Hwangdonia lutea: RNZ46_05500
Help
Entry
RNZ46_05500 CDS
T09455
Name
(GenBank) LamG-like jellyroll fold domain-containing protein
Organism
hws
Hwangdonia lutea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_G_3
Pentaxin
Por_Secre_tail
Laminin_G_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOD44715
UniProt:
A0AA97HS49
LinkDB
All DBs
Position
1272648..1276922
Genome browser
AA seq
1424 aa
AA seq
DB search
MKTKLLLSLLLVWICLTLGYGQTNAPSIQSGVTFQWSDVQTAANHSATIQSVTVNGIVYL
NFGLPTGYELTQLGPDGHNRNRILNNGTSVETTSSSATWGSSALTAFQDLNLNHYFNSNR
NGANICDNYTSESTTTAQRQTLTYGTGILATSSGVIAVTERNANNCLHLELFGIPAGGGP
VQSLGETFINETSTQFGFGGTGTGGPNGLGTPGALNPPNTNSDYWLSDRVVENKGTLGIA
LFYLDDIAPNGSLITKAQLTASTRDHADGKLFIFTLDDQDEDGYSDVDDLDDDNDGIKDT
DESGGIDPSADADTDGIPNYKDADFCTLNAHGVCANLDADSDGIPNHLDLDSDNDGITDV
KESGGIDLNNDGMADGSIGITPTTNGIPSSAGTGTTPINTDGDVNGSGNRYLIYDFLDID
SDNDGIPDNIEAQPTVGYVAPSGTYSSSGIDVSYGLGIMVEDTDGDGIPDYIDSDSDNDG
IADLSENGLPVPSTDQDKDADGLINPFETTNIDDPVWDVNEDIEDPTDLSILPDADGDLN
SGGDLDYRDMFSTNPPSIASIDFDGIDDYLSRASFINGLATVTIMAWVKSDTGNATNMVI
AGEDSGCKLWLEKGNIPKFTVKTAGNSEASVSCTAINFNEWHHITGIYNSTSGAITIYVD
GTLLSSGNVGSTGAVIENTVNSNGNFEVGRRSSNLSNKLYFKGDIDEVRVFNTSLTSEQV
QKMVYQEIEENTVTNNVKGVIAKKDIEDTSTGAKVPWANLIAYYPMTDIKMGTTSDYSSN
NEKLYLNYINTVQDQTAPMPYQTASNGAWTSQSTWLHGDVWDIENIANNKDWSIVKIGSD
VSACHPIKTVGLVVDSGHSLNVQSDNLVENSWYLELNGTLNLEDDSQLIQTEHSDLVTSA
VGKILRRQEGTSSMYRYNYWASPVGAIGLTALSNNNATTNNPNNTAYTLNSLKDEMGINF
SFTSSHHEMGKISTYWLYTYINGLTYWDWAVLDTNTPIEPGVGYTQKGTGNAGLEQQYTF
EGKPNNGTILINVTDKGGPGSEPSVSKTEYLLGNPYPSALDIHKFIDDNAGVIDGTLQLW
QQWAGDSHQLRDYEGGYAQVNKTGSIRAYQFVGIEGANNGSQDGTITPSRYLPVGQGFIT
EIVGNGHVEFNNSQRVFIKEADADGTYNNGSSFFRNGNDKTKNKNVSAKNNEQNEFKKMR
LELNAVSGPATRRELLLGFSNETTDGFDYGYEAECTDSNNNDLNLNFEGKNMNIQAYSDI
TNEKVVALNFKSSDTNTFEIKMTETENIDETQEIYLRDNLTGTYFDLTENQPYSFTSEQG
KFNKRFEIVFQSEQKSLSIEESKHHENFVYFQNKTNTLFAKKLSAAVNNLAVISMKGQTV
FELQNVTQTTLNNGLKLVNMATGTYIVCLRTEDHQVITKKIIIH
NT seq
4275 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaaattacttttaagcttactattggtatggatttgtttaaccctagggtat
ggacaaacaaatgcaccgagcattcaatctggagttacatttcaatggagcgatgttcaa
actgccgctaatcattcggctacaattcaaagtgttactgtaaatggtattgtttattta
aattttggattgccaacgggttacgagttaactcagcttggtccagatggccacaacaga
aatcgtattcttaacaacggtacaagtgtcgagaccaccagtagtagtgccacttgggga
agttcggcactaacagcttttcaggatttaaatcttaatcattatttcaattccaacaga
aacggggctaatatatgtgataactatacaagcgaatctacaaccacagcgcaaaggcaa
acccttacttacggaacgggtattctagcaacttcaagtggtgtaattgcggttacagag
cgcaatgcaaataactgtctacacttagagctgttcggtatacctgctggaggcggtccg
gtacaatcgttgggagaaacctttataaacgaaacttcaacgcaatttggttttggtggt
acgggaacgggcggaccaaatggattgggaaccccgggagccttaaatcctccaaacaca
aactcagattactggttgagtgatcgtgttgttgaaaacaaaggcacactaggtatcgca
ttgttttatttagatgatattgcgccaaacggatcgctcataaccaaagcacaattaaca
gcgtctacaagagatcatgctgatggaaaattattcattttcacccttgatgaccaagat
gaagatggatatagcgatgtagatgatttagatgatgataacgacggcattaaagatact
gacgagtctggagggattgatccttccgcagatgccgatactgatggtattccaaattat
aaagatgccgatttttgcactttaaatgcccacggtgtatgtgcaaatttagatgccgat
tctgacggcattccaaatcacttagacttagatagcgataacgacggcattacagatgtg
aaggaatccggaggcatcgatttaaataacgacggaatggctgatggctctattgggata
acaccaacaacaaacggtattcctagttcagccggcaccggaactacacctattaatact
gatggcgatgttaatggttcaggtaatcgttatttaatttatgattttttagatattgat
tcagacaatgatggcattccagataatatagaagcacaacccaccgttggctatgtggca
ccaagtggcacttattctagctcgggaattgatgttagttatggtttaggcattatggtt
gaagataccgatggcgacggcatcccagattatatagattcagactctgataatgatgga
atagcagatctgtcagaaaacggtttgccagttccatcgaccgatcaagataaagatgcc
gatggtttaataaatccctttgaaaccacaaacattgatgaccctgtttgggatgtaaat
gaagacatagaagacccaaccgatttatccatattaccagatgcggatggtgatttgaat
tctggtggcgatttagattatcgggatatgttcagtaccaatccacctagtatagcgtcc
atagactttgatggcattgatgattatttatcaagagcatcctttataaatggtttagct
acggttacaataatggcttgggtaaaatcagatactggcaatgcaaccaacatggtaatt
gcaggcgaagactcaggctgtaaactttggctcgaaaagggtaacatccctaaatttacg
gtaaaaacggctggcaattcagaagcttcagtaagttgtaccgctattaattttaatgaa
tggcatcatattacaggaatttataatagtacatccggcgccattaccatttatgtggat
ggcacattattaagctctggcaatgtaggaagtacgggggcagttattgaaaatacagtc
aattccaatggaaattttgaagttggtcgacgctcaagcaacctaagcaataagctatac
tttaaaggtgatattgacgaagtacgagtgttcaacacgtcattaacaagcgagcaagta
caaaaaatggtgtatcaagaaattgaagaaaacacagtaaccaataatgtaaaaggtgtc
attgctaaaaaggatattgaagacacctctactggagcaaaagtaccatgggcaaactta
atagcctattacccaatgacggatattaaaatgggtacaacctcggattattccagcaat
aatgaaaaactttatttaaattatatcaataccgttcaagaccaaaccgcgcccatgcct
tatcaaacagcatctaatggtgcatggacctcgcaatctacatggttgcatggcgatgta
tgggatatagaaaatatagcaaacaataaagattggagtattgtaaaaattggtagcgat
gtatcagcttgtcatccaataaaaacggttggactagttgttgattcgggacattcatta
aatgttcaaagtgataatttagtagaaaactcttggtatttagagttaaacggaaccctt
aatttagaagacgattcgcaattaattcaaaccgaacacagcgatttagtaacctcggcc
gtaggcaaaattttaagaagacaagaaggcacctctagtatgtacaggtacaattattgg
gcatcacccgttggagcaataggcctaacagctttaagcaataataacgcaaccacaaac
aacccaaataacaccgcttacactcttaactcactaaaagatgaaatgggaattaacttc
tcttttacttcgagtcaccacgaaatgggtaaaataagcacctattggttatacacttat
attaacgggttaacctattgggattgggcggtattagacactaatacacccattgagcca
ggggttggctatacccaaaaaggcactggaaatgcaggcttagaacaacaatatactttt
gaagggaaaccaaacaacggcaccattttaataaacgtaaccgataaaggaggcccaggc
tcggaaccatcggtttcaaaaaccgagtatcttttaggaaacccgtatccatcagcatta
gacattcataaatttatagatgataatgcaggtgttattgatggcaccttgcagctatgg
caacaatgggcaggagattcacatcagctcagggactatgaaggtggttatgcccaagta
aataaaacaggatccatacgggcctaccaatttgtgggtattgaaggcgcaaacaatggc
tctcaagacggcaccataacgccatcaagatatttgcccgttggtcaaggatttataacc
gaaattgtaggcaacggccatgtggaatttaacaattcgcaacgtgtttttataaaagaa
gcagatgccgatggtacttataacaacggatcttcatttttcagaaatggaaatgacaaa
acaaaaaacaaaaacgtttcagcaaaaaataatgagcaaaatgaatttaaaaaaatgcga
ttggagctaaacgcggtatcgggtcctgcaacaaggcgagagttgctgttagggtttagc
aacgaaaccacagatggattcgattatggctatgaagctgaatgtactgattctaataac
aacgatttaaatctgaattttgaaggtaaaaacatgaacatacaagcgtatagcgatatt
accaatgagaaggtagtggctttaaactttaaatcatcagacaccaatacttttgaaatt
aaaatgacggaaaccgaaaacatcgatgaaacccaagaaatttatctaagagacaattta
actggcacttacttcgatttaacagaaaatcaaccatacagctttacatcagagcaagga
aagtttaataagagatttgaaatcgtttttcaatccgaacaaaaaagcttaagcattgaa
gaaagcaagcatcatgaaaactttgtgtactttcaaaacaaaacaaacactttgtttgct
aaaaaattaagtgctgcggtaaacaatttagcggtaattagcatgaaagggcaaacggtt
ttcgagcttcaaaatgttactcaaacaacgttaaacaatgggctaaaactagtcaatatg
gccactggaacttatatagtgtgcttaagaacagaagatcatcaagtaattaccaaaaaa
attattattcattaa
DBGET
integrated database retrieval system