Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon): 120201206
Help
Entry
120201206 CDS
T09559
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
hsyr
Hibiscus syriacus (Rose-of-Sharon)
Pathway
hsyr03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hsyr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
120201206
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
hsyr03019
]
120201206
Messenger RNA biogenesis [BR:
hsyr03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
120201206
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120201206
NCBI-ProteinID:
XP_039057794
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
450 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETDEDRLNEYFGQYGDILQTVVMRDKVTGRPRGFGFVVFSDPSVL
DTVLQEKHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSARSGNFNQGRNSGGDGNVRTKKIFVGGLPPT
LTEDGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLHKNFHDLDGKQV
EVKRALPKDGNPGGVNRTSSGGSGGFVGYQSFGSSGGNSSSYDGRMDSNSYMRAQGTGAG
FPPYGSSGYAPGYGYGPASSGVGYGSYGNYGAAGAGYGAPAGAAYGNPNAGYVSGPPGAP
RSSWGAQNPTGYSGMGYGNATPWGAGGPGSAATGQSPTGAAGYGNQSYGYGGYGGSDGPY
GNAGYGAAGGRSGGTPNSYAGLGGGDLQGSGGGYMGSGYGDVNGSSGYGNASWRSDSSQG
SGYGGAHANGTHGGQGGYGAGYGGAQGQQQ
NT seq
1353 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagttgtttatcggtgggatatcatgggaaacagacgaggac
aggctaaacgaatactttggtcaatacggagacatcttgcagactgttgttatgagagat
aaggttactggtagacctcgaggttttggattcgttgttttctcagatccgtccgtcctc
gatactgttcttcaagagaagcacaccatcgatggtagaacggtcgaggcaaagagggct
ttatctagagaggagcagcaaacatctgccagatctggtaattttaatcagggtagaaat
tccggaggtgatggaaatgtcaggaccaagaagatttttgttggagggttgcctccgacc
ttaactgaagatgggtttcgtcaatactttgaggcttatggtcatgtgaccgatgtagta
atcatgtatgaccagaatactcaacggcctcgtggatttggttttatctcctttgacact
gaagatgcagttgatagggttttacacaaaaattttcatgatttggatggcaagcaagtt
gaagtgaagagggcccttcctaaagatggcaatcctggtggggttaatcgaacttcgagt
ggaggttctggtggttttgtaggttaccagagctttggttcatctggtgggaattcaagt
tcttatgatggtcgaatggattccaatagttacatgcgcgcccagggtactggagctggc
tttccaccttatggctcatcaggatatgcacctggttacggttatggtcctgctagtagt
ggtgttggctatggtagttatggcaattatggtgctgcaggtgctggttatggtgcccct
gcaggtgcagcttatgggaatcccaatgctggttatgtaagtgggcctcctggtgcccct
aggagttcatggggcgctcaaaatccaactggttatagtggtatgggttatggaaatgct
actccttggggtgctggtggccctggttctgcagctactggccaatctcccactggagca
gctgggtacgggaatcaaagttatggatatggtggatatggaggaagtgatggaccatat
gggaatgctggatatggggcagctggaggtcgttctggtggtactccaaatagttatgct
ggcttgggtgggggagatctacaagggagtggcggtggttacatgggaagtggatacggt
gatgtaaatggaagttcagggtatggtaatgcatcatggaggtctgattcatcccaaggt
tctggttacgggggtgctcatgcaaatggtactcatggaggacaaggcggttatggtgct
gggtacggtggtgcacagggccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
