KEGG   Candidatus Ishikawaella capsulata: ICMP_120
Entry
ICMP_120          CDS       T04149                                 
Symbol
mutS
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein
  KO
K03555  DNA mismatch repair protein MutS
Organism
icp  Candidatus Ishikawaella capsulata
Pathway
icp03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:icp00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    ICMP_120 (mutS)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:icp03400]
    ICMP_120 (mutS)
DNA repair and recombination proteins [BR:icp03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     ICMP_120 (mutS)
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_I MutS_II MutS_IV AAA_14 DUF7245 AAA_27
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAH82982
UniProt: C5WCC6
LinkDB
Position
143207..145786
AA seq 859 aa
MIDYTREKTSDIDLNNHTPMIQQYLSIKSSYPEILLFYRMGDFYELFYEDAKKVSELLDI
ALTTRGNSAGNPIPMAGIPYHALDNYLNKLMQLGESVAICEQIGETSKCRSLVERKVVRI
VTPGTITDESLLPERKDNLIAAIIMNSSGYGYATLDIGSGNFIISEFNKIDIMDSEIQRT
NPAELLYPEDFEELKLIKHLPVIRRRPVWEFDLDTACQQLNLHFGTRDLKGFGVEDANLA
IRAAGCLIQYVKDTQKTSLPHINSIHIEHQKDIVIIDAATRRNLEITQNFSGTSENTLVS
VIDKTVTPMGSRMLKRWLNMPLRNNLKIKKRQEAVLELKEISIEEVKSLLRPVGDLERIL
ARLALYTARPRDLSGMRNALRQLPKLKLALVKVQSPLIIGLMRQLGEFSELSKLLEKAII
ETPPLLIRDGAVIATGYSSELDKLRSLSEGTNEYLSLLEINERKKLGTDSLKVGFNRVHG
YYIQINSNHSHLVPIHYIRSQTLKNVQRYITPELKKYENSMMTARARSLLLEKKLYNEIL
EFIIPYLKSLQSCSASLSEIDVLSNLAERAYTLNYCRPILKEDPCIKIINGRHPVVEQVI
KEPFIANSLELSPNRRMIIITGPNMGGKSTYMRQAALIVLLACVGSYVPAEKMNIGPLDR
IFTRIGAADDLALGRSTFMIEMIETANIMHNATANSLVLIDEIGRGTSTYDGLSLAWSCV
EKLAKSIKAMTLFSTHYFELTKLTKTIEGVFNIHFNVIEYENNIIFMHKIQEGASNKSYG
LAVAALAGIPKEIIKNASEKLRQLEYASDITKDTYHNKCIANNQLTNKNSIIQKLSDINP
DLISPYQALKLIYDLKSLI
NT seq 2580 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgattgattatacacgtgaaaaaactagtgatatagatttaaacaatcatacacctatg
atacaacaatatctatctattaaatctagttatccggaaattttgttattttatcgcatg
ggagatttttatgaattgttttatgaagatgcaaaaaaagtttccgaattattagatatt
gctcttactacacgtggtaattcagcaggcaatcctattcctatggctggtataccttac
catgctcttgataattatttaaataaattaatgcaattaggagaatctgttgcaatttgt
gaacaaattggagagacttcaaaatgtcgtagtttagtggaacgcaaagttgtgcgtatt
gttactccgggtactattactgatgaatctttgttaccagaaagaaaagataatttaatt
gctgccattataatgaattcctcgggatatggttatgcaactttagatataggttctgga
aattttattattagtgagttcaacaaaatcgacattatggattcggaaattcaacgtact
aatcctgcagaattgctatatccagaagattttgaagaattaaaattaattaaacatctg
cccgtaatacgcagacgtccggtgtgggaatttgatttggatactgcttgtcaacagctt
aatctacattttggtactcgagatttaaaaggattcggagtagaagatgctaatcttgct
atacgtgcagcgggttgtttgattcaatatgtaaaagatacacaaaaaacttctttacct
catattaattcgatacatatagagcatcagaaagatattgtaattatagatgcagcgacc
agaagaaatttagaaataacacaaaatttttcaggaacttctgaaaatactttggtatct
gtgatagataagacagtgactcccatgggaagtcgcatgttaaaaagatggctaaatatg
cccttacgtaataacttgaaaattaagaaacgtcaggaagctgtactagagttgaaagaa
ataagtatagaagaagtaaaaagtttattacgaccagtaggtgatttagaacggatatta
gctcgtttagcactatatactgctcgtccaagagatttgtcaggtatgcgcaatgcctta
agacagttgcctaaattaaaactagccttagtaaaagtacaatctcctttaataatagga
cttatgagacaattaggagaattcagtgaactgagcaaactcttagaaaaagctataatt
gaaacacctccacttctaatacgtgatggtgcagttattgctacaggatatagctctgaa
ttagataaattaagatctttatcagaaggaactaatgaatatttatctttattggaaata
aatgaacgtaaaaaactaggaacagattcattgaaggttggtttcaatagagtacatgga
tactatattcaaattaacagtaatcacagtcatttagttcctatccattatatccgtagt
caaacactaaaaaatgttcaacgttatattactcctgaattaaaaaaatatgaaaattcc
atgatgacagccagagctagatcattattattagaaaaaaaactatataatgaaatatta
gaatttatcataccttatttaaaatcgcttcaatcttgctcagcatcattatcagagatt
gatgtattaagtaatttggctgaacgtgcatatactttgaattattgtcgtcctatctta
aaagaagatccatgtattaaaattataaatggtagacatccagttgttgaacaggtaatc
aaagaaccattcattgccaattccctagagctttctccaaacagacgcatgattattatc
actggtcctaatatgggaggtaaaagcacatatatgagacaagcagctttgattgtatta
ctagcttgtgttggtagctatgttccagcggaaaagatgaatattggtcctttagataga
atatttacacgtattggtgctgctgatgatttagctttaggacgttctacatttatgata
gaaatgatagagacagctaatattatgcacaacgctacggcaaatagtttagtattaatt
gatgaaattggtcgcggcacttcaacttatgatggtttatcgctagcttggtcttgtgta
gaaaaattagcaaaaagtattaaagcaatgactctattttcaactcattattttgaatta
actaaattaacaaagaccatagaaggagtctttaatattcattttaatgtaatagaatat
gaaaataatattatatttatgcataagatacaagaaggagctagcaataagagttatgga
ttagcagttgcagctttagctggaatacctaaggaaattattaagaatgcttcagaaaag
ctgagacaattagagtatgcatccgatataactaaagatacctatcacaataagtgtata
gcaaataatcaattaactaataaaaattcaataatacagaaactctcagacataaatcct
gatttgatctctccttatcaagcattaaagttgatttatgatttaaaatcattaatataa

DBGET integrated database retrieval system