Hwangdonia lutea: RNZ46_06620
Help
Entry
RNZ46_06620 CDS
T09455
Name
(GenBank) UvrD-helicase domain-containing protein
Organism
hws
Hwangdonia lutea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
PDDEXK_1
AAA_11
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOD44937
UniProt:
A0AA97EP18
LinkDB
All DBs
Position
1532039..1535173
Genome browser
AA seq
1044 aa
AA seq
DB search
MHPNHPFTIYNASAGSGKTYSLVKAYLKILFNSNNLHLFNRILAITFTNKAVAEMKDRII
ETLKAFSDEAILSTSNSMFDAICEELGMEPEALHKKAEKLLNTIIHNYAAFDISTIDGFT
HRLIRTFAHDLKLPLNFEVELDQDSLLNEAVDSLISKAGTDEALTKVLVDFAIEKADDDK
SWDVSFDFNKIAKLLVNENDMPFIETLKHKTLNDFKALKSHLKKEISAFETTIIEAAQGV
LTLIEEAGLEFGDFSSSYLPKHFKNLSDKKFNVKYGNKWQENLETETLYPKRVSEDVASI
INQIQPQLVAAFNTTKQAVFHLKFLKAFYKNVTPLSVLNAINNELGDLKTEQNKMLISEF
NAIISKEIKNQPTPFIYERIGEKFKHYFIDEFQDTSVLQWENLIPLLENSLSAENGTTML
VGDAKQAIYRWRGGKAEQFIDLFNKKEQPFQIKQKVETLEENYRSFKEIVAFNNGFFKFL
ANLVFTANDYKALYENAHQNITKTEAGYVNFSFLEIEKDDDRDAHFSENTLNTINNCLEN
GFDLEDICILVRKKKEGVAVANYLSQNNIPIVSSETLLLNNSDEVNFINNVLSLLNQPKN
NEIKIAVLNYLTTLFNIENKHEFFSNHINLSLSQLFKSFEKFSIQINSSNLLQLPLYDLA
ETIVRSFNLVKTSNAYIQFYLDVVLDFSQKKGSDISGFLQYFDKKKESLSIVSPKGQNAV
QIMTIHKSKGLEFPVVIFPFADLDIYRELEPKEWFALNKDTYNGFSHTLLNYNKDFEFYG
DEGLRIFNKHQSEQELDNINLLYVTLTRAVEQLHVISTKDISAKGEVNTKRYSGLFIAYL
KHINAWEDSKLTYSFGNDKRTFEKEILKKETQIQHQFISTAKETHNINVVTKSGLLWDTA
QKEAIEKGNLIHNIMSKINTKDDIDSAINDFINSASINQEQAAILSTTVNEIVNHSKVQN
YYTLNHTNYNERDIITKEGMILRPDRVVVNANNEAVIIDYKTGFEDKKHAQQLQLYQDVL
EEMNLKVTEKILIYINDDIQIKEI
NT seq
3135 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatcccaaccacccttttactatttacaacgcttctgccggtagcggaaaaacctat
tcgttggttaaagcctatttaaaaatccttttcaactcaaacaacctacatctttttaac
cgcattttggctattacatttaccaataaagcggttgccgaaatgaaagaccgcataatt
gaaaccttaaaagcgttttccgatgaggccattttaagcacttcaaatagtatgtttgat
gctatttgtgaggaactcggtatggaacctgaagcgcttcacaaaaaagcagaaaaacta
ctcaacaccattattcataattatgcggcgttcgatatttctactattgatggctttacg
catagattgattcgcacctttgcccacgatttaaaattgcctttaaattttgaagttgaa
ctggatcaagattcccttttaaacgaagccgttgatagcttaatatctaaagccggaaca
gatgaggcgctaaccaaggtgttggttgattttgctattgaaaaagccgatgacgacaaa
agttgggatgtgtctttcgattttaacaaaattgcaaaattgttggttaacgaaaacgat
atgccgtttattgaaactttaaaacacaaaactttaaacgattttaaagcgcttaaatcg
catttaaaaaaagagatttctgcttttgaaactactataattgaagcagctcaaggtgtt
ttaaccctaattgaagaggcaggtttagaatttggtgatttttcaagtagttatttacct
aaacattttaaaaatttatcagataaaaaattcaatgtgaaatatggaaataaatggcaa
gaaaatttagaaacggaaacattatacccaaagcgtgtttccgaagatgtggcatccata
attaatcaaattcaaccgcaattggtagcggcttttaacactacaaaacaagctgttttt
catcttaaatttttaaaagcgttttataaaaacgttacgccactttcggttttaaatgcc
ataaataatgagttaggtgatttaaaaacggagcagaacaaaatgctgatttcagaattt
aatgccattattagcaaagaaataaaaaaccagcccacaccttttatttacgagcgtatt
ggcgaaaaattcaagcattattttatcgatgagtttcaagacacatcggttttgcagtgg
gaaaacctaataccgttattagagaattcactctctgccgaaaacggcactaccatgttg
gtgggcgatgccaaacaagccatttaccgatggcgcggtggtaaagcggaacagtttata
gatttgtttaataaaaaagaacagccattccagattaaacaaaaggtagaaacgctggag
gaaaattaccggagttttaaagaaatcgtagcgtttaacaatggcttttttaagttttta
gcaaatctagtttttacggctaatgattataaagctctttacgaaaacgcccatcaaaac
ataactaaaacggaagcgggttatgtgaatttttcgtttttagaaattgaaaaagatgat
gatagggacgcgcatttctctgaaaataccttaaacaccattaacaactgcttggaaaat
ggttttgatttggaggatatttgcattttggtgcgaaagaaaaaagaaggcgttgccgtc
gccaattatttgagccaaaataacattcctatcgtatcttcagagactttattgttaaat
aattcagacgaggttaattttataaataatgttctctcgcttttaaatcagcctaaaaac
aacgaaataaaaattgctgttttaaattatttaacaacgcttttcaacattgaaaacaag
cacgaattcttttcaaaccatattaacctttcattatctcaattatttaaaagttttgaa
aaattcagcatccaaataaacagcagcaatctgcttcaattgccgctttacgatttggcg
gaaaccattgtgaggagcttcaatttagtaaaaacatcaaacgcttacattcagttttat
ttagatgtggttttagatttttcacaaaaaaaaggatcggatatttctgggtttttacag
tattttgacaagaaaaaagaaagcttaagcatagtatcgcccaagggtcaaaatgcggtt
caaatcatgacgatacacaaatcgaaaggtttagagtttccggtggttatttttccgttt
gccgatttggatatttatagagagttggagcccaaagaatggtttgcattaaacaaagac
acttacaacgggttttcgcacaccttattgaattacaataaagatttcgagttttatggc
gacgaaggtttgcgtatttttaacaaacatcaatctgaacaggaattagacaacatcaat
ctgctttatgtaaccttaacacgcgctgtggagcagttgcatgttatttcaaccaaagat
atttcagcaaaaggcgaggtaaacaccaaaagatattcgggcttgtttatcgcatattta
aaacacatcaacgcatgggaagattctaaattaacgtacagcttcgggaatgataaaaga
acttttgaaaaggaaattttgaaaaaagaaactcaaattcagcatcaatttatttcaaca
gcaaaagaaacgcacaatataaacgtggtaacaaaatcggggttactttgggacaccgcc
caaaaagaagctattgaaaaggggaatctcatccacaatatcatgtctaaaatcaacacc
aaagacgatattgattctgctataaacgattttatcaattcagcttcaataaaccaagaa
caagctgcaattttaagcacaacggtaaacgaaattgtaaatcattcaaaagttcaaaac
tattacacattaaatcataccaattataatgagcgcgatattattacaaaagaaggcatg
attttacgtccggatcgcgtggttgtcaatgccaataacgaagctgttataatcgattac
aaaacgggttttgaagataaaaaacacgctcaacaattacaattgtaccaagacgttttg
gaagagatgaatttaaaagtgaccgagaaaattcttatttatataaatgatgatattcag
ataaaagaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system