Idiomarina abyssalis: K5X84_02930
Help
Entry
K5X84_02930 CDS
T07548
Name
(GenBank) CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
iab
Idiomarina abyssalis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
iab00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
iab02000
]
K5X84_02930
Transporters [BR:
iab02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
K5X84_02930
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QZN91490
LinkDB
All DBs
Position
622524..625655
Genome browser
AA seq
1043 aa
AA seq
DB search
MIDALIRFAVERRWLVLAATLLVAAAGVYSTLKLPIDAVPDITNVQVQINSEAPGYSPLE
TEQRISYPVETAMAGLPKLDYTRSISRYGLSQVTVVFEEGTDIYWARQQISERLQKVRGE
VPDGIEPTMGPIASGLGEIVNYVVRAKEGATNADGEAYTPEQLRTIQDWIIKPQLVKVPG
VTEINSVGGYEKQYQVAPIPGRMLAYKVTMQDLLAALDLNNRNAGAGYIEKNGEQWLVRS
PGQLKTLDDIRDVVVTKRDDAPVRVSDVAEVKLGEQLRTGASTSGESEVVLGTAMMLIGE
NSRIVAQNVANKIEEVQRSLPDGVVIETVYNRTSLVDKTIATVEKNLFEGAVLVIVVLFI
LLGNARAALITACVIPLSMLFAVSGMVANKVSGNLMSLGAIDFGIIVDGAVIVVENALRR
LGNAQQRLGRVLTTKERLIEVTHSTREVFNPAVFGVLIIMLVYLPIFALSGVEGKMFHPM
AFTVVAALLGALIFSVTFVPAAIAIFVRGNIKHGENRIMRAARKVYQPALRQTLKLPVVI
ILLGFGLFAVSLFQASRMGTEFLPQLDEGDIAMHALRIPGTGLQQSIAMQKDVESVVSRF
DEVKLVFSKIGTPDVATDPMPPSVADTIIILKEREDWPNPEKPKEQLVAEIRTAVQELPG
NKYEFTQPIEMRFNELIAGVRADLGVRIYGDDLQTLKRLGDSAAAVIRTVDGAADVRVEQ
MTGLSTLSVIPKRDHLALLGLTVADVQRAVQAAVGGVQSGIIYEGDKRFKLMVRLDKEWR
KSIEQLKSLPIDLPAGNPELRYVPLGEVAELSLESGPNQINRESSKRNVIVSANVEDRDL
GSFVADVQDALTTDVDLPAGYWVNYDGTFEQLQSASQRLSLVVPLALLLIIGLLYSAFNS
LSSALVIFTGVPLALTGGIFALALRDMPLSISAAVGFIALSGVAVLNGVVMLTFIRQLLR
DGLPLKDAVFEGAQQRLRPVLMTALVASLGFVPMAFNTGVGAEVQRPLATVVIGGIVSST
LLTLVVLPALYYLVQRFKGTHVE
NT seq
3132 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagatgcactcattcgctttgcggttgagcgtcgatggctggtgcttgccgcaacc
ttgttagtagcagctgcgggcgtttatagcacattaaagctacccatcgatgctgtgccg
gatattaccaatgttcaggtccagataaattcagaagcgccaggctattcgccattagaa
accgaacaacgtatttcttatccggtggaaaccgcgatggcaggtttaccaaagctggac
tacacccgctcgatctcacgctatgggttgtcgcaagttaccgtggtgtttgaagagggc
accgatatttactgggctagacagcaaatcagtgagcgattgcaaaaggtaaggggagaa
gtacccgacggtattgagccgacgatggggccaatagcctccggccttggtgaaattgtt
aattatgtagtacgcgcgaaagagggggctaccaatgccgatggcgaggcgtatacgccc
gagcagttgcgtactattcaggattggatcattaagccgcaactggtcaaggtacccggt
gttaccgagattaatagtgtggggggttatgaaaagcaataccaggtggctcccatcccc
ggtcgtatgctggcctataaagtgaccatgcaggaccttttggcagcattggatcttaac
aatagaaacgctggtgccggttatatcgagaaaaatggtgagcaatggttggtgcgttcg
cctggacagcttaagacacttgacgatattcgtgatgtggtcgtgacaaaacgtgatgat
gcaccggtgcgcgtgagtgacgtggctgaggtcaaactgggagaacaattacgcactggc
gcttcaacctcgggcgagagcgaggtggtattgggcacggccatgatgcttatcggcgag
aacagccgtattgttgcacagaatgtcgccaataaaattgaggaggtgcaacgaagcttg
ccagacggtgtcgtcatcgaaacggtttataaccgcacatccttagtggataaaaccatt
gcaacggtagagaaaaatctgtttgaaggtgccgtgctggttattgtcgtgcttttcatt
ctactcggaaatgcccgtgcagcactaattaccgcctgtgtcattccgttaagtatgctg
tttgcggtaagcggcatggttgccaacaaggtgtctggtaatttaatgagcctgggcgca
atagattttggcattattgtcgacggtgcggtcattgttgtcgagaacgcgctgcggcgc
ctggggaatgctcaacaacgcctcggtagggtgctgacaaccaaagagcgtttaattgaa
gtgactcacagtacacgtgaggtcttcaacccagccgtttttggtgtactgattattatg
ctggtctacctgccaatatttgcgttaagtggcgtggaaggcaagatgttccatcccatg
gcgtttacggttgtagcggcgttgttaggtgcgctgattttcagtgttacctttgtaccc
gctgctattgcaatatttgtccgtggcaatattaagcacggcgaaaaccgaataatgcga
gcggcccgcaaagtgtatcagccggctctacggcaaacattaaagcttccagttgtcatt
attttgcttggctttgggttatttgcggtatcactgtttcaggcgagtcgcatgggaact
gagtttttgccacagcttgatgaaggcgatattgccatgcatgccttgcgcattccgggg
actggcttacagcagtctatagcaatgcaaaaagatgtcgagtctgtggtgtcacgcttt
gacgaagttaaactggtattctcaaaaattggtaccccggatgttgcgaccgaccctatg
ccaccgagcgttgctgataccattattattttaaaggagcgtgaggactggccaaatcca
gagaaacccaaagagcaactggttgctgaaatacgaactgctgtgcaagagcttcccggt
aataagtacgagttcactcagcccattgaaatgcgctttaacgaacttattgcaggcgtt
cgagctgacttgggggttcgtatttatggcgatgacttgcaaacgcttaaacggttaggc
gactcagccgccgcagtcattcgcaccgttgatggcgctgctgacgttcgggttgaacaa
atgaccggtttatcgacactctcagttatacctaagcgtgatcatttagcgttattaggc
ctaacagtcgctgatgtacaacgagcagttcaagctgcggttggtggagttcagtcaggg
attatttacgagggggataaacgcttcaagctaatggtacgtctcgacaaagaatggcgt
aagagcattgaacagcttaaatcactgcctattgatctgcctgccggcaaccctgagctg
cgctatgtgccgttgggagaggtcgccgaattgagtttggaaagtggaccgaaccaaatt
aaccgagaaagtagcaaacgcaatgttattgtgagtgcgaatgttgaagatcgtgatttg
ggctcttttgtggcagatgttcaggatgcgctaacgactgacgttgatttgccagcaggt
tattgggttaactacgacggtacctttgaacagctgcaatcagcttcccaacggttgagt
ttggttgtgccattagcgctgctattaattattggcctgctatacagtgcttttaattcg
ctgagcagtgcactcgtaatatttacaggcgttcccttagcgctgaccggcgggatattc
gcattagcgctgcgcgatatgccgctatcaatttccgctgcagtcggcttcattgcactg
tcgggcgtggcggttttgaacggcgtggtcatgctgacattcatacggcaactgctgcgc
gacggactgccgttgaaagatgcggtgtttgaaggcgcgcaacaacggttaagacctgta
ctgatgactgctctcgtagctagcctgggctttgtccctatggcatttaataccggtgtc
ggcgctgaggtacagcgaccactggctactgtggtaatcggcggcattgtctcgtcgaca
ttattgactttggtggtgctgccagcgttgtattacttagtacaacgttttaaaggaacc
catgtagaataa
DBGET
integrated database retrieval system