Hymenobacter taeanensis: HMJ29_06500
Help
Entry
HMJ29_06500 CDS
T08050
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
hts
Hymenobacter taeanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
Beta_helix
Por_Secre_tail
Big_9
NosD
SdrD_B
bMG3
DUF5001
SpaA
DUF1416
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJX46607
UniProt:
A0A6M6BEG4
LinkDB
All DBs
Position
1524978..1532552
Genome browser
AA seq
2524 aa
AA seq
DB search
MPVSNVPAVAINPLDFSRQPNGEDWKAHANLLVRGTNISTSGFTSSVTGTNTNTFAIATN
QALLVPSLVWQQNPQGVQPADSKSQVTFTFDRPVNNLSMAVLDIDRDLTLAGSFIDEVTF
DGYTTDAATTPIALTATNFTLANAGVNQFIGNNTVQGIGTSNSDVNATTVLTFSSPVKKL
TLTFRNAAPYVDANTARTHTIGLTSFIWSAQADVTTTLRAQASPVVAGAQGQFNATFTNN
GVDGAAQGVVAQIQLPSGLANVVATNGGSYNSNTGLVTYPNTTSLDIGASLTSTITFTTP
TSGTVTATSAISTTSDEGTNTAPNSASASINATPIVLSGTIFDDVNYGGGVGRNYTEANA
AAVGFTSGAIRQAGAAVELYDANGNFVATTTTNASGLYSFNVPSAATYTVRVVNSTVNSV
RTLNTGFTTANIQAVQTFVNGVTNRVGGEAPEKQDAAANTGSQTLASLTTGTGSTGLTPQ
SITSVTVPAAGTTGVDFGFNFDLVTSTRDAGQGSLRQFIINANALANTNLAQSGLTAGRE
TSIFMIPSTTATPGLRAGLATGLTNGVAVISPATVLPTISDANTAIDGTRQTAIVGNTNN
IALGNGGTVGVNATALSQLNGPEVQLVGPGATSAFNGLTLAANNTTITGLAIYGFGNSAS
NTTSGNIYVTTGATSGTLITGNVIGTTARSFSDPGATTRSAAHGIFLQSSGDVTTLFSGT
ISNNLIGYNATGGIELIVNSNGNGTSTGYFVEGNEIRGNAISNSSSDGIRLGVNGGVVRN
NLFAANQGPGVDLAGSTGNALVTNNTISNNGLNGGGQTPGVRLQGTANTISQNIISNNYG
AGILAQPSTTNSTFSQNSIFGNGSVLTSAGGAASGQIGIDLESSTDNTNQGTSPFVTLND
NGDADTGANGLTNMPIVQTATIRNGMLYLTGFARPGALLEFFISAPNAASLNAVGANFGQ
GQTYLFSRTEGTTGNPSATLNDLDATTGNYTGLINGFNQGTETGQNRFSYAIALSALTSG
QQAALTAGTAKLTATATQVTLVNGNQGTSEFSGNAPVQLAPVANNDFASTTPGTAVTLSI
TDNDQNGIDGGTVAVNGQAAGGTTAVTVTGGTFTFLGNGQVSFVPAAGFTGVATVPYTVN
NTSGITSNTAFISVAVSGTTFNLATSFSTVPAATVNAGSSVSYTVVSSNPGTVAATNVIE
TVQLPAGLSTGFTVGGSAGTPNASTGITTFAGGSYNQNTGLLTLTIGNLAANGGSASTAL
TFPAPLNSPLVVTANISGAGGVETTTTDNTIVSKIDITPRFDVTTAIGGPTTVTAGNEVT
YTVVTNNLSGTTTPANVNSISPAVNVEQTVTLQGNLTGAGIYASNGGMVAYNSTLNVTVV
TFPAIGVLAAGQSQVNTITFTAPNTSFSAPTAVVTSGFTGSNTGDLNSPTAGTDNNTAQL
NGAATRPTITPATRTGTAANVYTNISASAANVAPGANITLTIMAGNAGAAAASGVQQTIS
LPTGLTFSNLGGGSYNAVTGVLTFPALTSPLAAGATQPYTVTFAAPQQGFVLATAAVTTT
TPDAIPADNLAQTKVEVTPLVDVATTLAGPVVALPGQTVSYTVTTASNGPAAADGVVQTV
QLPTGLTNVQLNSLSAGSQYNATTGTLTIRFPDPLATGFSQTNTISFTAPAGAANLNVSA
AVSTSSAETVVTNNAATVVTALTPAADVAIQVTGPPTVTVGNPVPYVVSTTNNGAAVATS
VIPTLQLPAGLGTANVTFPAGAATGSYNNATGLVTFSTVAVLASGATTSSVIVVTMPDAS
QLSAVGQVTTTSTDTNPTNNYATAATTATTVTTATADLRTTLTPATTTVNAGSSVTLTAT
FSNLGAGTATNVVPQLLLQPGLTGVTVTDNGTVRNADYNATTGVVTFQSTAAALASLASG
SSLPGTYTVSFNAPATGPVSAVASIYSATSDGVLSNNTASATVNVTPQADAQTSIAGPLT
AQPGSRVTYEITTSNNSTAVSPSTNVVQTVTIPGTPANLTFSAGASSAVVGANTVVTFPT
VASMAPGVAGAVTNFISFTTPATATTLNITANVTSAADINISAASNSASISTIANNAPVA
YNVVNNLLPAGEVRFNQVIENTATTAQPISPLVATDVNAGQTLSYTLASVPTSGGLYIGT
STTALISGATISASEAGQLRYLPVSGFIGNAFFTYTATDNATPTSATSNVALYTIAVGQD
ANSSYTTTPVKGGASPYLTGDVLANVFDANSGTYNSATPQAVVKDGVSSATLVTTGLPAG
VSGSFPPGVDFNTTNPNQIGQIVVTNNRLLVAGTYTVQIRTIDANGGTNTQNVTFTIGVR
PLPVQLASFTAKAAGPNAELTWRTAQELRNDHFVVERSFDGRSFSALGQVQGQGTTTLAT
DYQFLDAQVAAKAAGQTVYYRLRQVDTDGTSSFSAVQAVAFTKTEVAISLYPNPASTSTT
LNLTSLPQGAYQVSIIDAVGRVVRQARYEGGTTPTLSVQELPVGSYQVLISGASFNKSLR
FIKE
NT seq
7575 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcctgtatccaatgtacctgctgtagccatcaatccacttgatttcagccgccagcca
aatggcgaggactggaaagctcacgcaaacctcttagtacgcggtaccaatattagcaca
agcgggtttacctcgtcggtaactggcaccaataccaacacgtttgcaatagcaacaaac
caagcgctgcttgttccttcactggtatggcagcagaacccgcagggtgtacagccagcc
gacagcaagtcgcaggtaacattcacgtttgaccgtccagtcaataacctatcaatggct
gtattggatattgaccgtgacttaacgcttgctggtagcttcattgatgaggtgaccttt
gacggttacaccacagatgcagccactaccccaatcgccctgacggctaccaattttacg
ctagccaacgctggcgttaatcagtttatcggcaataatactgtgcagggtattggcacc
agcaactccgatgttaatgccactacggtattgacgttctcttcgcctgttaaaaaactg
acgttaaccttccgaaacgcggctccttatgtggatgctaacaccgctcgaacccataca
attggcctaacctcattcatctggagcgcgcaggccgatgttacaacaacactcagggca
caggcttcgcccgtagtcgcgggagctcaaggtcagttcaacgctaccttcacaaacaac
ggtgtagatggggcggcccaaggagtagtggcacagatacaattaccttctggcctagcc
aatgtagtggctacaaacggaggcagctacaatagcaatacaggtctggttacgtatcca
aacaccacttctctggacataggagcttctctaacttcaactattacgtttacgactccg
acttctggaacagtaaccgctacctctgctatcagcacaacgtctgatgagggcaccaat
accgctcccaactcagcttccgctagtatcaacgcaaccccgattgtactgagcggcaca
atcttcgatgatgttaactatggtggtggtgttggacgcaactatacagaagcaaatgcg
gctgcagtaggctttacttctggcgctatccggcaagcaggtgcggctgttgagctatat
gatgctaacggcaattttgttgctactactactactaacgcatcaggcttatacagcttt
aatgttccctccgctgctacctatacggtgcgcgtagtaaactctaccgttaactctgtt
cgaaccctcaataccggctttactactgccaatattcaggcagtgcaaaccttcgtgaac
ggcgttaccaaccgggtagggggcgaggcccccgaaaagcaggatgcagctgctaacacc
ggctctcaaaccttagctagtcttactacaggcaccggaagcacgggcttaacgcctcaa
tccatcactagtgtaaccgtaccggctgctggcaccacaggtgttgattttggtttcaat
tttgatcttgtaacttccacgcgagacgcgggtcagggctcgttacgccagtttattatc
aacgccaatgccttggctaataccaacctggcgcagagtggtctaactgctggtcgtgaa
accagcatttttatgatcccctcaaccacagctaccccgggtttgcgggctgggttggct
acgggccttaccaatggcgttgctgttatcagcccggccacggtactgcctaccatctct
gatgctaatactgctattgatggcacccgccagactgctattgttggcaacaccaataat
atagctctgggtaatgggggcaccgtgggtgtaaatgcgacggcgctaagtcagctaaac
ggcccagaggtacaacttgtgggccctggagctactagtgcatttaacggcttaacgtta
gctgccaacaacacgactataacaggcctggctatttatggctttggcaactcggccagc
aacactacctcgggcaacatttacgtgactactggtgctactagtggtaccctgattacg
ggcaacgtgattggcaccaccgcgcgtagcttctctgaccctggcgctactacacggtca
gcagcccacggcattttcctgcagagcagcggcgatgttaccacccttttcagcggcact
atctcgaataacctgattggctacaacgctaccggaggaattgaactcattgttaatagc
aacggcaacggtacttctacaggttatttcgtagaaggcaacgaaatcagaggcaatgct
attagtaattcctcttccgatggtattcgtttgggagtgaatggcggcgtagtgcgcaat
aacctgtttgccgccaaccaaggcccaggcgtagatttggcaggtagcaccggtaatgct
cttgtcaccaacaacaccattagcaataatggcttgaatggcgggggtcagactcctggc
gtgcgcttgcagggtacggctaacactatcagccagaacatcatcagcaacaactacggc
gccggaattctggctcagccgtctactacgaatagcactttcagtcaaaactctattttc
ggcaacggctccgtactaacctccgccggcggagcagctagtggccaaatcggcattgac
ctagagagtagcacagataatactaaccagggcacttcgcctttcgttacgctgaatgac
aatggtgatgccgacacgggcgccaatggcctaactaatatgccaattgttcagactgct
actatccggaacggcatgctttacctgacgggttttgcccgcccaggtgcgctgttggag
ttcttcatttccgctcccaatgcagcttctctgaatgccgtcggcgctaacttcggtcag
ggacaaacctacttgttctcccgcaccgagggcacgacaggcaaccccagtgctactcta
aacgacttggatgctactacgggtaactataccgggctgattaatggatttaaccaaggt
acagaaaccggccaaaatcgcttttcttatgctattgcgctttcagccctcacttctggg
cagcaagcggctctcacggctggcaccgcaaagcttactgctactgcaacccaggtgaca
ctggtaaacggcaaccaaggcacctccgaattctcaggtaatgcacccgttcaactagct
ccggttgccaacaacgatttcgcttctactactcccggaaccgccgttacgctctcaatt
accgataatgaccagaatggcattgatggtggcacagtagcggttaacggccaagcagcc
ggtggcactactgctgttacagtaacgggcggcacgttcactttccttggcaacgggcag
gtaagttttgtaccagctgcgggctttacaggggtcgctactgttccgtacacggtgaat
aacacctcaggcattacttccaacacggctttcatctcagttgccgtatcgggcactacc
tttaacctggctaccagcttctccacggtgcctgcagccacagtaaacgctggttcttct
gttagctacacagtagtatctagcaatcctggcactgtagctgctactaacgtaatagaa
acagtacagctgccagctggtctgagcacgggcttcactgtaggcggttccgcgggtaca
cctaatgcttctacaggtattaccacctttgcaggcggcagctacaaccagaacacgggc
ttactgacgcttactatcggcaacctagccgctaacggcggttcggcttctactgcctta
acgttcccagccccgctcaatagccccttagtggttaccgctaatatcagcggtgctggt
ggtgtcgaaacaaccactaccgacaacacgatagtatctaaaatcgatatcacgcctcgc
ttcgacgtgacgacggccatcggtggtcccacgaccgtaaccgctggcaacgaggtaacc
tacaccgtggttaccaataacctcagtggtaccaccacgccggctaacgtcaactccatt
tctccggccgtcaatgtagaacagacggttactctgcagggtaaccttacgggtgcgggc
atttacgcttccaatggtggcatggtggcctacaactctacgctgaacgttacggttgtt
actttccccgccattggggtattggctgccgggcagtcgcaggtaaacaccatcaccttc
acagctcccaacactagtttctctgctccgacggctgtagttacttcaggcttcaccggt
tccaataccggtgacctgaactctcctaccgctggcacagacaataatactgctcagctg
aacggggctgctactcgtcctaccatcacacccgccacgcggacgggtacggcagccaac
gtctacacgaacatttcggcttcggcagctaatgtggctccgggtgctaacatcaccctc
accattatggcaggcaacgcaggcgctgccgcggctagtggcgtgcagcaaaccatatct
cttcccacaggactgaccttcagcaacctggggggcggttcttataatgctgtcacgggg
gttctgaccttcccggccctgacgtcgccgctggcggccggtgctacgcaaccgtacacg
gtaaccttcgcggcacctcagcaaggctttgtgctggctacggcagccgtaacaaccaca
actccagacgcaatacctgccgataacctggctcaaactaaagttgaggtaacaccgctg
gtagatgtggccactacactggctggccctgtagtggcactgccaggacaaacagtaagc
tacacggttactacagcaagcaacggccctgcggcggctgatggcgtggtgcaaacggtg
cagctgccaacgggcctgacgaacgtgcagctgaattcgctgagtgcaggttcgcagtac
aacgcaaccactggcactcttactatccgcttccctgacccgctggccactggctttagc
cagaccaacaccatctcgtttacagctcctgcgggggcggctaacctgaacgtttctgcg
gctgtaagtaccagctctgctgaaaccgttgtgaccaacaatgctgctaccgtagtaaca
gctctaacccctgcggccgatgtagctatccaggttacgggtccgcccactgttacggta
ggcaaccctgtgccctatgtggtatctaccaccaacaacggcgcagcagtagctactagc
gtaattcctactttgcagctacctgcgggcctgggaacggctaacgtaaccttcccagcc
ggagccgctactggatcatacaacaacgctactggcctagtaaccttctcaacagtagca
gtactggccagcggagctactacctccagcgtgatagtcgtaactatgccggatgcctca
caactttcggccgtaggccaggttacgaccaccagcaccgatacgaacccgactaacaat
tacgctacagccgccactacggccaccacagtcactacggccacggctgacttacgtacc
acgctaactccggctaccaccacggtaaatgcaggaagcagcgttacgctcaccgctaca
ttcagtaacttaggtgccggcacggcaaccaacgtggttccgcagctgctgttgcagcca
ggcctgacgggcgttaccgttacagacaacggcacggttcgcaatgctgattacaacgcc
accacgggggtagtaaccttccagtcgacggcagcggcgctggcctccctggcaagcggg
tcttcgttgcccggtacgtacacggtatcgtttaacgctccggccactggcccagtgtcg
gcagtggccagcatttactcggctacctccgatggagtactttccaacaatacggcctca
gctacggtaaacgtaacgcctcaggcagatgcgcaaaccagcattgcaggtccgctcacg
gcccagccaggctcacgggtaacgtatgagattaccacctccaacaacagcactgcggtg
tcgccttccacaaatgttgtgcagaccgtaactatacctggtacgcctgctaatctaacg
ttctcggcaggtgcttcttcggcggttgtaggagccaacacggttgttactttccccacg
gttgcctctatggctcccggcgtggccggtgcagtaaccaacttcatctcgttcacgacc
ccagctacggctaccacgctaaacattacagctaatgtaacctcagccgccgatattaac
atctcggctgcttcaaactcagccagcatttcgaccattgcgaacaatgccccagtggcc
tacaacgtagtgaacaacttgctgccagcgggtgaggtacgctttaatcaggtgattgag
aacacggctaccacggcccagcctatctcgccgctggtagctacggatgtaaatgctggc
cagacgctgagctatactcttgcttcggtacccacttccggtggcctatatataggcacc
agcacgacggccctgatttctggcgctacaatctcggcctcagaggctggtcagctgcgc
tatctgccagttagcgggttcataggcaacgccttctttacgtacacagctacagacaac
gccacccccacatcggccacttcgaatgttgcgctctacactattgcggtgggacaggat
gctaactcttcgtacacaacaacccctgtgaaaggcggcgcgagcccctacctgacaggt
gatgtattggctaatgtgtttgatgcaaatagcggcacgtacaactcagctacgcctcag
gcagtagtgaaagatggtgttagctcggctactctcgtaactactggcctacccgctggt
gtatcaggcagcttccctcccggcgttgattttaacacaactaatcctaatcagatcggg
cagattgtagtaaccaacaaccgactcttggtggctggtacttacacggttcagatcaga
acgattgatgccaacggtggtacaaacacccagaacgtcaccttcaccattggggtacgt
ccgctgcccgtgcagttggcgagcttcacggccaaagccgccggcccgaatgcagagctg
acgtggcgcacggcccaggagctgcgcaacgaccactttgtggtggagcgtagcttcgac
ggccgcagcttctcggccctaggccaggtacaggggcagggcacgaccacgctggccacc
gattaccagttcctggatgcacaggtagcggccaaagccgctggccaaacggtgtactat
cgtctgcgccaggttgacacggacggcaccagcagcttcagcgccgtgcaagctgtggcc
ttcactaaaacggaagtcgctatcagcctgtacccgaaccccgcttcaaccagcaccacg
ctcaacctaacaagtctgccccaaggcgcttatcaggtaagcattattgacgcagtaggc
cgggtagttcgccaggcacgctatgagggcggtactaccccaacgctgtcggtgcaggaa
ctgcccgtgggtagctaccaggtattgattagcggtgcaagctttaacaagtcgttgcga
tttatcaaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
