Hydractinia symbiolongicarpus: 130647672
Help
Entry
130647672 CDS
T09218
Name
(RefSeq) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5-like
Organism
hsy
Hydractinia symbiolongicarpus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_6
NACHT
LRR_4
LRR_8
nSTAND3
bDLD3
TolA_bind_tri
AAA_16
DUF4202
AAA_22
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
130647672
NCBI-ProteinID:
XP_057309594
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(23153073..23164819)
Genome browser
AA seq
1309 aa
AA seq
DB search
MRNFLNHFPDITTLNGSEYSLKWSELLKILHGLNYNPPFNVNDLKTVSLDLQNNLLLRSI
VLANQIKLNYHDTELHELRNTNMSLKTQITSNVTNLEGKLLCMQNELWCSSLVSDDLLTQ
IKQIHMNMSQMQNDIRSMKKDVKGLSDRTELLEDDVCKLKGQQQHQYNDLSNRTDVLQED
MCKLKDDQRQCKANKVDFNNLTSVPALNVVAKMIGDDWKDLTKGLGISQNDNAAETTESK
MKECFEQAENRVYWKELKYELEMLRRQDIIKEITSKTLCTYGLNEYSNKLRDHYKKTLSH
WNIPSAFKSDSGRKHTTKERNEAYVDLIVGPWNEAHSTDHEHFLKSHSALKEKIEIKDIV
KESDGCVLIRGIAGIGKTSLIDQLVFQWADGKMLNDFDFVFKFTCRQINTITNTFPWEEL
VKRFFPNVYQDFFNELLENSSRVLIIVDGIDEFRYLDDIKEIAAGNPMHELGSIMHNIIL
ESSSLLPNSKVLVCGRPQACDIIKNLFLTSQQPKLIEVSGFDENSIGIYVKKFFKNNTEK
IKSLHVSLNEISNLKAMAHIPVYLHTICNVYASEKKLEDLNTTTKLNIAACLVFLRDHMR
EFKSKNNSLAKLSQDQNIQQMVRKASQFAYKSLQEKRIFFTQDEFENECSDCLTAIEQSG
IIEKVEGNDDGDFFQFKHLILQEFLSSVHIFHAAIDIKVCISKFENMRNCLPLVAGLRGI
LEDTYHGPNYIKRFVEDIRGPRNLCSVEGLFEDIDQELYLQTFFEYHNNNVDDVVKESFF
NINEASVRVRYHHLLNQLIYFLKTNKKVVPKKLTLSIEMLDGELLPNEMVELSPLLSSSV
VTTEHLKILDTHLTIDDISSISTDTIKLKKITLIDCELTDDHIKHLQSCIPYLKSLDVWD
NNTMTPTSMESISECVTEAANRNTNKLEKLNLSYCELTDDHIKYLQPCMPYLKSLDLTDN
NTMTPTSMECISKCVTEAFNKNTNKLEELELRDCLLTDDHIKYLQPCIPYLKSLDLSNNN
TMTPTSMECISKCVTEAFNKNPNKLEELKLSNCDLTDDHIKHLQPCMPYLKSLDLSNNNT
MTPTSMECISKCVTEAFNKNTNKLEELKLSNCELTDDHIKYLQPCIPYLKSLDLTDNNTM
TPTSMESISECVTEAANRNTNKLEKLNLRYCELTDDHIKHLQSCIPCLKSLDLTDNNTMT
PTSMESISECVTEAANRNTNKLEELNLRYCELTDDHIKHLQSCIPCLKSLDLTDNNTMTP
TSMESIWECVTEAANRNTNKLEKLKLNYCYLNNDYIKQLQPCIPYLKSY
NT seq
3930 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtaactttcttaatcactttcctgatattacaactctaaatggttctgaatattca
cttaaatggagcgaactgcttaagatattacatggtttaaattataaccccccatttaac
gttaatgatctaaaaacagtaagtttagatcttcaaaacaatttattactacgatcaatt
gttttggccaatcaaattaagttaaattatcatgacactgaattacatgaattaagaaat
accaatatgtcacttaaaactcagataacgtcgaacgtaactaatttggagggaaagtta
ttatgcatgcaaaatgagttatggtgtagttcccttgtaagtgacgatcttctaacacag
attaaacaaattcacatgaatatgtcacagatgcaaaatgatattagatctatgaaaaaa
gatgtaaaaggtttatccgatcgcactgaacttttggaagacgatgtgtgtaaattaaaa
ggccagcagcaacatcagtataatgatttatctaatcgcacagacgttttacaggaggat
atgtgcaaattgaaagacgatcaacgccagtgtaaagcaaacaaagttgattttaacaac
ctaacgagtgttcctgctttaaatgttgttgcaaaaatgattggagatgattggaaagat
ttgactaaagggcttggaatatcacaaaatgataatgcggcagaaacaactgaaagcaaa
atgaaggaatgttttgaacaagctgaaaaccgcgtttattggaaagaattaaagtatgaa
cttgagatgctgcgacgacaagatattattaaggaaatcacttctaaaactttatgcaca
tatgggttaaacgaatattccaataagttaagggaccattacaagaaaacgctatcacat
tggaatattccctctgcatttaagtcagattctggaagaaaacacacaacaaaagaacgc
aacgaagcttatgttgatttgatagttggtccatggaatgaagcgcattccactgatcat
gaacattttttaaaatcacattctgctttaaaagaaaaaatagaaataaaggatattgtg
aaagaaagcgatggatgtgttttaattagaggtattgctggcattggaaagacatcactt
attgatcaacttgtttttcagtgggcagatggtaaaatgctaaatgatttcgattttgtt
ttcaaatttacatgtcgtcaaataaacacaataaccaatactttcccatgggaagaactt
gtcaaaagatttttccccaatgtttatcaagatttctttaatgagttgcttgaaaatagt
agcagagttttaataatcgtagacggtattgacgaatttcgataccttgatgatatcaaa
gaaattgctgcggggaatcctatgcacgaacttggatctatcatgcacaacatcatatta
gaaagttcttcactactgcccaatagcaaggtgcttgtatgcggtcgaccgcaagcatgt
gatataatcaaaaatttatttctgacaagtcagcaaccaaaattgatagaagtttctggt
tttgatgaaaacagcatcggtatttacgtcaaaaagttttttaaaaacaacacagaaaag
attaaatcattgcatgtatcacttaatgaaatctcaaatcttaaggcgatggctcacata
cccgtttatttgcataccatatgcaatgtgtacgcatctgaaaagaaactcgaggatctt
aacacaactacaaaattaaacatcgcagcctgtttggtatttttgcgtgatcatatgagg
gaatttaaaagtaagaacaattctctagccaaattatcacaagaccaaaatatacaacaa
atggttagaaaagcatcacaatttgcttataaatcgcttcaagaaaaaagaatatttttc
acccaagatgagtttgaaaatgaatgtagcgactgtttaacagctatcgaacagtcaggt
attatcgagaaagtagaaggtaatgatgatggagacttttttcagtttaaacatttaatt
ttgcaagaattcttaagctctgtccatatctttcatgctgcaatagatataaaggtatgt
atttcaaaatttgagaatatgcgtaattgccttccattggttgctggattgcgtggaata
cttgaggatacctatcacggccccaattatattaaacggtttgttgaagatattagagga
ccacgtaatctttgttcagtggaaggcttgttcgaagatatagatcaggaattatattta
cagacattttttgaatatcataacaataacgttgatgatgtagtaaaagaatcttttttc
aatataaacgaagcttctgtacgtgttcgctaccatcatcttttaaatcaattgatatat
tttttaaaaacaaataaaaaagtagtaccaaaaaaactaacacttagtattgagatgttg
gatggtgagttattaccgaatgaaatggttgaattgtcaccactactcagttcttccgtt
gttactactgagcatcttaaaatccttgacacacatttaaccatcgacgatatttcttcg
atatcaacagacacaatcaagctaaaaaaaataactttaattgattgcgaattaaccgat
gatcatatcaaacatttacaatcatgtataccatatttgaaaagtttggatgtttgggac
aacaatactatgacgccgacctcgatggaatccatatcggaatgtgttacagaagcggct
aatagaaatactaacaagctagaaaaattgaatttaagttattgcgaattaaccgatgat
cacatcaaatatttgcaaccgtgtatgccatatttgaaaagcttggatcttactgacaac
aatactatgacgccgacctcaatggaatgtatatcaaaatgtgttacagaagcatttaat
aaaaatactaacaagcttgaagaattggagttacgtgattgcttattaaccgatgatcac
atcaaatatttgcaaccgtgtataccatatttgaaaagtttggatcttagtaacaacaat
actatgacgccgacctcaatggaatgtatatcaaaatgtgttacagaagcatttaataaa
aaccctaacaagcttgaagaattgaagttaagtaattgcgacttaacggatgatcatatc
aaacatctgcaaccgtgtatgccatatttgaaaagtttggatcttagtaacaacaatact
atgacgccgacctcaatggaatgtatatcaaaatgtgttacagaagcatttaataaaaat
actaacaagcttgaagaattgaagttaagtaattgcgaattaaccgatgatcacatcaaa
tatttgcaaccgtgtataccatatttgaaaagtttggatcttactgacaacaatactatg
acgccgacctcaatggaatccatatcggaatgtgttacagaagcggctaatagaaatact
aacaagctagaaaaattgaatttacgttattgcgaattaaccgatgatcacatcaaacat
ttacaatcatgtataccttgtttaaaaagtttggatcttactgacaacaatactatgacg
ccgacctcgatggaatccatatcggaatgtgttacagaagcggctaatagaaatactaac
aagcttgaagaattgaatttacgttattgcgaattaaccgatgatcacatcaaacattta
caatcatgtataccttgtttaaaaagtttggatcttactgacaacaatactatgacgccg
acctcgatggaatccatatgggaatgtgttacagaagcggctaatagaaatactaacaag
cttgaaaaattaaagttaaattattgctacttgaacaatgattatatcaaacaattgcag
ccgtgcataccatatttgaaaagttactag
DBGET
integrated database retrieval system