Hyla sarda (Sardinian treefrog): 130367421
Help
Entry
130367421 CDS
T11475
Name
(RefSeq) fibrillin-2-like isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
hsq Hyla sarda (Sardinian treefrog)
Pathway
hsq04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsq00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
130367421
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hsq00536
]
130367421
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hsq00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
130367421
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
TB
FXa_inhibition
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
EGF_MSP1_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130367421
NCBI-ProteinID:
XP_056425815
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(243825521..244057473)
Genome browser
AA seq
2877 aa
AA seq
DB search
MGVIWLARFMLGCTVLLYADQAQGQMELGDQQVDRFAGYEDRQALRVRRRGQDTLRGPNV
CGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSSGQLSPTCGAGAAMN
CNVRCMNGGSCNEDSCTCQKGYTGTHCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRCACVYGFTGPQCE
RDYRTGPCFTQISNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFIPN
IRTGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQSETSQKCEDIDECSTIPNI
CDGGECTNTAGSYVCICPRGFTTSLDGSRCIDQRAGSCFSALIGGRCAGELPGQYTKGQC
CCDTGRCWALGQTPEMCPVRGSDEYRRLCIESLPLGPAYPGTYPIGPGGIGPGGIGPGII
GPGGVGPGGIGPNGIGPNGRGTISGLPSVGTDIGTATLNQTGDICKHFTNLCQNGRCIPT
PSSYRCECNMGYKQDSRLECIDVDECASSPCIHGDCVNTQGSYHCRCHEGFQSNPTKQAC
IDIDECIMNGVMCRNGRCVNTEGSFQCICNAGFETTPDGKNCVDHDECATTNMCLNGMCI
NEDGSFKCICKPGFVLAPNGRYCVDVDECQTPGICMNGRCINTEGSFRCECLGGLTIGID
GRVCVDTHMRSTCYGGIKKGTCARPFPGAVTKSECCCANPDHGFGEPCQPCPAKNSAEFQ
ALCSSGIGITADGRDINECALNSEICPNGICENLRGSYRCICSVGYESDASGKNCVDVDE
CAVNRLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPKGYVFKPESETCEDINECASNPCVNGVCRNNAGSF
VCECSFGSKLDSTGTICVDSMKGTCWLNLQDGRCEVNINGATLKSECCSTLGAAWGSPCE
RCEIDPACPRGYSRKKGVACEDVNECEVFPGVCPNGRCVNSAGSFKCECPEGLILDGSGR
NCVDIRVEQCYMKWDEDECTSSLPGKYRIDMCCCTVGAAWGIDCEECPKPGSDEYKTICP
RGTGFANRGDILSGRPFYKDVNECKVFNSLCNHGTCRNSIGSFRCVCESGFALDAEERNC
TDIDECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMMMKNCMDIDECERDPLLCRGGT
CINTDGSFECICPPGHELTTDGNSCIDINECSLSDNLCRNGRCVNMIGTYQCSCDSGFQS
TPDRQGCVDIDECTIMNGGCDTQCTNSEGSYECSCSEGYALMPDQRSCADIDECEDNPDI
CDGGQCTNIPGEYRCLCFDGFMASLDMKTCIDVNECDLNPNICLHGECENTKGSFICHCQ
LGYFVKKGTTGCTDIDECEVGAHNCDVHASCINVPGSFKCKCQTGWVGDGLKCVDLDECS
TEDHNCNLNANCVNTPGSYRCMCNEGFNGDGFSCSDVDECADNVNLCENGHCLNAPGGYR
CECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGTFRCICDDGYELDRSGGNCTDV
NECADPVNCINGLCVNTPGNYLCNCPQDFELNPTGVGCVDTRVGNCYLETLTRGDAGLAC
SAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCESCPLANSTEYKTLCPGGEGFRPNPITVILEDIDE
CQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPLGYYLNEDTRICEDIDECSTHIGICGPGTCYNTLG
NYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNYNDTCENELSINMTKKMCCCSYNIGKAWNK
PCEPCPVPASAEYQVLCGNQAPGFIIDIRTGKPMDIDECSEIPAICTNGVCINQIGSFRC
ECPMGFSYNNILLICEDIDECSSGENLCQMHADCINIPGSYRCECSSGYKLSPSGACVGR
NECNEIPNVCSHGTCVDTTGSYICICHNGFKASADQTMCMDIDECDRQPCGNGTCKNTVG
SYNCLCFPGFELTHNNDCMDIDECSSLLGQVCRNGQCINKIGSFQCLCQEGYEITPDGKN
CVDINECISFPGTCSPGTCQNLEGSFRCICPPGYAVQNDNCIDINECDTEPNICLFGSCT
NTPGSFQCVCPPGFVLSDNGRRCFDIRQSFCFTRFDNGKCSVPKAFNTTKARCCCSKMPG
EGWGDPCELCPHESSAGFQELCPYGHGSIQDRTDTREDVNECAESPGICVNGICINTDSS
FRCECPFGYNLDFTGVNCVDTDECSIGNPCGNGTCTNVVGGFECACDEGFEPGPMMTCED
INECTNPLLCAFRCINTYGSYECTCPSGYTLRDDRRMCKDLDECSEGLHDCESKGMMCKN
LIGTFMCICPPGMQRRPDGEGCMDENECRTKPGICPNGRCVNTIGSYRCDCNDGFQVSAS
GTECIDTRQGSCFTEVLQTMCQLSSTNRNMVTKSECCCNGGRGWGNQCELCPLPGTAAFK
KMCPHGPGFTTDGRDIDECKVLPNLCKNGQCINTIGSFRCHCNMGYTTDFTGTTCIDLDE
CAQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDECSTKQHNCQFLCVNTIGSF
NCKCPPGFTQHQSSCIDNNECSAQPSLCGARGMCQNNPGSFTCECQKGFSLDNTGSNCED
VDECDGNHRCQHGCQNVLGGFRCGCPQGYVQHYQWNQCVDENECSSQSTCGSASCYNTLG
SFKCICPSGFDFDSSYGGCQDVDECSGSSGNPCSYGCSNTDGGYLCGCPGGYFRAGQGHC
VSGLGFGKGGYIPAPVEEDEENILSPENCYECKINGYPKRGRQRRSANETSEHENHISLA
SVDIDAPLKMTLNISDLINKQHIMELLPALVPLENHVRYIISQGNEDSIFRIHQKEGLSF
LYLGRKKVLPGLYNLEIASVPLYRKKELQKLEDEKDFNYLSGEIGQALKMKVQIHLY
NT seq
8634 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggtgatatggctggccagattcatgctgggatgtacagtgctgttgtatgcggac
caagctcagggccagatggaactcggtgaccagcaagtagacaggtttgcaggctatgag
gacaggcaagcactcagggtgagaaggagaggacaagacacattaagaggaccaaatgtt
tgtggatctcggtttcactcatattgttgcccagggtggaaaacattaccaggtggaaac
caatgtattgttccaatctgccggaactcctgtggagatggattttgctcacggccaaac
atgtgtacatgctctagtggacaactttctccaacttgtggagctggtgcagctatgaat
tgcaatgtgcgctgcatgaatggtggaagctgcaatgaagactcctgtacctgtcagaaa
ggatatactggtacccactgtggacaacctgtatgtgaaaatggttgtcagaatggagga
cgttgtatcgggccgaacagatgtgcttgtgtttacggatttactggacctcaatgtgaa
agagattaccgaactggaccatgtttcacccaaatcagcaaccaaatgtgtcaaggacag
cttagtggtattgtgtgcaccaagacattgtgctgtgctactattggccgtgcctggggc
catccatgtgaaatgtgtcctgctcaaccacacccatgccgtagaggtttcattccaaat
atccgaactggagcctgccaagatgttgatgaatgtcaagctatccctggtctgtgccaa
ggtggtaactgtatcaacacagtgggatcctatgagtgtaaatgcccagctggacacaaa
cagagtgagacctcacagaagtgtgaagatattgatgaatgcagcacaattcctaatatt
tgtgatggtggggagtgcaccaacactgctggaagctatgtctgcatatgtccgagagga
tttaccacgagtctggatgggtcacgctgcattgatcagagggctggaagctgtttctct
gccttaatcgggggccgatgtgctggagaacttcctggtcaatacacaaaaggacagtgt
tgctgtgatactggacgatgctgggccttaggtcaaacccctgagatgtgtccagtcaga
gggagtgatgaatatagaagactttgcattgaaagcctgcctctaggacctgcatatcca
ggaacctatcctattggccctggtggcattggaccaggtggaattgggccaggaattatc
ggacctggtggagtcggaccaggaggtattggccctaatgggattggacctaatggacgt
ggaacaatatcaggattacccagtgtgggcacagatattggaacggcaacactgaaccag
actggagatatttgtaaacactttaccaatttgtgccagaatggacgttgtattcccaca
ccatctagttatcgatgtgaatgtaatatgggttataaacaagacagccgactggaatgt
atagatgtcgatgagtgtgccagcagcccatgcattcatggagactgtgttaacacacaa
ggatcataccactgtagatgtcatgaaggatttcagagcaaccccaccaaacaagcatgc
attgatattgatgaatgtatcatgaatggagtgatgtgccgaaatggccgttgtgtgaac
acagagggcagttttcagtgtatctgcaatgctggatttgagactactccagatggaaag
aactgtgtggatcacgatgagtgtgcaactacaaatatgtgcttaaatggaatgtgtatt
aatgaggacggcagctttaagtgcatctgcaagccaggttttgtattggcaccaaatgga
cggtactgtgttgatgtggatgaatgccagacaccaggaatctgtatgaacgggcgctgt
attaacacagagggatccttccgttgtgagtgcttgggtggattgaccattggaattgac
ggacgagtttgtgtagacacccacatgcgcagtacttgttatggtggtattaaaaaggga
acttgtgcccgtcccttccctggtgctgttaccaaatctgagtgttgctgtgcaaatcct
gaccatggatttggtgaaccttgccagccttgccctgctaaaaactctgctgaatttcag
gctctttgcagcagtggtattggcataactgcagatggcagagatattaatgaatgtgcc
ttgaactctgaaatctgccccaacggcatctgtgaaaatttgcgtggcagctatcgttgt
atctgtagtgtgggctatgaatcagacgcaagtgggaagaactgtgtcgatgtcgatgaa
tgtgcagtgaaccgtctgctttgtgacaacggcttgtgtcgtaacactcctggaagctac
acctgcacatgccccaagggttatgtcttcaagcctgagtctgagacctgtgaagatatt
aatgaatgtgcatccaacccctgtgtcaatggcgtctgcaggaacaatgctggttctttt
gtgtgcgagtgctcattcggaagcaaactggattccactggaactatttgtgtggatagc
atgaaaggaacttgttggttgaacctccaagatggtagatgtgaagtcaacattaatgga
gccactttgaaatctgaatgctgttcaacattaggagctgcttggggaagcccttgtgaa
cgttgtgaaattgatcctgcctgtcccagaggttactccaggaagaagggggttgcatgt
gaagatgtaaatgagtgtgaggtattcccgggtgtctgccctaatggacgttgtgtgaat
tctgctggttcattcaagtgcgagtgtcctgaaggactaatcctggatgggtctggcaga
aactgtgttgatatacgtgtggaacagtgctacatgaagtgggatgaggatgaatgcact
tcttccttgcctggaaaatacagaattgatatgtgctgctgcactgttggtgctgcctgg
ggtattgactgtgaggagtgccctaaacctggaagtgatgaatataagaccatctgtcca
agaggaactggctttgctaacagaggcgatatactttctggtcgtccattctacaaagat
gtgaatgaatgtaaggtattcaacagcttgtgcaaccatggaacgtgtcgcaatagcatt
ggaagcttcaggtgcgtttgtgaaagcggctttgctctagatgctgaggaaaggaactgt
acagacatagatgaatgcaggatttctcctgacctctgcggccacggaacttgcgtcaat
actcctggaagctttgaatgtgaatgctttgatggttatgagagtggattcatgatgatg
aagaactgcatggacattgatgaatgtgaaagagacccgcttctttgtagagggggaacc
tgcatcaacacagacggcagctttgagtgtatctgccccccaggtcatgagctaactaca
gacggcaattcctgtattgacataaatgagtgttccctgagtgataacctctgcaggaac
gggcgttgtgtcaacatgattggaacctaccaatgttcttgtgattctggcttccagtca
actccagatcggcagggttgtgtagatattgatgaatgcacaatcatgaatggaggatgt
gacacccaatgtaccaactcagaaggcagctatgaatgtagctgtagtgaaggatatgca
cttatgcctgaccagagatcctgtgctgatattgatgaatgtgaggacaatcccgacatc
tgtgatggtgggcaatgtacaaacattcctggagaatatcgttgtttgtgcttcgatggt
ttcatggcttctctggatatgaagacatgtatagatgtcaatgaatgtgaccttaaccct
aacatctgcctacacggcgagtgtgaaaacactaaaggctccttcatttgccattgtcag
ttaggttactttgtgaagaagggaacaactggatgtacagatattgatgaatgtgaagtt
ggtgcacacaattgtgatgtccatgcatcttgtatcaacgtacctggcagctttaagtgc
aaatgtcaaacaggatgggtgggagatggacttaaatgtgttgatcttgatgagtgctcc
acagaggaccataactgcaacttaaatgccaattgtgtgaacactcctggatcctatcgg
tgcatgtgcaatgagggattcaatggagatggcttttcttgttcagatgttgatgagtgc
gcagacaatgtgaacctgtgtgaaaatggccactgcttaaatgcccccggaggttatcgc
tgtgaatgtgagatgggttttactcctacagaagacagcaaggcttgtcaagatattgat
gagtgcacattccagaacatttgtgtctttggaacctgtcagaacctgccgggaacgttc
cgctgtatctgtgatgatggttatgaactagacagaagtggaggaaattgtaccgatgta
aatgagtgtgccgacccagtgaactgcatcaatggactatgtgtgaatacgccaggaaac
tacttgtgcaactgcccacaggactttgagttgaaccccactggtgtgggctgtgtcgat
actcgagttggaaactgctacttggaaactctgacaagaggtgatgccggtcttgcttgt
agtgcagagattggagttggagttacaagagcatcttgttgctgctccttgggacgtgct
tggggcaatccatgtgaaagctgtcctttggccaactccactgaatacaagactctgtgt
ccaggaggagagggatttagaccaaatcccattacagttattttggaagatattgatgaa
tgtcaagaacttccaggtctgtgtcagggtggaaactgtgtgaacacctttggaagtttt
caatgcgagtgcccacttggctactatctgaatgaagacacccgcatctgtgaagatatt
gatgagtgctctacccatattggcatctgtggtcctggtacttgctataatacattaggg
aactacacatgcgtttgcccaccagagtacatgcaggtcaacggaggaaataactgtatg
gatatgagaaaaagtgtgtgctaccgtaactacaatgacacatgcgagaatgagctctca
atcaacatgacaaagaaaatgtgctgttgctcctacaatattggcaaagcttggaacaag
ccttgtgaaccatgtcctgtccctgcgagtgctgaataccaagttctctgtggaaatcaa
gcacctggatttattattgacatccgcactggcaaacctatggatattgatgagtgcagt
gaaatcccagctatttgcactaatggagtatgcatcaaccagattggaagcttccgctgt
gaatgcccaatgggattcagctacaacaacattcttctcatctgtgaagatatcgatgag
tgcagcagtggagagaacctgtgccagatgcatgcagactgtattaatatcccaggctca
tatcgctgtgaatgttccagcggatacaagctgtcccccagcggcgcttgtgttggtcgt
aatgaatgcaatgaaattccaaatgtttgtagccatggaacatgtgtggacacaactgga
agctacatctgtatctgtcacaatggcttcaaagctagtgcagaccaaaccatgtgcatg
gatatcgatgagtgcgaccgtcaaccttgtggtaatggtacctgcaagaacactgtggga
tcctataactgcctctgcttccctggctttgaactaactcacaacaatgactgcatggac
atagatgagtgctcctctctcttgggacaagtttgcagaaacggccaatgcataaacaaa
ataggctccttccaatgtctgtgtcaagaaggctatgaaataactcctgatggaaagaac
tgcgtggatatcaatgagtgcattagctttcctggaacttgttctcctggtacttgccaa
aatctggaaggatccttccgctgcatctgccctccaggatatgctgtacagaatgacaac
tgtatcgatatcaatgaatgtgacactgagccaaacatctgtttattcggaagttgtact
aacacccctggaagcttccagtgtgtatgtccaccaggatttgtcctatctgataatgga
cgtcgttgctttgatatccgtcaaagtttttgctttactcgatttgataatggaaaatgc
tccgttcctaaagccttcaataccacaaaagccaggtgctgctgtagcaagatgcctggt
gaaggatggggagatccttgcgagctgtgcccacatgaatcaagtgctggtttccaggaa
ctctgtccttatggtcatggttctattcaagacaggacagacaccagagaagatgtcaat
gaatgtgctgagagtcctggaatttgtgtcaatgggatctgtattaataccgatagctct
ttccgctgtgaatgtccatttggatataaccttgacttcactggagttaactgcgtagac
acagatgagtgctccattggaaacccttgtggcaatggaacatgtactaatgtggttggt
ggatttgaatgcgcctgtgatgaaggctttgaacctggaccaatgatgacttgtgaagat
atcaatgagtgcacaaatcctcttctgtgtgctttccgttgtataaacacttatggatca
tatgaatgcacatgtccttctggctataccctaagagacgatcgccggatgtgcaaagat
ctggatgaatgttcagaaggtttacatgactgtgaatccaaaggcatgatgtgcaagaac
ctcattggtacatttatgtgtatatgcccacctggcatgcagaggcgccctgacggtgaa
ggatgcatggatgaaaatgaatgtcgtacaaagcctggtatttgccccaatggacgctgt
gtgaatacaattggaagttatagatgtgattgtaatgatgggttccaggtcagtgcctct
ggaacagaatgtattgatacccgtcaaggatcttgtttcactgaagtcctacagacaatg
tgccaactttcatctactaatcgtaacatggttaccaaatctgagtgttgctgtaatgga
ggtcgaggctggggcaatcagtgtgaattgtgcccacttcctggtactgcagccttcaaa
aagatgtgcccacatggtcctggcttcaccactgatggacgagacattgatgaatgcaaa
gttctacccaacttatgcaaaaatggccagtgtataaacactattgggtctttccgttgt
cactgcaatatgggctacacaacagacttcacagggaccacatgcattgatcttgatgaa
tgtgcccagtctcccaagccctgcaactttatatgtaagaatacagagggcagctaccaa
tgctcatgtcctagaggatacattctacaagaagatggcaagacatgcaaagacttggat
gaatgttcaactaaacaacacaactgccagttcctatgtgttaacactattggaagcttc
aattgcaagtgtccacctggatttacccagcaccagtcttcatgtattgataacaatgag
tgcagtgcgcaaccatccttgtgcggagctcggggcatgtgccagaacaaccctggtagc
ttcacctgtgaatgtcagaaaggcttctccctggataacacaggaagcaactgtgaagat
gttgatgagtgtgatggtaatcatcgctgtcaacatggctgtcaaaatgtgctaggtgga
tttcgctgtggctgtccacagggatatgtgcaacattaccagtggaaccagtgtgtggat
gagaatgagtgttccagccagtcaacctgtggctctgcctcttgttataatactttggga
agcttcaaatgcatctgtccctcaggctttgattttgactcctcttatggtggctgccag
gatgtagatgagtgttcaggttctagtggaaatccttgcagctatggttgctccaatact
gatggtggttacctgtgtggatgtccaggaggatacttccgagctggccaagggcactgc
gtgtcaggccttggatttggcaaaggtggttacattccagccccagttgaagaagatgaa
gaaaacattctatccccagagaactgctatgaatgcaagatcaatggttatccaaaaaga
ggaagacagagacgtagtgctaatgaaacctctgaacatgagaatcatatcagcttggct
agtgtagacattgatgctccacttaagatgaccctgaatatttctgacttgataaataag
caacatatcatggagctcttgcctgccttggtgccactggagaaccatgtacgctacatt
atctctcagggcaatgaggatagcatcttccgcattcaccagaaggaagggttaagtttt
ctctaccttggacgcaagaaggtgcttccaggcttgtataacttggagattgccagtgtg
cctctataccgtaagaaggaactgcaaaaattagaagatgagaaggacttcaactacctc
agtggtgaaataggccaagcactcaagatgaaagtccagattcacctttattaa
DBGET
integrated database retrieval system