Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon): 120196251
Help
Entry
120196251 CDS
T09559
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
hsyr
Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon)
Pathway
hsyr03015
mRNA surveillance pathway
hsyr03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsyr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
120196251
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120196251
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
hsyr03041
]
120196251
Spliceosome [BR:
hsyr03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
120196251
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120196251
NCBI-ProteinID:
XP_039054024
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
433 aa
AA seq
DB search
MYGQGGEADPPSYGGGHGGYGGDAGYGGRGCGRGGGGGYGRSSQNRGGGGGYQGGDRGGR
GGGGRGGGRGGGRDGDWLCPNPSCGNLNFARRVECNKCGASSPVGSGDRGSSGYNRGGGG
GVYDANRGGRGDGVRGGYDIGRSNNYGGRGGNYDNKSGGGRSGSYGGSQGGEDGGYGHVP
PSAPSSYSGGAGGSYSPPPNAYDGNTNSGMGSVPPPTSYTGGPTSYPPSYGGPAGGYGDE
GLNDARTGGWGGHPGGCDSDYVSGGPRHQGGGCGGPFDAPGKIKQCDDNCRDSCDNTRIY
ISSLPPDATIEELRDLFGGIGQVGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEKGNPKGDAVLTYED
PQAAHSAGGFFNNHVMRGYTISVAMAEKTAPKVYDYGGGRGGYGGGGGRGDRHRDGGSGP
HRHHYGGNRSRPY
NT seq
1302 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacggtcaaggaggcgaagctgatccaccttcatatgggggtggtcatggtggttat
ggaggggacgctggttacggtggccgtggttgcggcagagggggaggtggtggttacggt
cgcagttctcaaaatcgcggaggcggtggaggctatcaaggaggagaccgtggtggaaga
ggtggcggtggaagaggtggtggccgtggaggaggcagagatggtgattggctttgcccg
aaccccagctgtgggaacttgaactttgcaagaagagttgagtgtaacaaatgcggtgca
tcctctcctgtgggttccggtgatcgtggtagtagtggatacaacagaggaggtggtggt
ggggtatatgatgctaatcgtggtggtagaggagatggggtgagaggtggatatgatatt
gggaggagtaacaactatggaggcagagggggaaattatgataataaaagtggtggtggt
agaagtggttcctatggaggtagtcaaggcggggaagatggtgggtatggtcatgttcct
ccttcggcgcccagttcttatagtggcggtgctggtggaagttactcaccacctcctaat
gcatatgatgggaatacaaattctggaatgggttcagttcctccacctacaagctatact
ggtggaccaacatcataccctccgtcttatggaggacctgcaggtggttatggtgatgag
ggtttgaatgatgcaaggaccggtggttggggtggacatcctggtggatgtgacagtgat
tatgtgtctggtggtcctcgacatcagggaggtggttgtggtggtccttttgatgctcca
ggtaagatcaagcagtgtgatgacaactgcagggattcttgtgacaataccagaatctac
atatcaagtttgccacctgatgctactattgaagaattaagagacctttttggcggaatt
ggacaagttggaagaattaagcagaagcgtggctataaagatcagtggccatggaacata
aaaatatacactgatgagaaaggaaatccaaaaggtgacgcggttttgacttatgaagat
cctcaagctgcacactctgctggcggtttctttaacaatcatgtcatgagaggctataca
attagtgtggcaatggctgagaagactgcccctaaagtatatgattatggaggcggtaga
ggtggctatggcggtggtggtggccgtggggacaggcacagggatggaggttctgggcca
catagacatcactatggtggaaaccgttcacgtccatactga
DBGET
integrated database retrieval system
