Hydractinia symbiolongicarpus: 130631408
Help
Entry
130631408 CDS
T09218
Name
(RefSeq) fibrillin-1-like
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
hsy
Hydractinia symbiolongicarpus
Pathway
hsy04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsy00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
130631408
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hsy00536
]
130631408
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
hsy00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
130631408
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
hEGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_MSP1_1
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130631408
NCBI-ProteinID:
XP_057300376
LinkDB
All DBs
Position
1:4096210..4135910
Genome browser
AA seq
2916 aa
AA seq
DB search
MELRGLYTSLILMTAAVSSQRFDPSRPKSVAFNPRSKERFFGASPTNAGPNRCQGGFTCC
PGWNMNPSTRWCTIPTCRNPCGFGICRTPNLCQCMSGGFGAICPGPGGTHTGGCQQRCMN
GGQCQGQKCICAPGYVGLNCEKPICRQPCLNNGRCIGPNRCACPFGYSGLRCELDLRTGP
CFTRVERNMCRGQLVGVKCSRESCCATVGAAWGIPCQKCPEKLDCKRGFFKDPRTGKCSD
INECRGIPNICAMGTCINTLGSYRCECGEGRRYNPETFECTDIDECSSSSGMCEFGKCVN
IDGSYKCICDEGYKSSDNGRRCVVADVKGTCYAKYSNGRCQTPTPNQVSKKQCCCGNFDR
AFGSCNKCPAKGTDEYRKLGCYDDSDKNNGGNNNTSGGDGDKKCQDMFSMCDNGKCQTMG
GVKKCVCDPGFTKDKDNYCADINECTKFSGMCHGGKCINTPGSFRCKCAEGYSQSTDGYR
CVDVDECKNPNTCTNGICKNFPGTYQCRCNRGYKSGPNNNCIDNNECLIPNICPGNGKCL
NTDGSYRCECAHGYKLNSDKICVDIDECSTVPNICAGGYCVNIGGSFKCTCPAGFELAAN
ERSCKDRNECSYIPDICYGGKCINGEGSFRCQCDYGWKVSEDGTYCIDTRVKDCYAKYNG
LQCSMPLSKQLTAMQCCCGMENTGTRAFGNPCKACPKKGTKEYKRICMHGPGVDENGKDI
DECKNNAGMTLGICNNGRCVNMMKDYKCVCNSGFRNPSDTNRLCKDINECTEFNLCNGGT
CTNTPGGYRCVCPQGHKYNQENKSCEDENECDNNPCVGGTCTNTAGSFRCDCPSGSIYDA
ARRLCKDQREGNCYAIATDNKCSKNIASYVSKSECCNGLGQAWGNNCEKCSGDAGLGCEK
GYKRVGAQCQNIDECSFSTACQNGRCVDTIGSFRCICPTGYELDASGSACVDVRVGVCYR
SVKSGQCGMPLVGELFMKANCCCSSFSQAWGSPCEICPLKNSVSYKELCPKGEGFEKNGE
DMNECKVAGICKNGRCINTPGAYKCECNAGFDMDETGTMCVDINECEISKSICGRGQCIN
TYGSFRCRCESGFRNDMMMEMCVDINECVEMNPLPCRSGRCVNTAGSFRCVCPQGLKTMG
DGNACEDIDECEQPGICPNGVCQNFIGSYHCRCLNGYRPSRDMKKCFDVDECSTNNGGCE
YSCTNTDGSFRCSCRSGFELRADRKTCTDINECARGTPCGVGNRCTNTVGGYVCSCTIGY
RVSRDGKACVDIDECRVDSNACQNGDCLNTAGSYLCNCRRGYKLETNAMVCIDIDECKLE
ENGGCHADARCINNVGSFRCQCKSGYDGDGKTCKDTNECALGLANCAQDADCVNTVGSFN
CKCKAGFTGDGELCLDVNECLADDKLCRPGTCMNSIGGYKCDCPKGYEPSADGRKCLDKN
ECTDPNLSVCDHGYCINTEGSYTCQCKLGFQLDKTKINCVDINECEFTGMCTNGVCKNMM
GMYKCICDKSKGFMPNSNETGCIDMRMGYCYSKFVDERTCNGAQLSSKQMMKQFCCCSAP
DGSAWQDDSNEACEACPVMHTADYKSLCPGGPSTHVNETTNKINKHNGCDVLENYCRNGE
CVDTGEQGISCTCYAGYKFNKERMTCEDIDECETDGICGFGARCINREPSYECVCPAGYT
YNTEQKFCQDNRNYPCYFFSINPSGKCVTALPVQYTIGQCCCGNSASRYGPDCKACPAPG
TGQRQALCVGKPTLPTIPTGQPPIGPSKPPTQSPGNGTGTGNIGATDKPVTTIDPKNDIN
ECFHSPKICGKGKCINTIGGYRCQCDQGFKEAIVNFTRKCYDIDECENNPCDGGTCNNIE
GAFFCSCPEGMQLDGSNLKCVEMDECKTPGYCEHGSCTNLPNGRGFLCDCNEGYVKSANR
KTCEDKNECSEANICENGACVNLPGSYRCDCNNGFKKNAAGDCVDVNECLDYPDLCRHGS
CNNLFGSFMCECDDGFKQDATKQSCQDINECREAGFCENGRCRNTIGSATCTCNPGFEKT
RDGRSCEDINECEDEDNRCQYGGTCVNVVGTFRCLCNPGFVSDKSGRECTDIRRSFCFSS
LENNQCTRANGLNITKSVCCCSMGAGFGDPCELCPEKGTKEFEYYCPNGVGLTRNNTDIN
ECEANLGTCINGNCVNTDGSFRCACDEGFVLNPENPRECIDKDECAPGSTLCGNGNCTNL
IGSYRCSCEQGFRSGTDSPACIDIDECAEQKGLCAFRCVNQLGSYTCSCPKGFKLGSDRK
HCEDINECETPQICPFRCKNIIGGYRCLCPKGYRRDIRGRCIEINECLNDPTLCRPGGFC
QNIEGGYRCDCTPPYMRSDDGKFCQDKSMGLCFSNVVDNICQASSGKMEKVSQRDCCCSG
GGAAWGTDCRTCPSLNTPEGRSLCTGYKNRTVDECKFIAGVCKNGKCMDTIDSFRCMCNA
GYKLTINGKKCEDKDECNDGTSKCPNGCRNTDGSYECICPKGYVINESKTQCVDEDECST
GNHDCQNGCENTVGGYKCICPAGFRMVGKTCIDTDECTEIGICGLGTCRNTVGSYECLCG
RGLKFDKTKKSCVYITDGGDKKNPGGCIGVPQGCGAACPQGFYRYYNQFGGTQCVDVNEC
RQNMCGQSTCINTLGSYQCTCPTGYTYQGGRCQDTNACALSPCSFGCLNNRGGFACQCPP
GYFPVTGGHCVATGATCFSCDTSDIPKEGVPLGGKPTQSQPGHQSAIGGGSVPLSGGSNA
YNPRQPYVPPYTGGRQETGGFSGFPAGGFQQQQYKPYGGFAYRRRRSTSKHTKPVHVVIS
HKTKPHVSLMKLVAQLKDMTGHMDYNIIKGNASLFELVTGTNGRTSLQSTDYLIPGSYNV
AIKGDIKKDNSEIEEELKAIYRDAGNFILKVNVRVL
NT seq
8751 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacttagaggtttatacacttctcttatccttatgactgcagcagtatcatcacaa
agatttgatccgtcacgaccaaaaagtgttgcttttaatccaaggtctaaggaaagattt
tttggcgctagtccaacaaatgcgggtccaaaccgttgccaagggggattcacctgttgc
cctggatggaatatgaacccttccacgaggtggtgtaccattccaacctgcagaaatcct
tgtggatttgggatatgccgaactccaaacttatgtcaatgtatgtccggtggatttggt
gcaatatgtcctggacctggaggtactcatactggcggttgtcaacaacgttgtatgaat
ggaggacagtgtcaaggacaaaaatgtatttgtgctccaggttatgttggtttgaactgc
gagaaacctatttgtagacaaccatgtttaaacaatggtagatgtattggaccaaataga
tgtgcatgcccatttggatattctggattaagatgtgaattagatcttcgaactggtcca
tgttttacccgtgttgaacgtaacatgtgcagaggccaacttgttggtgtaaaatgttca
agggaatcctgttgtgccactgtgggagctgcatggggcattccatgtcaaaaatgccca
gaaaaactagactgcaaacgtggtttttttaaagacccccgtactggaaagtgtagcgat
attaacgagtgtagaggaattccaaatatttgtgcaatgggaacatgcataaacaccctt
ggcagctaccgctgtgaatgtggtgaaggacgcagatacaatccagaaacatttgaatgc
acagatattgatgagtgttcgtcaagcagtggtatgtgtgaatttggaaaatgtgtaaat
attgatggaagctacaaatgtatatgtgatgaaggttataaatcaagtgacaatggaaga
agatgtgttgttgctgatgttaaaggaacttgttatgcgaaatacagcaatggtcgatgc
caaacaccgaccccaaatcaagtttcaaagaaacaatgttgttgtggaaattttgatagg
gcatttggaagttgtaataagtgtcctgctaaaggaactgatgagtatcgtaaacttggt
tgctatgatgattcagacaaaaataatggaggcaataataatacttctggaggagatggt
gataaaaaatgtcaagatatgttttcgatgtgtgataatggcaaatgtcaaactatgggt
ggtgtaaagaagtgtgtttgtgaccctgggtttactaaagataaagataattactgtgca
gatattaacgaatgtaccaaattttctggcatgtgtcatggtggcaaatgtatcaatact
cctggaagtttcagatgtaaatgtgcagaaggatattcacaatctactgatggataccgt
tgcgtggatgttgatgaatgtaaaaatccaaacacatgtacaaatggcatttgtaaaaac
tttccaggaacctatcaatgtagatgtaacagaggatataaatcaggacctaataacaac
tgtatagacaataatgaatgtttgattccgaatatttgtcctggcaatggtaaatgttta
aatactgatggtagctaccggtgtgaatgtgcacatggttacaaacttaacagtgacaaa
atatgtgtggatattgacgagtgctcaacggtaccaaatatctgtgctggtggatactgt
gtaaatattggtggatcttttaaatgcacgtgtcctgctggttttgaattagcagcaaac
gaaagatcttgcaaagatcgaaatgaatgtagctacattcctgatatttgttatggtgga
aaatgtatcaatggtgaaggtagcttcagatgtcaatgtgattatggatggaaggtgtct
gaggatgggacatattgtatagacactagagtaaaagattgttatgcaaaatataatgga
ctgcaatgttctatgccattatcaaaacaactgacagcaatgcagtgttgctgtggtatg
gaaaacactggcacaagagcatttggaaatccttgcaaggcgtgcccgaagaaaggaacc
aaggaatacaaacgtatatgtatgcatggtcctggtgtggacgaaaacggaaaagatatt
gatgaatgtaaaaacaatgctggtatgacattaggaatctgcaataatggccgatgcgtc
aatatgatgaaggattataaatgtgtttgtaacagtggctttagaaacccatcagataca
aatcgtctttgtaaagatattaacgaatgcacagaatttaatctctgcaatggaggtact
tgtacaaacactccaggaggttacagatgtgtctgtccacaaggacataaatacaaccaa
gaaaataaatcctgtgaagatgaaaacgaatgtgataacaatccatgtgtaggaggcaca
tgcaccaacacagctggttccttccgatgtgattgtccaagtggtagtatctatgatgct
gctcgcagactctgcaaagatcaacgtgagggaaattgttatgctatagctacagataac
aaatgtagcaaaaacattgcatcttatgtcagtaaatctgaatgctgtaatggtcttgga
caagcatggggaaataactgtgaaaaatgttctggagatgctggtttaggttgtgagaaa
ggatacaaaagagttggagcacagtgtcaaaatattgatgagtgttcttttagtacagca
tgtcaaaatggccgatgtgttgacactattggtagtttcagatgtatatgcccaaccggt
tatgaattagatgcatcaggttcagcttgtgtagatgtcagagttggtgtatgctaccga
agtgtaaaaagtggacaatgtggtatgccactcgtaggagagttgttcatgaaagctaat
tgttgttgttcttccttctcacaagcttggggaagcccatgtgaaatatgcccactgaaa
aattctgtatcatacaaagagttatgcccaaaaggtgaaggttttgagaagaatggtgaa
gacatgaatgaatgtaaagtagcaggtatttgtaagaatggtcgttgcattaacacgcct
ggcgcatacaaatgtgaatgcaatgcgggctttgatatggatgaaactggcacgatgtgt
gttgacataaatgaatgtgaaatatcaaaatctatctgtggtagaggacagtgtataaat
acgtatggttcatttcgttgccgatgtgaatctggtttccgtaatgacatgatgatggaa
atgtgtgttgatattaatgagtgtgtagaaatgaatccattgccatgtcgaagtggtaga
tgtgtaaacactgccggatctttccgatgcgtttgtccacaaggcttgaaaacaatgggt
gatggaaatgcttgcgaggatattgatgagtgtgaacagccaggaatctgtccaaatggt
gtatgtcaaaatttcattggaagttatcattgtcgttgtttgaatggttaccgtccaagt
agagacatgaaaaaatgttttgatgttgatgaatgttctacaaataatggtggatgtgag
tattcatgtaccaacactgatgggagtttcaggtgtagttgccgatctggtttcgaattg
cgagcagacagaaaaacttgtactgatattaatgaatgtgcacgtggaacaccatgtggt
gttggcaaccgctgcacaaacactgttggtggctacgtttgcagttgcaccattggctat
cgagtgtcacgtgatggaaaggcgtgcgtagatatcgatgaatgtcgagtagattctaac
gcctgtcaaaatggtgattgtttaaacacagccggttcttatctctgcaactgtagacgt
ggatataaattagaaacaaacgcaatggtttgtatagatattgatgaatgcaaacttgaa
gaaaatggtggttgtcatgccgatgcaagatgtatcaataacgttggatcatttcgatgt
caatgtaaatcaggatatgacggggatggtaagacttgcaaagacacaaatgaatgcgcg
ttaggtttggctaattgtgcacaagatgcagattgtgtgaacacagttggaagttttaat
tgtaaatgtaaagcaggatttactggcgacggagaactttgtttagatgtcaatgaatgc
ttggctgatgacaaattatgtagacctggtacatgcatgaattcaattggaggatacaaa
tgtgattgtccaaaaggctacgaaccttcagcagatggacgcaaatgtcttgataagaac
gaatgtactgatccaaatcttagcgtgtgtgaccacggatattgcataaacactgagggt
agttatacttgtcagtgtaaacttggattccagttggataaaacaaagataaactgcgtt
gatataaacgaatgtgaatttactggcatgtgtacaaatggagtgtgtaaaaacatgatg
ggaatgtacaagtgtatttgtgacaaatccaaaggattcatgcccaattccaatgaaact
ggatgtatagatatgagaatgggctactgttattcaaagtttgtcgacgaacgtacttgt
aatggggcgcaattatcatcaaaacaaatgatgaagcaattttgttgttgttcggcacca
gatggttcagcatggcaagacgactctaatgaagcttgtgaggcttgtccggtcatgcat
acagctgactacaaatccttatgtcctggtggtccttcaacccatgttaatgaaacaacc
aataaaattaacaagcacaacggttgcgatgtgttagaaaactactgcagaaatggtgaa
tgtgtggatacaggagaacagggaatatcttgcacgtgctatgcaggttataaatttaac
aaagaaagaatgacttgtgaagatatcgatgagtgtgaaactgatggtatttgtggtttt
ggcgctcgctgcatcaatcgcgagccaagttatgaatgtgtttgcccagctggatacacg
tataatacagaacaaaagttctgtcaagacaaccgaaactacccgtgttattttttctcc
ataaatccttctggaaaatgtgtgacagccttaccggttcaatataccattggtcaatgt
tgttgtggtaattccgcttcacgatatggcccggactgcaaagcttgtccggcgccagga
acaggtcagcgacaggctctgtgtgttgggaaaccaactttaccaaccatccccaccggt
caaccgcccataggtccatcaaaaccaccaacccaatcacctggtaatggaactggaact
ggcaatattggagctaccgataaaccagtgactaccattgaccctaaaaacgatatcaat
gaatgctttcactctccaaagatttgtggaaaaggaaaatgtataaatactattggtgga
tatagatgccagtgtgaccagggatttaaagaagcaattgttaacttcacaagaaaatgt
tatgatattgatgaatgtgaaaataatccctgtgatggaggtacttgtaacaatatcgag
ggtgcgttcttttgctcttgtcctgaggggatgcagctagatggtagtaatttgaaatgc
gtggagatggacgaatgtaagacgccaggttactgtgaacatggaagttgtaccaatctt
ccaaatggaagaggatttctgtgcgattgtaatgaaggttatgtcaaatccgctaataga
aaaacttgtgaagataaaaacgaatgttcggaagcgaatatttgcgagaacggggcatgc
gtcaatttaccagggagttacagatgtgattgtaacaatggcttcaagaaaaacgctgct
ggagattgtgtcgacgttaacgagtgtcttgattacccagacttatgtcgtcacggttcg
tgtaataatttgtttggaagtttcatgtgtgaatgtgatgatggattcaaacaggatgca
accaaacaatcctgtcaagatattaacgaatgcagagaagcaggtttttgtgaaaatggt
cgttgcagaaatacgattggaagtgctacatgcacttgtaatcctggatttgaaaaaaca
agagatggtcgttcttgtgaagatataaacgagtgtgaagacgaagacaatagatgccaa
tatggcggcacctgcgtaaatgttgtcggtacatttagatgcttgtgtaatccaggcttt
gtttctgataagagtgggcgtgaatgtacagatatccgaagaagtttttgcttttcatca
ctggagaataaccagtgcacacgagcgaatggattgaacatcacgaaatctgtatgttgc
tgtagtatgggagccggttttggagatccgtgtgaactttgtcccgagaaaggaacgaaa
gaatttgaatattattgtcctaatggagttggcttgacgcgaaataacacagatatcaac
gaatgtgaagccaaccttggtacttgtatcaatggtaattgcgtcaatactgatggtagc
tttagatgcgcatgcgatgaaggatttgtgttaaacccagagaatcccagagagtgtatt
gataaagatgaatgtgcacctggttcaactttatgcggaaatggaaattgtactaatttg
attggttcttaccgttgctcgtgtgaacagggctttaggtctggtactgactcgccagcg
tgtattgacatcgacgaatgtgctgagcaaaaaggattatgtgctttccgttgtgtcaac
caactcggttcgtacacatgttcttgtccaaaaggatttaagcttggaagtgatagaaaa
cactgtgaagacatcaatgaatgcgaaacacctcaaatctgtccgttcagatgtaagaat
atcattggtgggtatagatgtttatgtccaaaaggttatagaagagatatacgtggacga
tgtatagaaataaatgaatgtttgaacgacccgacgttatgccgacctggtggtttttgt
caaaacattgaaggtggatatagatgtgattgcactccaccctatatgagaagtgatgat
ggaaagttttgtcaagacaagagtatgggactatgtttctccaacgtggttgataatatt
tgtcaagcgtcatctggtaagatggagaaagtttctcaacgcgattgttgttgtagtggt
ggaggagctgcgtggggtactgattgtcgaacatgtcctagtctcaatacacctgaagga
aggagtttatgtacaggttataagaatagaacagttgacgaatgcaaatttatcgctgga
gtctgcaagaacggaaaatgtatggacactatagatagtttcagatgtatgtgtaatgct
ggatataaacttacgataaatggaaaaaaatgcgaagataaggacgaatgtaacgatggt
acatcaaaatgtccaaacggttgtagaaatacagatggtagttacgaatgtatctgtcct
aaaggttacgtcatcaacgaaagtaaaacacaatgcgtggacgaagacgagtgcagcact
ggtaaccacgattgtcaaaatggatgtgaaaacactgtgggaggatataaatgtatctgt
ccagctggttttcgaatggttgggaaaacatgcatcgataccgacgagtgtaccgagatt
ggaatttgtggactcggcacttgtcgtaacactgtcggtagttacgaatgtttatgcgga
agaggtttaaagtttgataaaacaaaaaaatcatgtgtttatatcactgacggtggagat
aaaaaaaatcctggcggatgtattggtgtcccacaaggctgtggtgcagcttgtccccaa
gggttttatcgatattataatcagtttggcggcacccaatgcgtagacgtgaatgaatgt
cgtcagaatatgtgcgggcagtcaacatgtatcaatactcttggtagctaccaatgcaca
tgcccgactggttacacatatcaaggaggccgttgccaagatacgaacgcgtgtgctcta
tcgccttgttcttttggatgcttgaataacagaggcgggtttgcatgtcaatgtccgcca
ggttacttcccagttactggaggacactgcgtggcaactggagcgacatgtttcagttgt
gatacatccgatataccgaaagaaggcgttccgttgggcggtaaacctacacagagtcag
ccaggtcatcaaagtgctataggtggtggctccgttcctttgagtggagggtcgaatgca
tacaacccccgacagccctacgttcctccttacacagggggaaggcaagaaactggtggg
tttagcggcttccctgcaggtggatttcagcaacagcaatacaaaccatacggcggtttt
gcgtaccgaaggagaagatcgacaagcaagcacacgaaaccagttcacgttgtgataagc
cataaaacaaagccacatgtttctctcatgaaactagtggcgcaacttaaagatatgact
ggtcatatggactataatataatcaaagggaatgcaagcttatttgagttggtgacgggt
acgaacggaaggacgagtttgcagtctactgattatcttattccgggaagttacaacgtt
gcgattaaaggagatattaagaaggataattcagaaatagaagaagaactaaaagctata
tatcgcgatgctggaaattttatattaaaagtgaatgttcgtgttctataa
DBGET
integrated database retrieval system