Hydractinia symbiolongicarpus: 130625918
Help
Entry
130625918 CDS
T09218
Name
(RefSeq) voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3-like
KO
K04860
voltage-dependent calcium channel alpha-2/delta-3
Organism
hsy
Hydractinia symbiolongicarpus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
hsy04040
]
130625918
Ion channels [BR:
hsy04040
]
Voltage-gated cation channels
Calcium channel, voltage-gated (Cav)
130625918
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VWA_N
VWA
VWA_2
VWA_3
VWA_CoxE
RemA-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130625918
NCBI-ProteinID:
XP_057297026
LinkDB
All DBs
Position
14:9494552..9500106
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MSKGELIMIFVVIYCCNANISLGELKIATNQIAKQLTTLVDSNTKCREIELKYEKYSIES
VVDIEVADVSKEFNKKLEILLKSFMTSVRNIKTKAENFHDEYDYNENIYVPQYYHEESGT
LPTQMEVLAPKFSSKQTVNLNFSYIHTPVNVYNHHKDVLNDVAWSNQLDDIFKRNLETNA
NLLWQFYGSETGMHRLYPGTRRHNATYAYDCRRRVWYTEAITSPKDVVILLDLSGSMTGK
HFAIAKLITRALIDTFQQNDFFNVVLFNDNVRLIIPCIETLLQAATKNKAAIIDMVDDLP
EPGGQSRSAAGFAKAFQVLNKSSGNNSTSSACTQMIILVSDGIENIVEVDKVLEIHNVNK
RVVIFSYIIGQSNQHAMKKIACGNGGEFYEFPTLGSVWDTVTRYQQILSHPKASENDNIV
TFTHLYMDLKETGLVLTACIGVSGVESNNTERTLLGVAGVDIKHVLIDKQVPVKTLGVFG
NAFAINNNAILLTHPVVKTLSKSYNGPILTTVDEVEYFVDPSHGVYLRKEMVDRKSGCFN
AMVQTMFDNSKRFVRLNATYCYQPIHETPFTSAVKISNEQIKRVVVSSLSENIWQSGISA
LTPKNDQTEVEVGNFMFCNFKTGNNTAYFPNAAQLQGYLVNINYTSLKNATECDKNMLYE
LLLSAHVIKQTCPETTTVTPDIKTIYILMSTGYMLVIANETRAKLTKRDIYSNDFYLHPT
SYENSNSIVVSIQSLKSNKKRLRADGYIAIGKHMRVNNVTLGVAGINISSTYMKNILFNA
TSHFETFNCTDGSKYNCFLIDENAYVVASNHAKNNHGFFFGFLNGVLMQKFVEWSLFEKR
YFTSPNCRKEDQVDSFTINSSSRDLFNTYEILWMVMKVTISNLFYVCTLLLDILALRIDN
ATASMSKIGNEQYGNCSNYFIIYKRTAKTKYPFNEISCSPNCNETFSIADVEGTNLMLIV
TTNNCPSRCKQHIEVGKVLRPSLSKHCLMNSNYRRPVPNCYRLTGNHPECSAGKYDIQPV
DPKIYLFTVFAILFTILLSVGLYPIIKVRIL
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgaaaggagaattaattatgatatttgttgtaatctactgctgcaatgcaaacata
tcattgggggaattaaaaatagctaccaatcaaattgcaaaacaattgaccactcttgtg
gatagcaatacaaagtgccgtgaaattgaattaaaatacgaaaaatattcgatagagagc
gttgtagacattgaagttgctgatgtaagcaaagagtttaataaaaagttggaaatctta
ttaaaatcttttatgacatctgtacggaacattaaaactaaagctgaaaactttcacgac
gaatacgattacaatgagaacatttatgttccacaatactatcacgaagaaagtggcact
ctacccacacagatggaagttttggcgccaaaattttcgtccaaacaaacagttaattta
aactttagttacatacacactcctgtcaacgtttacaatcaccataaagatgttttgaac
gatgtagcttggtcgaatcaactagacgacattttcaaacgaaatcttgaaacaaacgcg
aatttattatggcaattttatggcagcgaaacgggcatgcatcgcctctatcctggcaca
cgaaggcacaatgcaacatatgcttatgattgtcggcgacgagtatggtacaccgaagca
ataacatcaccaaaagacgttgtcattttattagatttaagtggttcaatgacaggcaaa
cattttgctatagctaagttaataaccagagcattaatagatacatttcagcagaacgat
tttttcaacgttgttttgtttaatgacaatgtacgattgataattccatgcattgaaacg
ttgttgcaagcagcaacgaagaacaaagctgccattatagatatggttgatgatctacct
gaaccaggtggacaatcaagatctgctgcagggtttgcaaaagcttttcaggttttaaac
aaaagctctggaaataattccacttcgtcagcatgcacccagatgattattttggtttct
gatggtattgagaacattgtggaggtggataaagtgctggaaatccacaatgtcaataag
cgtgtagttatattctcatacataattggtcaaagtaatcaacacgcgatgaagaaaatt
gcttgtggaaacggaggagaattttacgaatttccgacattaggtagtgtgtgggatact
gttacacgataccagcaaatacttagtcatccgaaagcatcggaaaacgataatattgtg
actttcacacatttgtacatggatttaaaagaaacaggattggttttaacggcatgcatt
ggcgtttccggtgtagaaagcaataatactgaacgtaccttgcttggtgtagctggggtt
gatatcaaacatgtactcatcgacaagcaagttccagtaaaaactcttggtgtttttggc
aacgcttttgcaataaataacaacgctattcttctgacgcatcccgttgtaaaaacattg
agtaaaagttacaatgggccaattttaactacagttgatgaagtagagtattttgtagat
ccttcacatggagtttatttgagaaaagaaatggttgatcgcaagtctggttgctttaat
gcaatggttcaaacaatgtttgataattcgaagcgatttgttagattaaacgcaacctat
tgttatcagccaattcatgagacaccattcacttctgctgtgaagatctcaaacgaacaa
ataaagcgtgttgtcgtttcgtcattgagtgaaaacatctggcagtcgggaatttctgct
ctgactcctaaaaatgaccaaacagaagtggaagtcggaaactttatgttttgcaatttt
aaaactggcaacaatacagcgtatttcccaaacgcagcacaactacaaggttatctagta
aacattaattacacttcgcttaaaaatgctacagaatgtgataaaaatatgctttacgag
cttttactttcagcacacgtgattaaacaaacttgtccagaaacaacaacggttacacca
gacatcaaaaccatttacatactcatgtccactggatatatgttagtaattgctaacgaa
acaagagcaaaattaaccaagcgtgacatatactctaatgatttctatctacaccctact
tcttatgagaattctaactcaatagtggtcagtattcaatcgttgaaatccaacaaaaag
cgattgcgtgcggatggttacattgctatagggaaacacatgcgagtgaataacgttacg
cttggagtagcaggcattaatatatcgtccacttacatgaaaaatatactcttcaacgcc
acttctcatttcgagacgtttaattgcactgatggcagtaaatataactgctttcttata
gacgaaaatgcgtatgttgttgcaagtaaccatgccaaaaataaccatggttttttcttt
ggttttctaaacggtgtcctgatgcagaaattcgttgaatggtcgttgtttgaaaaaagg
tatttcacgagtccaaactgtagaaaggaggatcaggtagattccttcaccatcaattca
agttcgcgtgatttatttaatacctacgagatactttggatggtgatgaaagttacaatt
tcaaacttgttttacgtctgtactttgttgttagatatacttgccttaagaatagacaat
gctactgcaagcatgagcaaaataggaaacgaacaatacggaaactgcagtaattatttt
atcatttataaacgtaccgcaaaaactaagtacccttttaatgaaatctcttgttcaccg
aattgcaatgaaacattctcaatagcagacgtggaaggaactaacttaatgttgattgta
acaaccaacaactgtccaagtagatgcaaacaacacatagaggttggcaaagttttaagg
ccaagtttgagcaaacactgtttgatgaattcaaattaccgcagacctgtaccaaattgt
tacagattaacgggtaatcatccagaatgctctgcaggtaaatacgacattcaaccagtg
gatccaaaaatatatttgtttacagtgtttgctattttgtttacaatattgttgtcggta
ggcttgtatccaatcattaaagtgcgaatcctttga
DBGET
integrated database retrieval system
