Hydractinia symbiolongicarpus: 130643369
Help
Entry
130643369 CDS
T09218
Name
(RefSeq) sodium channel protein 1 brain-like isoform X1
KO
K04843
voltage-gated sodium channel type XI alpha
Organism
hsy
Hydractinia symbiolongicarpus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
hsy04040
]
130643369
Ion channels [BR:
hsy04040
]
Voltage-gated cation channels
Sodium channel, voltage-gated (Nav)
130643369
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ion_trans
PKD_channel
GPHH
IQ_SCN5A_C
IQ
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130643369
NCBI-ProteinID:
XP_057305570
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(16559556..16589849)
Genome browser
AA seq
2076 aa
AA seq
DB search
MQNELEQEQEEEEHVNTKSPFLERVESNPRFFERVYSLAKMTTVVDRAAFDKKKQRVHWI
SKESNLDSDAIGDDSIPQNCTESEDDSINLCDDANLAYKFASKRSWNCDINNTIEQQQTT
SFSNDENFYYGNEFVKDNTWTNIGLQCYKEGTFFEDFDRADNKTFLVLASRLGKVYVYRF
NKSKSLWLFGPTNVIRKSIIYMITNQIFEFFVILTILVNCVFLALDNAPEEAEYVFTAIY
TTEMILKIIAKGFVFHSFAYLRDPWNWLDFIVVLLGYMTLAPGMMVNFSGIRTFRVLRAL
RTISAIEGLKTMVNALLKSMRMLSDVLILTAFFICVFALVGLQLFSGDFHNKCVKSNLTI
SENKTWLQEIKKTSNWYEPIQICGNVTGSMVCPSNYTCLPDVGENPNFGFTSYDNFGWAL
LTSFQLVTLDFWEDVYLHIGSSMGPWYVFYFMIVIFFGSFYLINLVLAVVAVSYQQETAH
NADLESQYEFLRQVASSYSLHKRILPKLLFDDPNIDSISNLSCVKQGPSVIILSSTSNTS
KATSNTIALGRVFHPKRARNQNKGSDTPKTIANQKLTSIINRVKLDRVKDKLRNDISTNK
TNAGNAPLTRKLNIASVRSVGRTLHVPTASNQTRRPTVTRRASNKAKTQTKKHDSLSVKK
PSLSSRVSSRLNADTQTQFPEPFADVDKEDLKPSQKLRLKVYNFVMSPWFELGVTLFILL
NTICLALEYDRMNPKFKQALDISNHTFTGIFIVEMVLKLIAFSPFGYVKSKWNIFDGLVV
ILSVIDLCIEIATTTDNGDFTIIRSLRLFRVLKLAQSWSTMRLLLSAIGRSLNALGNLTL
ILGIIVYVFAVVGTHVFGDSYKPEKFEDNQVPVWNFNNFGHSIMVIFRVLCGEWIEPLYD
CMQTTGTWAAAFFMPALIVGNFLVLNLFLALLLNSFADQAMEEELKKRNSMKSKLKWISS
TRKLARLQNAFKGQRIGPDAGSQMPSIAASNGAAKATMEEELQKSTLENKDVIGSTEFQN
GNAVPSTIVNLGIAQNKNENGLGAFRANISPTHSLYSCNSQLSSPKKENKNNNNNNNNNN
DAYGKLDPFCPSLPCCFFGDEKTKFKNETWTKFRMQIKTLIENKWFENGILVLIAASSLI
LVFEDIYLSTKPNLVKALDILNIIFCVLFFFEFVLKVIGLGVYTYVKNPWNCLDFVIVMV
SIVSVINIYTNSANNIKTLRSLRTLRALRPLRAVSRWDGMRIVVNSLLKAIPSIGNVLLV
CLVFWLIFSILGVQFFGGKFFKCVDHNGNRLDAKIIPNKTACLVSGYSWKNSHVNFDNAL
NGFLPLLQVATFEGWIEVMRDAVDATKIDEQPVRENNFVAYFYFVIFIIIGAFFILNLFI
SVIIDNFYRLKKQYDDGGTIEVFLTTEQKQWFSTVKKALTKKPKRIIHRPQNYYHAKIFD
LTISPKFETFTMFMILSNIFIMMFQHYQQPAEYTKMLHIVNIVFTVIFIIEMIVRIIGLR
HQYFTDKWNLFDFVIVILSVVGIILEYMNVILSVTPSVLRVARVLRIGRLLRYFNSAKGI
RRLLVALVISLPALVNIGALLFLILFIYAIIGMSNFGYVRKHGALNNVVNFETFGNSVLV
LFRLASSAGWNEVLDALMVQPPDCDPNYKNIPNGNCGSPWIAVVYLVTFILITYLIIVNM
YIAVILENFNQAHEQEEIGITDEDIEMFYAVWQLYDPLATQYIEFEKLPYLVANLGAPLG
IPFPNKVAVHNLNLPMRNDDKIHCIDVLQALLERFLGNMDQADTEHYDNMKKTIDQKLQA
AFPIRQKDDMKTTTMDRLKEVKAALVIQRHFRNWKAKTQKLGEPHKKYSNDSVFHSFISV
RGSKTPHTNRTRKKPIHRLLSDAKVSNRIRTSTITTISPILGVKIGELLNNGNSSIDSHR
LRRSRSARENSSGTNLNCLNVIERPRPVSCTADGKLQVTTDAQVYSSLAIRSDVVSDSEE
CPTNNANNIKISITNAESETNVDFEENITPFLDKVNVHYNITDSESSLPASIGNSSLEDL
SFVTISNSQQSLVPKVSKRRQDLALPHVRNNMITTA
NT seq
6231 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagaatgaacttgaacaggaacaggaagaggaggaacacgttaataccaaaagtcct
tttcttgaaagagtagaaagcaatcctcgattttttgaaagagtttattcattagctaaa
atgacaaccgtggtggacagagctgcatttgataaaaagaagcaaagagttcattggata
tctaaggaaagcaatttagattctgatgctattggcgatgatagcattcctcaaaattgc
actgaaagcgaagacgacagtattaatttatgcgatgacgctaatttagcatataagttt
gcatccaagagatcttggaattgtgatataaataacacaattgaacagcaacaaacaaca
tctttttctaatgatgaaaatttttattacggaaatgaatttgttaaggataacacgtgg
acaaatattgggctgcagtgttacaaggaaggcacgttttttgaggattttgatcgtgct
gataacaagactttcttggtacttgctagtcgactgggtaaagtttacgtatatcggttc
aacaagtccaaatcgttgtggttattcggaccgacaaacgtcattcggaaaagcataatt
tatatgataacaaatcagatttttgaattctttgtaattctaactatcctagtcaattgt
gttttcctggcattagacaacgctccagaagaagctgaatacgttttcactgcaatatac
acgacagaaatgattcttaaaatcattgccaaaggttttgtgtttcacagttttgcatac
ctacgagatccatggaattggttagattttattgttgttctgcttggatacatgacttta
gcaccaggaatgatggtgaatttttctggtataagaacatttcgggtgttgcgagctctt
cggacaatatcagccattgaaggtttaaaaaccatggtcaatgcgttattaaaatccatg
cggatgttatcagatgtgttaatactgactgcgttttttatatgtgtgtttgcacttgtt
ggacttcagctattttctggcgactttcataacaaatgtgtcaaaagcaacttgacaatc
tctgaaaataaaacgtggctgcaagaaataaaaaaaacatccaactggtacgaaccaatc
caaatatgtggaaacgttaccggttcaatggtatgtccgtccaattatacatgtctccca
gacgttggagagaatcccaattttggcttcacaagttatgacaattttggttgggctctg
ttgacgtcatttcaattagtcacgcttgacttttgggaggatgtatatttacatattggt
tcatctatgggcccctggtatgtgttttatttcatgattgtcatcttctttggttcgttt
tacttaattaacttggtgctagctgtcgtggctgtatcttatcaacaagaaactgcacat
aacgcggacttggagagccaatatgaatttcttcgtcaggttgcatcctcttactcgctc
cataaaagaattttaccgaagttgttatttgatgacccaaatatagacagtataagtaat
ttatcatgcgtaaaacagggtccaagcgtcattattttatccagcacttcaaacacatct
aaagcaacaagtaatactatcgcacttggacgtgtatttcatcctaaaagagctagaaat
caaaacaagggatcagatacaccgaaaacaatagccaatcagaagcttacaagtatcata
aacagagtaaaattagacagagtgaaagataaattaagaaatgatatatcaacaaacaaa
accaatgcaggcaatgcacctttgacgagaaagcttaacattgcaagtgttagaagcgta
gggagaacattgcatgttcctacagctagcaatcaaacgagaagaccaactgtaacaaga
agagcaagtaataaagctaaaacacaaacaaagaaacacgactctctctctgtcaaaaag
ccgtctcttagctctcgtgtatcaagtcgtttaaatgctgatacgcaaacgcaattccca
gaaccctttgcagacgttgataaggaagatttaaagccatcacagaagcttcgattaaaa
gtttataactttgtgatgagtccttggtttgagcttggtgtgactttgtttattttatta
aatactatatgcttggcgctggaatatgatcgaatgaatccaaaattcaaacaagctttg
gatatatcgaatcacacattcactggcatttttatcgttgagatggtgttaaagttaatt
gcgttctccccgtttggatatgtgaaaagcaaatggaatatatttgatggtctggtcgtc
atcctaagtgtaatagatctctgcattgagattgcaacgaccactgataatggcgatttt
accataatcagatcgttacgactgtttcgagtgttaaaactggctcaatcatggtccaca
atgcgattgctactatcagccatcggcaggagtttgaacgcattgggaaacctaacctta
attctcggcattattgtttatgtatttgctgtagtaggaacgcatgtatttggagatagt
tacaagcctgaaaaatttgaagacaatcaggttcctgtctggaattttaataactttggt
cactctataatggtcatatttcgcgttttgtgtggtgagtggatcgaacctttgtacgat
tgtatgcaaaccactggaacatgggctgctgccttctttatgccagctttgatcgttggt
aatttcttggttttaaatctgtttttggctttgcttttaaactctttcgccgatcaagct
atggaagaggaactgaaaaagcgaaactcaatgaaatcaaaactaaaatggatatcgagt
acacgaaagctggcaagacttcaaaatgcctttaaggggcaaagaattggtccagatgca
ggttctcaaatgccttctattgcagcatcaaatggagctgcaaaagcaacaatggaagaa
gaactacagaaatctacattggaaaataaagatgtgattggtagtactgaatttcaaaac
ggaaacgccgttccaagcacaatagtaaaccttggcattgctcaaaataaaaacgagaat
ggccttggtgcatttcgagctaatatatcaccaacacactctctgtattcctgcaattca
caattaagcagcccaaagaaagaaaacaaaaacaacaataacaacaacaacaacaataat
gacgcttatggaaaactagatccattttgtccgtctttgccttgttgcttttttggagac
gaaaaaacaaaatttaaaaatgaaacatggacaaagtttcgaatgcaaattaaaacttta
attgaaaacaaatggttcgagaatggaattttagtgttgattgctgcaagcagtctcata
ctggtgtttgaagacatttatctttcaacaaaaccaaacttggtgaaagcacttgatatt
ttaaatataatattttgtgtactgtttttctttgagtttgttttgaaagtgatcgggctt
ggtgtgtacacctacgtcaaaaatccgtggaattgtttggattttgttattgtaatggta
tctatcgtcagcgtgatcaacatttacacaaattcagcaaacaatataaaaacactgcgt
tcccttcgcacattgagagcattgagaccattacgtgctgtctcgagatgggatggaatg
aggattgtagtgaacagcttattaaaagccattccaagcattggtaatgtactgcttgtg
tgcctggtgttttggctcattttcagcatcttgggcgtccagttttttggagggaaattc
ttcaaatgtgttgatcacaatggaaatcgattagatgcaaaaataattccaaataaaaca
gcttgcttggttagtgggtacagctggaaaaattctcatgttaattttgataacgctttg
aatggatttttaccattactgcaagtcgccacatttgaaggttggattgaagttatgcga
gatgctgtcgatgcaactaaaattgatgaacaacctgtgagggaaaacaactttgttgct
tacttttacttcgttatttttataataatcggcgccttttttattctaaatctcttcatt
tccgtcatcattgataatttttatcggttaaagaaacagtacgatgatgggggtactatt
gaggtgttcctcacaacggagcagaagcaatggttctcaaccgtaaagaaggctttaacg
aaaaagccaaaaaggataatacatcgcccacagaattactatcacgcgaaaatattcgac
ttaacgatcagtccaaaattcgagacgttcacaatgtttatgattttgtcaaacattttc
atcatgatgtttcaacactatcaacagcctgcagaatacacaaagatgttgcatatagta
aacattgtctttactgttattttcatcattgagatgattgtgcgcatcattggattacga
catcaatatttcaccgacaagtggaacttatttgactttgttatcgtcattctttctgtc
gtgggcattattcttgaatacatgaatgtgatcctatcagttacacctagtgtactaaga
gtagcacgagtgctgagaattggtcgacttttacgttacttcaacagtgctaagggaatt
cgccgtctacttgttgcattagttatctcgctgccggctttagtcaacattggagcatta
ctttttcttatcctatttatatacgctataattggtatgtcgaactttggctacgttaga
aaacacggagcattaaacaatgttgttaattttgaaacatttggaaatagcgtattagtt
ttgtttcgattagccagttcggcaggttggaatgaggttttagatgcattaatggtacaa
ccgccagattgtgatccaaactataaaaacattcccaatggcaactgcggcagtccatgg
attgcggttgtgtatttagtgacttttatcttgataacttatttgatcattgtcaacatg
tacattgctgttattttggaaaattttaatcaagctcacgagcaagaggagataggaatt
acagatgaagatatagaaatgttttatgcagtatggcagctgtatgatccacttgcaact
cagtacatcgagtttgaaaagttaccttatctagtggcaaatcttggtgcaccattaggc
ataccttttcctaataaggttgcagtgcacaatctgaatttgccaatgaggaatgatgat
aaaattcattgcattgatgtactgcaagcacttctggaacgatttttaggtaacatggac
caagccgatacggagcactatgataacatgaaaaagactatcgatcagaaacttcaagcc
gcctttccaatacgacaaaaggatgacatgaaaaccacaacgatggatcgcttaaaagaa
gttaaagctgccttagtaattcagcgtcattttcgaaattggaaagcgaaaacacaaaag
ctaggcgaaccacacaagaaatactccaacgacagcgtttttcactcgtttattagtgtt
agaggaagcaaaacgccacacacaaacagaactcgtaaaaaacctatacatagattgtta
tcggacgcgaaggtctcgaaccgaatacgaacaagtacaataacaacaatctctcctata
ttaggagtaaaaataggagaactattaaataatggcaatagctcaatagatagtcaccgg
ttgcgacggtccagaagtgcgcgtgagaatagttctggaactaatctaaactgtttaaat
gtaattgaaagaccacgtcccgtgtcatgcacagcagatggtaaattacaggtaacaaca
gatgcccaggtgtacagtagtctcgccattcgttctgatgtcgttagcgattctgaagaa
tgccctacaaataatgcaaacaatatcaaaatcagcattactaatgctgaaagtgagact
aatgttgattttgaggaaaacattacaccgtttcttgacaaagtcaatgttcattacaat
ataactgattcggaatcttccttaccagctagtataggtaacagcagcctggaagatctg
tcatttgtaacaatttccaattcacaacagtcattagtgccgaaagtatcaaaacgaagg
caagatttggcactaccccatgtaaggaataatatgatcaccactgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
