Histophilus somni 129PT: HS_0929
Help
Entry
HS_0929 CDS
T00386
Symbol
recB
Name
(GenBank) DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
hso
Histophilus somni 129PT
Pathway
hso03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hso00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
HS_0929 (recB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
hso03400
]
HS_0929 (recB)
Enzymes [BR:
hso01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
HS_0929 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
hso03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
HS_0929 (recB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
AAA_11
AAA_30
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI25204
UniProt:
Q0I3D6
LinkDB
All DBs
Position
complement(1025458..1029108)
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MLNFMTSLKDQYSSLRISVFQPFNPISTPLSAVSLIEASAGTGKTHSIVSLYIRLLLQAG
ENNFSQALEVDQILVVTYTEMATQELKQRIRERIYQTKQALIQYQQHQNKTLLEDQFLQE
LLPYIKDIDLAVYRLTLAERNLDISAVSTIHSFCRRVLMQYAFNSGVHFNMELVSDESEL
IQRLANELWRENFYHQPLSVANFIFKKLGSPKQLVSYVYKYLSQPPKVNTQKPHLLEISL
QQFLHTQVEPQLSKIHQFKQRWLENEKALRELVALKKWRKDWFESRFNKMRVWAENEDIQ
QPEAAKYFYQLELDKKEPLVSHDLFSELENLVTNEVTQISNNFSVLLYHCVHELNRKIMD
YKLTHQQKGFDDLLRLVRNALYQPQGDKLAQLIRHQYPFAMIDEFQDTDQQQYDIFYQIY
IKSAVKNTGFIMIGDPKQSIYKFRGADIFTYLKATEQAQYRFSLGENWRSTQPLIQTINY
LFDFQENSPFLHKKIPFQQVAKGLYYDTQGNLLPNRFCLNGRIEPALRGYLTDNNDTQLA
ENCALSIEQWLQSAVQNQAILDNKPLKAKNIAVLVSSFTQAEKIQKALRDKGIASVYLSD
RSNVFDSITAKELLHILRACLNPLNENNILNALSTALFAKTGAEIFQIKQDENLWENCVE
RFIAYQQQWQRQGILPMLHHLFAVEKINENLQMMEQGERKMTDLWHLSELLQQATRLNDT
ESSLVRWFEKQIQGEERLEEQIRLESDRELVKIVTLHKSKGLAYDLVWIPFICKPSLFRD
NAINTYYDENQEQVLWDMDKQHSDEIEKERMAEDIRLLYVALTRAKYQIVINLPRVFEKK
WNALLYVLTKGQIGVNKRIDDEYDAKKLLSPIIEELGEQCVEIEEDKKLLVRRNEYITVQ
QALSPVEAEEFHGKIERNWTVTSFTEMTYRHQRNRSLNSRQKAQQIEISGVFDQARDYDV
KENGHDMSASFDMKLSADSDYPVGFSPFDFPHGVHVGSEFHRYFEKYNMTQALNDDQLSK
LCQTLQLSDEWQNPLKKWINTIFNTPLKQDIAGFTLGNIKSQDCLKEMQFYLKLNQSFNE
NVFNRLLSKYHHLPSSPILMDRIKGMVRGFIDLVVRFEGKYYLLDYKSNLLGYSSQHYQQ
DNLIQVMCNNHYDWQYLIYTIALHRYLKERDKNYDYQRDFGGVLYTFLRGMNGKDNSGIF
FDKPDWRLISELESLF
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttaatttcatgaccagcttaaaagatcaatattcttccttacgcatatccgtcttt
caaccttttaatcctatttctactccgttaagtgcggtcagtttaattgaggcatctgcc
ggtacaggaaaaactcattccatcgtttctctttatattcgcttgttattacaagcggga
gaaaataatttttctcaggcattggaagttgatcaaattttggtagtaacttatacagaa
atggcaacacaagagttaaagcaacgtattcgggaacgtatttatcaaacaaaacaagcg
ttaattcaatatcagcaacatcaaaataaaacattacttgaagatcaatttctgcaagaa
ttactgccttatattaaagacatcgatcttgcagtctatcgtttaactttagcagaacga
aatttggatatttccgccgtttcgactattcatagtttttgtcgccgagtattaatgcaa
tatgcctttaattcgggggtacattttaatatggaactggtgagtgatgaatctgaacta
attcaacgtttggcaaatgagctatggcgtgaaaatttttatcatcagcctttgtcagtc
gcaaacttcattttcaaaaaattaggatcgccgaagcaactggtatcttacgtttataaa
tatctttctcagccgccaaaagtaaatacccaaaaaccgcacttattggagatttctctg
cagcaatttttacatactcaagttgagcctcaacttagtaaaattcatcaatttaaacaa
cgttggttagaaaatgaaaaagcgttaagagagcttgtcgctttaaaaaaatggcgtaaa
gattggtttgaaagtcgttttaataaaatgcgagtatgggcagaaaacgaggatattcag
caacctgaggcggcaaaatatttttatcaattggaattagataaaaaagaacctttagta
tcgcatgatttattttctgaattggaaaacttagtgaccaatgaagttactcaaatttca
aataatttttctgtacttttataccattgtgttcatgaattaaatcgtaaaataatggat
tataaacttacgcatcaacaaaaggggtttgatgatcttttacgtctggtacgcaatgct
ttatatcaaccacaaggagataaattagcacaacttattcgccatcaatatccttttgct
atgattgatgagtttcaggatacagatcaacagcaatatgatattttttatcaaatttat
attaaaagtgcggtgaaaaatacgggctttattatgattggggatcctaaacaatctatt
tataaatttcgtggtgcggatatttttacctatctgaaagcaacggaacaagcacaatat
cgatttagtttgggcgaaaattggcgttctacacaacctcttattcagacgataaattat
ctttttgattttcaagaaaattctccttttttacataaaaaaattccatttcaacaggtt
gctaaaggattatattatgacactcaagggaatcttcttcccaaccgattttgcttaaat
ggaagaattgaacctgcattaagaggttatttgactgacaacaatgacacacaacttgct
gaaaattgtgctttatctattgagcaatggctacaaagtgcggtacaaaatcaagctatt
ttagataacaaaccactaaaagcaaaaaatattgcagttttagtcagtagttttactcaa
gcggagaaaatacaaaaagccttaagggataaaggtattgcatcagtttatctttcagat
cgtagtaacgtttttgatagtatcactgcaaaagaactgttgcatattttacgagcttgt
ttaaatccgttaaatgaaaataatattttaaatgcgttgagtaccgctctttttgctaaa
accggtgcagaaatattccaaattaagcaagatgagaacttatgggaaaactgtgttgag
cgatttattgcttaccaacaacaatggcaaaggcagggtattttacctatgttgcatcat
ttatttgcagttgaaaaaattaatgaaaatttacaaatgatggaacaaggtgagagaaaa
atgactgatttgtggcatttaagtgagttattgcaacaggctacccgtttaaatgatacc
gagtcctccttagttcgttggtttgagaaacagattcaaggcgaagaacgcttggaagaa
caaattcggttagaaagtgatcgagaattagtcaagattgttacattacataaatctaaa
gggcttgcttatgatttagtttggattccttttatttgtaagccgtccctattccgagat
aatgccattaatacttattatgatgaaaatcaagaacaagtgttatgggatatggataag
caacattccgatgaaattgaaaaagagcgtatggctgaagatatccgtttactctatgtc
gcacttactcgagcgaaatatcagattgttattaatcttcctcgcgtttttgagaaaaaa
tggaatgcgttactttatgtattaactaagggacaaattggtgtaaataaaagaattgat
gatgaatatgatgcaaaaaaattgttaagtccaataattgaggaattaggtgaacaatgt
gttgaaatagaggaagataaaaaattattagtaaggagaaatgagtatattacagtgcaa
caggcattgtcgccggttgaagcggaagaatttcatggcaagattgagcgtaattggact
gtaacaagttttactgaaatgacctaccgtcatcaacgtaacagatctttaaattctcga
caaaaagcacagcagattgaaatatccggagtttttgatcaagcaagagattatgatgtg
aaagaaaatggtcatgatatgtcagcgtcatttgatatgaagttgagtgcagactctgat
tatcctgtaggtttttcaccgtttgattttcctcatggtgtccatgtcggtagcgaattc
catcgttattttgaaaaatataatatgacgcaggcattgaatgatgaccaattatctaaa
ctttgtcagacgttacaattaagtgatgaatggcaaaatccattgaaaaaatggataaat
acgatttttaatacgcctttaaaacaggatattgcaggctttactttaggcaatatcaag
tcgcaagattgtttaaaagaaatgcaattttatttgaaattaaatcaatcatttaatgaa
aatgtctttaatcggctgttaagtaagtatcatcatttaccgtcatcaccgatactgatg
gatagaattaaaggtatggtgagaggttttattgatttggtcgttcgttttgaaggcaag
tattacttattagattataagtctaatttactaggctattcttctcaacattatcagcaa
gacaatctaattcaagtgatgtgtaataatcattatgattggcagtatttaatttatacc
attgcattacatcgttatttaaaagagcgggataaaaattatgattaccaacgtgatttc
ggcggtgtactttatacttttttacgtggaatgaatggaaaagataattccgggatattt
tttgataaaccggattggcgtttgatttctgaattggagagtttattttaa
DBGET
integrated database retrieval system