Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon): 120119633
Help
Entry
120119633 CDS
T09559
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
hsyr
Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon)
Pathway
hsyr03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsyr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120119633
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
hsyr03019
]
120119633
Messenger RNA biogenesis [BR:
hsyr03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
120119633
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120119633
NCBI-ProteinID:
XP_038995372
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEDKLSEYFGQYGELLLAVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEVKRALSREEQQTSARSGNVNQGRNSGSGGGNIRTKKIFVGGLPP
TLTEDGFRQYFETYGNVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKSFHDLDGKQ
VEVKRALPKDANPGGVSRTMSGGGGGGGYQGYGASGGNAGSYDGRMDSNRYMQAQSTGAS
FPPYGSSGYGAPGYGYGPANNAVAYGGYGNYSGAAAAYGGPAGAAYGNPNAGFASGPPGG
SRSSWGTQNPSGYGTVGYGNPAPWGTPNAGAGSGGTGSVATGQSPTGAAGYGNQSYGYGG
YGGNDESYGNAGYGAPGGRTGGTPNSNSGSGGGDMQGSAGYMGSGYGDASGNSGYRNASW
RSDSSQGSGNYGGIQASGQVGYGGGYGSAQGRQAQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagttgttcattggagggatatcatgggaaaccgacgaggat
aagctaagcgaatactttggtcaatatggagaacttttgctggctgttgttatgagagat
aaggttacgggtagacctcgagggttcggtttcgtcgtcttctcagatccatccgttctc
gatactgttcttcaagaaaaacacaccatcgatggtagaacggttgaggtgaagagggcg
ttatcaagagaggagcaacaaacttcggcgagatctggaaatgttaatcagggtagaaat
tctggaagtggtgggggaaatattaggaccaagaagatttttgttggagggttgcctccg
accttaacagaagatggatttcggcaatactttgagacttatggtaatgtaactgatgtt
gtaatcatgtatgatcagaacactcagcggcctcgtggatttggttttatttcattcgac
agtgaagatgcagttgatagggttttgcacaagagttttcatgatttggatggcaagcaa
gttgaagtgaagcgggcccttcctaaagatgctaatcccggtggggttagccggacaatg
agtggtggtggtggtggaggaggttaccaggggtatggtgcttctggtgggaatgcgggt
tcttatgatggtcgtatggactccaacaggtacatgcaagcccagagtactggagctagt
tttccaccttatggctcatcaggatatggtgcacctggttatggttatggtcctgctaat
aatgctgttgcatatggtggttatgggaattatagtggtgcagctgctgcttatggtggc
cctgcaggtgcagcgtatgggaatcccaatgctggttttgcaagtggccctcctggtggc
tcaagaagttcatggggtactcaaaatccttcaggttatggtaccgtgggttatggaaat
cctgctccttggggtaccccaaatgctggtgctggtagtggtggtacaggttcagtggct
actggtcaatctcccactggagctgcagggtatgggaatcaaagttatggatacggtggg
tatggaggaaatgatgaatcttatgggaatgcaggctatggtgctccaggaggtcgaact
ggtggtactccaaatagtaattctggttcaggtgggggagatatgcaagggagtgctggc
tacatgggaagtggatatggcgatgcaagtggaaattcaggttaccgaaatgcatcatgg
aggtcagattcatcacaaggttccggaaattatgggggtattcaggcaagtggacaagtc
ggttatggtggtggatacggtagtgctcagggtcgacaagcacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
