Candidatus Hepatoplasma vulgare: HPAVJP_5940
Help
Entry
HPAVJP_5940 CDS
T09842
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
hvu
Candidatus Hepatoplasma vulgare
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
60KD_IMP
PIG-U
Ctr
DUF6560
HemY_N
Ada3
TRAP-gamma
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDV02705
LinkDB
All DBs
Position
complement(658890..661430)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MAKQDHTFYREAKKSFLDGESFSWKSVFKKFLKYLKWALYTFLIMTSLWGCVNEFRHTTS
GAVSQGIEFYSSYDSVIPNIYMGEESSHVYEMYSTGVDSETQEEVKEKIPFEFYTINPNF
NPEITSEDKVENVNYDDLFIRSSDVTTSTGEHSTQPLSYTVDESTAQAYLYLYDWSFYND
GKSLQTETTDGVPWVLPYYTLPQYFYDLDNADINGDGSKNFVDFYIKIYGQDEALNNGLI
KEDEDGNITSVPFYEKFIVPNDSLVNLENLGTDWWEDPANWEIIDGETDTFIEQEDWDNP
DIYDTNRKNEVAYEQMVFYTNAASFISGKEFSSSDIISMDINGTQENISIHDLITTVLFQ
GTVINEVYTASFPIIQDIDLYKSDSSLTYELYSGLGYSIVSQNRAHPLYPSDSAINTFDN
YSVSGEESSTGMRDPNWYENTEAGTQERTNNAGWAMLEEDGDFIEINNYSNSNTNYLYGD
TQEDFNANMQKYRTSIDETGTNSGYYVNGTVNASAGIENGNSIGVDTQENFIGISSIGET
SIDGGTYQYLTYDSTVYDAIDKSGQDGNNSDRDIFSSWNDWGDAWDPDYGPMYGLFVFPL
SQLSIWVSTWFPYSTFGAWGVILGIFIITFMLRGIGLLLSVGSSKNQQKMQEIQPILAEV
DAKYAVYDKKNKQMKAKKQQEKMGIYKKYEINPFASLGTVFITLPIFLSLFIIISAIPIY
KIASVGAFSFSVSSFYGMFNISSLFIVYLLVGITVGFAQGISSKLPGWLANKRRGVKQVD
EATKKALKKQRRTQNILVGVFVFIGLTVSVLLAIYWIFSALFTITNELTRHWLKERKAKK
IAQGKV
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaaacaagatcatacattttatagagaagcaaaaaaatcatttttagatggagaa
tcattttcttggaaaagtgtttttaagaaatttttaaaatatctaaaatgagcactttat
acattcttaataatgacttcactttgaggctgtgttaatgaatttagacacaccacttca
ggagcggtatctcaaggtattgaattttattcaagttatgattcagtaattcctaatatt
tatatgggtgaagaatcttcacatgtttatgaaatgtattcaacaggtgtagattctgaa
acgcaagaagaagtaaaagaaaaaataccttttgaattttatacaataaatcctaatttt
aatccagaaataacttctgaagataaagttgaaaatgtaaattatgatgacctttttata
agatcttctgatgtaacaacatctacaggagagcattcaacacaaccgctttcttataca
gtggatgagtcaactgctcaagcttatttatatctttatgattgatctttttataatgat
ggtaaatcattacagacagaaactacagatggtgttccatgagttcttccttattacact
ttaccacaatatttttatgatcttgataatgccgatataaatggagatggatcaaaaaat
tttgtagatttttatataaaaatatatggtcaagatgaagcccttaataatggacttata
aaagaagatgaagatggaaatataacttcagttcctttttatgaaaaatttattgttcct
aatgattcattagttaatttagaaaatttaggaaccgattgatgagaagatccagctaat
tgagaaataattgatggagaaactgatacttttatagaacaagaagattgagataatcct
gatatttatgatacaaatagaaaaaatgaagttgcttatgaacaaatggttttttatact
aatgctgcttcttttatctcaggaaaagaatttagctcaagcgacattatttcaatggat
ataaatggaactcaagaaaatatttcaattcatgatttgataactacagttctttttcaa
ggaactgtaattaatgaagtttatacagcttcatttcctataattcaagatattgattta
tataaatcagattctagcttaacatatgaactttattctggtcttggttattctattgtt
tctcaaaatagagctcatccactttatccttctgatagtgcgataaatacttttgataat
tatagtgtatcaggtgaagaaagttcaactggaatgcgtgatcctaattgatatgaaaat
actgaagcaggaactcaagagagaacaaataatgctggttgagcaatgcttgaagaagat
ggagattttatagaaattaataattattcaaatagcaacactaattatctttatggagat
acacaagaagattttaatgcaaatatgcaaaaatatagaacttcaatagatgaaacagga
actaattcaggttattatgtaaatggaacagtaaatgcttctgcgggaatagaaaatggt
aattctattggagttgacacacaagaaaattttattggaatttcttctattggtgagact
tctattgatggaggaacctatcaatatttaacttatgattcaactgtatatgatgcaata
gataagtctgggcaagacggaaacaacagtgatagagatatattctcttcttgaaatgat
tgaggagatgcttgggatccagattatggtccaatgtatggattatttgtttttcctctt
tctcaattatcaatatgagttagtacatgatttccttatagtacttttggagcttgagga
gtaatattaggaatatttattattacttttatgctaagaggtataggactattgctttct
gttggttctagtaaaaatcaacaaaaaatgcaagaaattcagcctattttagctgaagtt
gatgctaaatatgctgtttatgataaaaaaaataaacaaatgaaagctaaaaagcaacaa
gaaaaaatgggtatttataagaaatatgaaataaatccttttgcctcccttggcacggtt
tttattacacttccaatttttctttccttatttattattatttctgcaattcctatttat
aaaattgcttcagttggtgcattctctttttctgtgtcttctttttatggaatgtttaat
ataagttctttatttattgtttatcttttagtagggattaccgttggttttgctcaaggt
atttcttcaaaacttccaggttggcttgcaaataaaagaagaggagtaaaacaagttgat
gaagcaacaaaaaaagctcttaaaaaacaaagaagaacacaaaacattttagttggagta
tttgtatttattggacttactgtttctgttttacttgcgatttattggatattttcagca
ttatttacaattacaaatgaacttacaagacattggctaaaagaaagaaaggcaaagaaa
atagcacaaggtaaggtataa
DBGET
integrated database retrieval system