgaaacatttggtaaattaggcgttacagta
ttaggtgcggaagtggatagcggtacaaaacaattcaaagcaaccacatttaccaagttg
aaagataaagatggaagtgagacatctccagcaccaacaacttttaaacaagcgattgag
aaaagcattgaaaccatcaacaagggcttaaaattcaagggcgataaaagtgctggaagc
aacaacgaagcgaagcaactctatcttggttcaaccttgacaattaagggggcggaaagc
accgcacaaacacctgcccaaggtgcgggtgtagccaaacatcaaaacattactacaacg
gcaaaagatggtggaatacttgaaatcgctttgaacacgaatttgaaggacattacctct
attgggaaagatggggataatgttttaacgtttgcaaatggtgcaagcggttcaagtggt
ggaaactcagcggtattaaaagtcggtggaagtgaattaacttttaccaaagcagatggt
aacaaagttacaattacaggcttggcagatggaaagagtgatggcgatgctgttacagtc
aaacaattaaccgcttcacaattgcattatttgtcggtgaaaaatggaactagtaatacc
agcactggtactagaaccgacaattacaataatgacggtgcaaaaggcgataaatcaatt
gctatcggtgtaaacactaaaacagatatgggagccataggtgcggtcgcattgggtagc
ggtgcggaggtgaaatcggaatatggcgtagcgataggacacggcacggtagtgggtaca
ggtgctaaaaactccattgcgatttcagcgactaaagatagtgataaaggtaatttacaa
aacgccgaatgggcaatttccatcggtaataaaaacaacgtttcaggcggaaatgatatt
gttgccttggggtcgaatattaccatttcaaaaaataatggtaagagtaacgattctgtc
atcgctataggaaatacagtaactttacaaaatgccaaacaatccatcggtgtgggtagg
gatacgaaaatcaccaatgccgaatgggcagtgtctatcggtaataacaatagcattacg
ggtggtaatgacattgttgccttggggtcgaatattacggtttcaggtagtggtaatgat
agcgtactcgtattcggtaacagtgccaaagcagaaagtgcaagtaattccgtggtgatt
ggtagagaagcagagtccaaagcacaaagtgcggtggtactcggtaaaggtgcgaatgtt
aagcaaaacgccacaggtgcggtcgccattggtgagggtgcgacagttgaagaaaatgct
ggcgattctgtggcattgggtaaaaattcaaaagctagcgacaagaaaaatgcaccgagt
ggtgcagaggtttttgctggtaaaaatagcttaaaaatcacttgggcaagtgcaggaacg
tcttctgatatggcaaaagacaaaaccgtagtcagtgtaggggataagggtagcgagcgg
attatcaccaacgttgccgcaggtaaagtcgaaacaggctcaaccgatgccatcaacggc
ggacagcttgcggaagtgattagcatttttggtaaattaggttttgatgtacttggtgca
gagaaacatgatacagatgatggctttaaacaatcaacttttgcaaaagttgagtataag
agagcctcgcaaggaacacagcaaggacaacagcaagaacaagcaaaagccccaacaacc
tttagagaagctattaatgaaagcattacggctattaacaagggcttgatgttcagtgcg
gatcaaagtgcggtaacaaatggcactcaaaacacaccgcactatcttggttcgaccctt
agcattgtgcgtttaggtatgaatcaggctggttcgtctgctacaccagctccggcgggg
acttcatcacaaccaaatattgctgagtttaaaggtgataatttaatcactcaatacacg
agagaaactaacggcaacgccaaaatcgaaatcggctttaaaaatgcaccgatatttgaa
aaggttacgctttctcaaaaacaaatgtatgagaatggcacaggtagcggaagtggtgca
agcggaagtacagttggtgaaaatgacctcattaccaaaggataccttgaacaagcgtta
aataaatttaagttcaaggttgaaaatggtagtggtaagcctatcgaaatcggtcgtggc
gacactttgaagtttacgaacggacagaatatccaagttactgtagcaaatggaaatggc
agtgcaacacagccaagttcgagtgcttctgcttctgcaccggctccaacaccagctgct
ccagcaccgtcgcctgctccagcagctgcaccgccgtctgcttcggcaagtagcacaact
acaacaccaaccacgagtacaacaacgactggtacaccaaccgcacctactacggctgtt
gttactatagcgacgactgacacgttagaaaatataaaatctatctcttcacctaaagga
agtgcgggcggaaatggtgctggttcaaatgaagaagtcaccaaactttctttaacttca
gaaaatgccacattccaagttggcacaacgggtgcgaaagtgaatatcaataaagagggt
attgcacttatgccacaaggggcgaataacacaggcggagcaaatggagcaaatccattt
gctgatacagcatcaatcactattaaagcaggggcaaaaccggtaaataaagacagtcta
gaatcgtttgagaaaggtcaagaaccgtctattacgttctcgacaaaagagactgacggt
aaaaaaatcggctcaggaaaaatcaccggtctaaaagatttagaaaatggagctgacggc
actagtgcggtaaataaaaactatgtcgatgaacaggttaaaaatctgaacaataaccgt
ccatttgatttttatctaggcaatgaaaaagtcgtgaaaggggcagatggtagtttcaaa
aaattaaaagacggcacacttcaagatatttctgaggaagagaagaaacaagtcgtgatc
aaagccgaaccaagcaccgcacctattgggattagcaatgtggcgagtggtcttgggcta
gaagcacaaaccgaagaagagaagaaaaagactcaagaaaaatcggctgaactcaccaaa
gctgttgaggaaaaagtgaaagcagtgagcaaggaagctaaagcactttcggacaaagca
caaactttcacggatttagcattagcggtaagtagcttagaacaagcaataaatgcgttg
ccagaaggcaatgataaaacacaagcagaagccaagctcaaagaaaatcaaatgaaactt
gatgaagcgaaaaaagcacttgaacaagcaagaaatgatttaaaagaagctcaaacaggc
ttaacaaaagcggaggaagcctatgaacaaaattacaaaggctatgagaaagttgtagag
ttagtgaaacctgatagttccgcagagttaaccaacgtggcaacaatcggtgatttgcag
gcggtggcgaaatcgggcttgaaatttaaaggcaatgatgacatggaaattcgcacagca
ttaagcggtactttggcgattaaaggtgaagaaggtgcgaatggcaataaatttaacagc
gaccgcaccgctgccggtaatatcaaagtggaaatgtctcaagacggtaaaggcttagaa
gtcaaactgtccgaccaattgaaaaacatgacctcttttgaaacccgtgaaatcaatggc
aaaaaatctcgcttggatagcaatgggttgaatgtggaaaacacaagtacaaaagagcga
tcccaattaaacgaaaatcgcttggcgttctatgaaaatgataagttaggactgaattta
gacggcaagtctcgtgcgttaagactgggtgaaaaatcggtaatcagcataaatgccaaa
ggtgaagcattggtttccgatttgaacacttccagttcaggtatggcaattgctaataaa
aactatgtggacaccaaagacaatgaactgcggacacaattgaatactactgaccgaaat
ttacgtgcaggaattgcaggagcgttggcggcggctgggttgccgatgtcttctgtgccg
ggtaaatccatgtttgcggcatctgccggaacatttaaaggacaaaatgcactggcgtta
ggttattcacgagtaagtgataatggtaaaataacgctacgattgcaaggtactcgcagt
tcaacgggcgatgtcggcggttcggttggtgtggggtatcagtggtaa

DBGET integrated database retrieval system