Histophilus somni 2336: HSM_1542
Help
Entry
HSM_1542 CDS
T00673
Name
(GenBank) YadA domain protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
hsm
Histophilus somni 2336
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hsm02000
]
HSM_1542
Transporters [BR:
hsm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HSM_1542
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_anchor
YadA_head
ESPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA31299
LinkDB
All DBs
Position
complement(1768676..1775833)
Genome browser
AA seq
2385 aa
AA seq
DB search
MNKIFKTKYDITTGQCKAVSELASNRQIASSSESKPKCGVFFGVFGAFKLAPLALALSVV
LPVEVLGQGFSPGVTGLQDGEAKDVQNMMKTGIKGEGFIDVDVGSFTCSKQGNGAGGGFG
ASNNQGIHNCSSNPIKIKLKDDITQKITKATELSDLFSRGGQELAPSSAEVNVGSDSIRI
RWKDAGAGENKNVINVGSGSTETLLKHVAAGKVQNGSTDAVNGGQLYSVIEAFGKLGSEV
LGAQVWLDGESDGGKRFGKSTFRPVQSNGYTRKSQTTFREAIQDTIEAINQGMTFKVGGN
GSGSSNNNTIKRQLGQSLTFKGDDYLTLSTEGSSGKDTIKLAVNATDSINSTSGGNSNGN
DKKLTTVKAVRDYVNSKITSGGGSGGSSTGTQSLHYLSVNDGTNGAGSGSSGSSGTKGNY
NNDGAKMEGAIAIGVGAEATEKYAIALGYEAKSKAEQAIVIGKDLNVDVKHSVLLGSGIT
VTQGSKEKQDAVVAVGNGVTFNNAKGSIAISAVNEGDGSDHTKLDNAEWSLAIGNKTKIN
SGTDIVALGNNINVNKANGGDEKSANSGLVIIGNKANAENAKYSVVIGQDAKSQAQSAVV
LGKGANVQASATGAVAIGEGASVSTAAGDSIALGRNSKATTRKLAPTGLTSTTGANDITI
SWSSAGAGANKSVLSIGDSGKERIITNVAAGTVQSGSTDAINGGQLYSVIDVFANLGINV
LGAEKADTGTDGFKKTTFKAVSYNGNETNARKSTFREAIEDTITAINKGLKFAGDTGGEQ
SLKLGDTLNIKGKEDSSNGNHKNITTTSSGSNLTIALSDTLKGINSVGKDNNNILSFSNG
SNSTSTATLKVGGTDLTFTQTGTNGNSKVKISGVADGSDQNDAVNFKQLEAAKLHYISVR
NDTAASGTTSNRNDNFDNDGAKAQNSIAIGHSAKVENGNSHDSVAIGYQSNVTNAKWSTA
VGAETQVKSIQSLALGYQAKVLENSDASIAIGVSGETKIINSKWSTALGNKIAITGSDNN
ILALGSNISVGTNNANLIIIGNGENGGSNGTITNAKNSVIIGKHAISQAESAVVIGKDAT
VQASAIGAVAIGEGASVSTNAGDSIALGKGSKAEDKKQAFKTQELSVNGSYSLLFKWENA
GTSASDSDKKSVLSIGDMGRERVIRHVAAGEIRDGSTDAINGGQLKGVIDVFGYLGTDVL
GAEKAETNKAGFKQTTFTKLKDKNGAETNPASTTFKDAITKNIEKINEGLKFKVENGTSA
GGSAGNSTEMTRQLGATVTFKGGKHLKATIDSSKGEISFEAESTDTINDTQQNSGGSSGS
SSNKLVTETAVKTYITQKLQNVGGTLQLEGDNTQNGSTPANPVGKVELNKHKLKITGESD
FIKTEVTQDKPTVTIKLADQVKKKLEVITVNGNGDNSFALGKGSEIVKKKTAPSGTTQNT
GQSEVTISWKNAGASADTMEGNKKEVVSVGSTGSERIITHVAAGEVRDGSTDAINGGQLY
NVIQVFGKLGTEVLGAEKNDRGDGFKKTTFTALKDTSGGNQATKDTFKDAINANISKINE
GLKFAVETGGGAQSSMASGNGPLTRQLGSTLTFGGDSYLTPSLDNSGGKITFKLKVATSI
SDTNSGSTTDQNDNKLVTASAVKEYLKNQLNSLTLKIEADNSNTAQAQAGGQAQSAAPST
PSSSGQSQSSNGKVQGAVKIQSQALQVLGTTDEIETKVEDKQQKVTIKLADQVKKKLDVI
TVNGKDGDNSFALGDGSQIVNKKTAPSGTIQNVGGNDIKISWSAGVGANKEVISVGKKDA
ERIITYVAAGEVKDTSTDAVNGGQLYNVIQVFGKLGTDVLGAEKDDSGDGFKKTTFTALN
KEDGTKNKATTTFKEAIDESIKTINKGLIFEVDDGTTTTATTTAPQTGGTSTNKMTRQLG
ATIKFKGDDYIKPSIDADTGTISFKIEATEEIKENGSADGSSGNSSAEDKKLTTAKAVKD
FVNSKIKTITDQQTEADKIAVKYDDEHKKSITLGGKPQNGGKAHDPVAIKNLKSALGIDN
DSMKGKSESEKQGKSLDLVKKLVSNGISSQQGQKMTEQQDLHQAANLADLKAVAQAGLRF
KGNQGDDVVRKISDTLTIKGEEETQNGQATSSFSSAAGNIKVETNTAKDGLEIKLSDTLK
NMKAFETKEEGGKKATLNSEGLKVVNNKNGNGKDISATYGADNIMLEDKKTGNKATITAE
SLTFADNATTQNQQNPKMPKAVLNKNGLTVTGANGEIKIDGEKGIITVPDIKPTTSGSAV
VNKKYVDTLQRQTDQKLSNLNNKLDMSNKELRAGIAGALATSGLPMSSVPGKSMFAASAG
SYKGQSAVALGYSRVSDNGKITLRLQGTRSSTGDVGGSVGVGYQW
NT seq
7158 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaatcttcaaaaccaaatatgatattacaacaggtcaatgtaaagccgtttcc
gagttggcaagtaatcgccaaatagcgagcagttcggagagtaagccgaagtgcggtgtg
tttttcggtgttttcggggcgtttaaactcgcaccgctggcgttagcgttgtcggtggtg
ttgccggtggaggttttgggacaaggtttttcccccggtgttacaggattacaagatggt
gaagcgaaagatgtccaaaacatgatgaaaacggggataaagggagaaggttttatcgat
gtagatgtaggatcatttacttgtagtaaacaaggcaatggagcaggagggggatttggg
gcttcaaacaatcaaggaatacacaattgttcaagtaaccccatcaaaatcaaactcaaa
gacgatataacccaaaaaatcaccaaagccacggagttaagtgatttattttcgagaggg
ggtcaagaattagcccctagtagtgcagaggtgaatgttggttcggattctatacgaatt
agatggaaagacgcaggtgctggtgaaaataaaaacgttattaatgtaggaagcggtagc
accgaaaccctactaaaacatgtcgctgcaggtaaggtgcaaaatggctcaaccgatgcg
gtaaatggcggacaattatatagcgtgattgaagcctttgggaaattaggctcagaggtg
ttaggtgcacaagtttggcttgatggagaaagtgatggtggaaaacgtttcggaaaatca
acgtttaggccagttcaaagtaatggatatacaagaaaaagtcaaaccacgtttagagaa
gctattcaagatactattgaagccataaaccaaggaatgacctttaaagttgggggaaat
ggaagtggtagcagtaacaacaatactatcaaaagacaactcggacaatcattgaccttt
aaaggcgacgattatctgactttaagcactgaaggtagtagtggtaaggacacaattaag
cttgccgtcaatgcgactgattcaattaacagcacatcaggcggtaacagcaacggcaat
gacaaaaaattaacgactgtaaaagcagttagagactatgtaaatagtaaaattacaagc
ggtggcggaagtggcggaagcagtactggtacgcaatctttgcattatttgtcggtgaat
gatggtacaaacggtgcaggtagcggttctagcggttcgagtggcacaaaaggcaactac
aataacgatggagcaaagatggagggtgctatcgctatcggtgtgggggcggaagcgacc
gaaaaatatgccatcgcccttgggtacgaagcgaaatcaaaagctgaacaagcgattgta
attggtaaggacttgaatgttgatgtaaaacattccgtgttgttaggctcaggtattacg
gttacacaaggcagtaaagaaaaacaagatgctgttgtcgctgttggtaacggcgttaca
ttcaacaatgcaaaaggctcaatcgctatcagtgcggttaatgaaggagatggttctgac
catacaaaattagataatgccgaatggtcattagccatcggtaataaaaccaaaatcaac
agcggtacagatatcgtggcgttggggaataatattaacgtaaataaagcgaatggtggc
gatgaaaagagtgcaaacagtggtttagtgattattggtaataaggcaaacgctgaaaat
gctaaatattctgtggtgattggtcaagatgcaaaatctcaagcacaaagtgcggtggta
ctcggtaaaggtgcgaatgttcaagcaagtgcaacaggtgcggtagcgattggggagggt
gcgtctgtatccaccgccgctggcgattctattgcgttggggagaaattctaaggcgacc
actagaaagctagcaccaaccggtcttacatctactactggagctaatgatataacaatt
tcttggagtagtgccggagcaggagctaataagtccgttttaagtattggggacagcggt
aaggaacgaataataacgaatgttgccgccggaacagtgcaatcaggttcaaccgatgct
atcaatggcgggcaactttatagcgtaattgatgtatttgctaatttagggataaatgta
ctcggtgccgaaaaagcggatactggaacagatggttttaaaaagactacttttaaagct
gtttcatataatggaaatgaaactaatgctaggaagtctacttttagagaagcaattgaa
gataccatcacagcgataaacaaaggacttaaatttgctggagatactggcggagaacaa
tctctaaaattaggagacactttaaatattaaaggaaaagaagatagttcaaatggcaac
cataaaaatattaccactacgtcttctggaagtaatttaacaatagcacttagcgatacc
ttaaaaggtattaacagcgtaggaaaagataataataacattctatcatttagtaatggg
tcaaatagtacatcaactgccacgttaaaagtcggtgggactgatttaacatttacacaa
accggaactaatggaaatagtaaagtcaaaatttcaggcgttgctgatggctcagatcaa
aacgatgccgtaaactttaaacaacttgaagcggcgaaattgcattatatttcggtaaga
aatgacaccgccgcttccggcacaacaagtaacagaaacgacaattttgataacgacgga
gcaaaagcccaaaattctattgcgattggtcatagtgcaaaagtagaaaatggtaattca
cacgattccgttgctatcggttatcaatcaaatgtaacaaatgccaaatggtcaactgct
gtaggtgcagaaactcaggttaaatcaattcaatctttagcgttggggtatcaagcaaaa
gtattggaaaatagcgatgcttcaatagcgataggtgtatcaggagaaacaaaaataatc
aattctaaatggtcaaccgcattaggaaacaaaatagccataacaggttccgataataac
attcttgcattgggaagtaatattagtgtaggaactaacaatgcaaatttaatcataata
ggaaatggtgagaacggcggaagtaatggcacaataacaaacgccaaaaattcagtgatt
atcggtaaacatgcaatttctcaagctgaaagtgcggtggtgattggtaaagatgcaact
gttcaagcaagtgccataggtgcggtagcgattggggagggtgcgtctgtatccactaat
gcaggggattcgattgctttaggtaaaggttctaaggcagaagataagaaacaagcattt
aaaacacaagagttaagtgttaatggcagttatagcctattatttaaatgggaaaatgct
ggaacatctgcatccgattctgataaaaaatccgtgctaagtataggggatatgggacgt
gaaagagttattagacatgttgctgcgggtgaaattagggacggttccacagatgcgatc
aacggtgggcaattaaaaggcgttatcgatgtattcggctatttaggaaccgacgtatta
ggtgcagaaaaagccgaaactaacaaagccggttttaaacaaactacgtttactaagttg
aaagataaaaacggagctgagacaaatccagcttcaacaacatttaaagacgctattacc
aaaaacattgagaaaatcaacgagggcttaaaattcaaagtcgaaaacggcacaagtgcg
ggcggttctgctggaaattcaactgaaatgacccgtcaactcggagcgacggttaccttt
aaaggcggaaaacacctcaaagcaacgattgatagctcaaaaggcgaaatttcctttgaa
gcggagtcaaccgacacaattaatgatactcaacaaaatagtgggggaagttcaggtagt
tcaagcaacaaacttgtaactgaaactgcggtgaaaacctacataacccaaaaactccaa
aatgttggtggtacgttgcaactagagggggataacacccaaaacggaagcacccctgcc
aaccctgttggtaaagttgagttaaataaacacaaactaaaaataacaggtgaaagtgat
ttcatcaaaacagaagttacacaagacaaaccaaccgtaaccatcaaacttgccgaccaa
gtgaagaaaaaattggaagtgattactgttaatggcaacggcgataattcctttgcgttg
ggtaaaggttctgaaattgttaagaaaaagaccgcacctagtggaactacacaaaacaca
ggacaaagtgaagtaacaatcagctggaaaaacgccggtgcttctgctgatacaatggaa
ggcaataaaaaagaagtcgtcagcgttggttctacaggctcagaacgcattatcacccat
gtcgccgcaggtgaagtaagggacggttcaactgatgcaattaacggcggacagctttac
aacgttattcaagtattcggaaaactgggtacggaagtattgggtgcagagaaaaatgat
agaggagatggctttaagaaaactacatttactgcattgaaagatacaagtggtggaaat
caagcgactaaagacacatttaaagatgcaattaatgccaatatctccaaaatcaacgag
gggctaaaatttgcagtggaaactggtggtggagctcaatcatcaatggcgagtggaaac
ggtcctttaacccgtcaacttggctcaacgctaacgtttggtggggatagttaccttacg
cctagccttgataacagcggtggtaaaattacctttaagctcaaagtggctacttctatt
agtgatacaaattcaggcagtacaactgaccaaaacgacaataaactggttaccgcaagt
gcggttaaagaatacttgaaaaatcaattgaattcattaacgctaaaaattgaagctgat
aattccaataccgcacaagcacaagccggtggacaagctcaaagtgcggctccaagtacg
ccgtcttctagcggacaatctcaatcctcaaacggaaaagtccaaggtgctgttaaaatt
caaagtcaagccttgcaggttttgggaacaacagatgagattgaaacgaaagttgaagat
aagcaacaaaaagttactatcaaacttgctgaccaagtaaagaaaaagctagatgtaatt
acagttaatggtaaagacggcgataattcctttgcgttaggcgatggttctcaaatcgtg
aataaaaagaccgcacctagtggaacaatacaaaatgtaggtggaaatgatataaaaatc
agctggtcagcaggtgttggggctaataaagaagtcatcagcgtgggtaagaaagatgct
gaacgcattattacttatgtcgccgccggtgaagtcaaagatacctcaactgatgccgtc
aatggtggacagctttacaatgttattcaggtattcggtaaactcggtacggacgtatta
ggggcggagaaagatgatagcggtgatggttttaagaaaactacgtttaccgcattaaac
aaagaagatggcactaaaaataaggctaccacgacatttaaagaagccattgatgaaagc
attaaaaccattaacaaaggtttaatttttgaggtggacgatggtactacaacaacagca
actacgaccgcacctcaaaccggcggtacatcaaccaacaaaatgacccgtcagcttggg
gctacgattaaatttaaaggcgatgactatatcaaaccgagtattgatgccgacaccgga
acaatttccttcaaaatagaggcaactgaagaaattaaggaaaatggaagtgcggacggt
tctagcggaaattctagtgctgaggacaaaaaacttactacagctaaggcggtgaaagac
tttgtaaacagcaaaatcaagaccatcaccgaccaacagacagaagcggataaaatagcg
gtgaaatatgatgatgaacataaaaaatcaatcactttaggcggtaaacctcaaaatgga
ggtaaggctcatgaccctgttgccatcaaaaatctaaaatccgccttgggaattgataat
gatagtatgaaaggtaagtctgaatctgaaaaacaaggtaaatcccttgatctagtgaaa
aaactggtttccaacggcataagtagccagcaagggcaaaaaatgactgagcaacaagat
ctgcatcaagccgccaatctcgctgacttaaaagcggttgcacaagctgggttgagattt
aaaggaaatcagggcgatgatgtagtcagaaaaatcagcgataccttaaccattaaaggg
gaagaggaaactcaaaacggtcaagctacaagttcatttagtagtgccgctggtaacatt
aaggtagaaaccaatacagccaaagatggtttagaaataaaactgtcggataccttgaaa
aatatgaaagcctttgaaaccaaagaggagggcggtaaaaaagccacgttaaatagcgag
ggcttaaaagttgtcaacaacaaaaatggtaatggcaaagacatctctgccacctatggt
gcggacaatatcatgttggaagataagaaaactggcaataaagcaacaataactgctgaa
agcctgacctttgctgacaacgcaacgacacaaaatcagcaaaatccaaaaatgccaaaa
gctgttcttaataaaaacggcttaaccgtaaccggagcaaacggtgaaattaagattgat
ggtgaaaaaggtattattaccgtgccggatattaaaccaacaaccagtggaagtgcggtg
gtgaataaaaaatatgtggatactttacaaagacaaaccgaccaaaaactcagcaatctc
aacaataaactggatatgtccaataaagaattgcgagcggggattgcgggtgctttggca
acttcaggtttgccgatgtcttctgtgccgggtaaatccatgtttgctgcttcggcaggt
tcctataaaggacaaagtgcggtggcgttaggttattcacgagtaagtgataatggtaaa
ataacgctacgattgcaaggtactcgcagttcaacgggcgatgtcggcggttcggttggt
gtggggtatcagtggtaa
DBGET
integrated database retrieval system