Hymenobacter tibetensis: MTX78_13395
Help
Entry
MTX78_13395 CDS
T08236
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
htb
Hymenobacter tibetensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Big_9
Cadherin_5
CshA_repeat
DUF3244
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UOG73120
LinkDB
All DBs
Position
complement(3335149..3339417)
Genome browser
AA seq
1422 aa
AA seq
DB search
MKQTFTELFAKPFCWKSQKVYAGILVAYCLAGPKQAQAQDYFIKDDFRTNSAANFRVGGN
ATLTGTSGTDAGGYLRLTTNAGNQRGFAISTQTFNPVNGFSISFEYFSYGGTTTDSQQAK
ADGISLFLIDGTQVTSASAFVPGGYGGSLGYAPLVAGSINTPGATGGFIGIGLDEFGGYS
AGIEGKNGGPGRVISGVAIRGAGNATTSNTAYPYITGKATGTYTISGGTRTLNPGGFGID
VATSRAQNTSPDYRRVFVDVFPISKGSTTYKVTVRIQNGPSTVTTVIDNYTFTSATQVMP
ASLRIGFAASTGGSTNFHEVRDLQIVRPPVANNDVVFTSYRSNTPVTFSPLTNDEASGSS
LDVATLDLDPTTVAIDRNLSVPEGTFAIGTDGAVTFTPSGNFAGTFTVPYTVQSILKSIS
NQGTITINVTGADIATTLNGPTAVNVGSSVTYTTTTSNVGIEAGANVVPKLVLTGDISIT
QRPANSSVTTSGTGTAKVTTITFAAIPSLSPSDTPIENPVAFTLNSGSVTGASSFTTAVP
DPSTANNAANLATGGYSLTGISNGCGGPGKDGPGPIGALASDGSEIVVNTYFQGQASVGV
GATSITLAGSGTGYDTPIMPGDLVLVMQMQGATINSTNTSSYGALSNVTAGVYEYAVAAP
NTNVSYAGGGTLILMKGLTNAYTAAAATSSAGPQRFQVIRVPQYSSYNAAGTATTTGAAW
NGTTGGVVVLDVVGVTTFGTTTTAFNMTSKGFRGGGGVRFAGISTGYSSNDYVNIAGDKG
LAGAHGSKGEGIVGTPRYVRQTNTAFLDLGQEAYPGGSVGRGAPGNAGGGGTDAAVTTNT
GNTGGGGGSNAISSDNGGNGGNYSTATVVGGLGATAPGLSAGGRLFMGGGGGAGSSSTLG
AENGNGANGGGIIILRTGTVSGTGVMNVRGGNGGSTTANGAGGGGGGGSVLITSSNSLAT
VTINADGGNGGNTTSATTVSPLLGAGGGGSGGVVYYNAPTDPPTVRTAGAAGTARATTNG
NATTNGSGPGISGPEIQYTATGISATLGCRPDLDVFLRTNTPQVVRGQAMQATYTLTVVN
NGGAATDVSALVTLANGTNTTTGGSATGTASGLFKYKSTSAATITLADKTVVALTTTTGA
LNSYSAPDAASSAPAFSGIDIPAGAILTITFQVDMATTAVNNTPYQSGAQVVYLDPTRST
ASRMITPGGTYQSGTTAAPGTNYLSTSSTGEDVSIARPLPVELKQFSALAIRQDAALTWV
TASEKNSDRFEVERSLDGLHFEVIGSVKGQGYSNREHTYRYTDASAAQRAVSSIVYYRLH
QIDADGADTYSGVEAVRFEKSVQTAIRLYPNPAQAQATLDLREVPAGNYQVQILDMTGRV
LSQQTLSGKQVYELSTTALAPGSYVVQVSGNSVQLALRLLHN
NT seq
4269 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaacttttactgaactgtttgccaaacctttttgctggaaatcgcaaaaagta
tatgctggaatcctagtggcatattgtctggccggaccgaagcaggcccaagcacaagac
tactttatcaaggatgacttccgcactaatagtgcagccaacttccgggtaggaggtaat
gccacgctgaccggcacctccggcacggatgccggtgggtatctacggctgactactaat
gctggcaaccagagggggtttgctatttccacacagacgttcaatccggtaaacggcttc
agcatctcattcgagtacttttcctacggcggcaccaccaccgacagccaacaagcaaaa
gctgatggtatcagcctgttcctaattgacggaacccaggtgaccagtgccagtgcgttt
gtgccgggtggttatggcggctccttaggctacgcgccgctggtagcaggatctatcaac
acaccaggtgcaacgggaggattcattggcatcggcttagacgagtttggtggttactcc
gcaggaattgagggtaaaaatggagggccaggtcgggttatttccggagtggctatcaga
ggtgctggcaatgctactaccagtaatacagcttacccttatataacgggcaaagctact
ggtacatacacgattagtggagggactagaacgctgaatcctggcggttttggtattgat
gtggctacttcccgagctcaaaacacttctcctgattaccggcgggtattcgtcgacgta
ttcccgatcagtaaaggctccactacctacaaggtcacggtgcggattcagaacggtcct
agtactgttacaacggtgatagacaattacactttcaccagtgccactcaggttatgccc
gccagcctgcggattggctttgcggcatctacaggtggcagcaccaactttcatgaggtg
cgggacctgcagattgttcggcctcctgtagcgaataatgacgttgtgttcacctcgtac
cgtagcaatacgccggtaacgttcagccctctgaccaacgatgaggcttcaggcagctct
ctcgacgttgctacccttgatttagacccgacaacagttgctattgacaggaatttgtca
gttccggagggtacgtttgctatcggtactgacggggcggtgacgtttaccccctctggc
aatttcgcgggcacattcacggtgccttacacagtgcagagtatcctgaaatctatttcc
aaccagggtacaatcaccatcaacgttacaggggctgatatagcaaccacgctcaacgga
cctactgccgtaaacgtagggtcttcggttacttatactactaccacgtccaacgttggt
attgaagcaggcgccaatgtggtgccgaaattggtgctaacgggggacataagcatcacg
caacggcccgctaattcgtctgttaccacgtctggtacgggtaccgccaaggtgacgacc
atcacttttgctgctatcccctccttgtcgccttccgacacgccgatagaaaacccagta
gcatttaccttgaactcgggcagtgttacaggagcatcttcctttactactgcggtgccc
gacccaagtactgcaaataatgcggccaacttagccactggagggtacagcttgaccggc
atctccaatgggtgcggtggtcctggcaaagatggccctggtccaataggcgctcttgcg
tcggatggaagcgaaattgttgttaatacctacttccaggggcaagcatctgtgggggtt
ggagccacgagtattacgctagctggttctggtacgggatatgatacccccatcatgcct
ggcgatttggtgttggtaatgcagatgcagggggcaactataaattcaactaataccagc
agctacggtgcattaagcaatgtcacagcaggtgtgtatgagtacgcagtggcagcgcct
aataccaatgtctcttatgctgggggaggtacattaatcttgatgaaaggcttgacaaac
gcatatactgcggcagcagctacatcatcggctggtccacagcgttttcaagttattcgt
gtacctcaatactcctcatataatgctgccggtacagctaccactaccggggcagcttgg
aatggcacgactggtggagtggtggtgcttgacgtagtaggtgtcaccacctttggcact
acaacgacggccttcaatatgactagcaaggggttcagagggggcggaggagtacgattt
gcaggcatctctaccggatatagcagcaacgattatgttaatatagctggtgacaaagga
cttgccggagcacacggatctaagggtgaaggaatagttggaaccccgcgctatgtacgt
caaaccaacactgcatttcttgatctgggtcaggaagcctacccaggaggcagcgtcggt
agaggagcacccggcaatgctggagggggaggcaccgatgcagcagtaaccactaatacc
ggcaatactggcggcggtggcggctctaatgccatcagtagcgacaatggcgggaacggc
ggtaattatagcacagcaaccgtagtgggtggattaggagcaacggctcctggcctctca
gcagggggacggctgttcatgggcggtggcggtggagctggtagcagcagtacgttgggc
gcagaaaatggcaatggtgccaacggaggaggaattatcatcctgcgtacgggcactgtg
tcaggcactggtgttatgaacgttagaggtggcaacggcggtagcactacagctaatgga
gctggcggcggcggcggcggtggcagcgtattaattactagttccaattcactcgctact
gtaacaatcaacgccgatggtggaaatggtgggaacaccacttctgccactactgtaagc
cctttactgggagccggtggcggcggtagcggaggggtggtgtattataatgctccaaca
gatcctccaacggttagaacagcaggtgcagcgggtactgctagagctactacgaatggt
aatgcaaccacaaacgggtcaggtccgggaatttcgggtccggaaatacagtacactgca
acgggtatttcggcaactctcggttgccgccccgatctggacgttttccttcggacgaat
acgcctcaggtcgttcgtggccaagctatgcaagctacctataccttaaccgttgtcaat
aatggcggggccgctacagacgtaagcgccctggtaacgctagccaacggtaccaataca
acaactggtggttctgctaccggtaccgcaagtgggttgttcaagtacaagagcacttcg
gccgccaccatcacgctggccgataaaacggttgttgcactcactaccacaacaggcgca
ctcaattcctacagcgcacctgatgcagcatcgtctgctcctgctttcagtggaatcgat
attcctgccggggctattttaaccatcacctttcaggtagatatggccactactgctgtc
aacaatacgccttatcagtcgggtgctcaggtagtgtaccttgatcctacacggtcaacc
gctagcagaatgataacgcctggtggtacttaccaaagtggcactacggctgctcctggt
acgaactacctaagcactagttccactggggaagacgtatccattgcccggccgttgccg
gtggagcttaagcagttcagtgcgttggctatccgccaggacgccgcccttacgtgggta
acggcttcggaaaagaacagtgaccgtttcgaagtggaacgctcgctggacgggttgcac
ttcgaggttattggttcagtgaaggggcagggatacagcaaccgggagcacacctaccgc
tacacggatgcaagtgctgcgcaacgcgccgtgtcttcgattgtctactatcggttgcac
cagatagatgctgatggtgccgatacttacagtggagtggaggctgtacgcttcgagaag
agtgtgcaaacggccatccggctgtatccaaaccccgcccaagcccaggccacactcgat
ctgagggaagtaccagccggcaactaccaagtacagatcctggatatgaccggccgcgtg
ctcagtcagcaaaccctgagtggcaagcaagtctatgagctgtccactacggcactcgct
ccgggctcctatgtggtgcaggtaagcggcaacagtgtacaactagcgctgcgcttgttg
cacaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
