Candidatus Ishikawaella capsulata: ICMP_136
Help
Entry
ICMP_136 CDS
T04149
Symbol
recC
Name
(GenBank) RecBCD complex gamma chain
KO
K03583
exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
icp
Candidatus Ishikawaella capsulata
Pathway
icp03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
icp00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
ICMP_136 (recC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
icp03400
]
ICMP_136 (recC)
Enzymes [BR:
icp01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
ICMP_136 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
icp03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
ICMP_136 (recC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Exonuc_V_gamma
RecC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAH82997
UniProt:
C5WCE1
LinkDB
All DBs
Position
complement(168741..172013)
Genome browser
AA seq
1090 aa
AA seq
DB search
MFKVYHSNQLDLLKTLMANIINSQPLKDPFEPEIILVQSKGMEQWLQIELAKDIGISANI
KFILPARFIWEMFLLIIPDVPEESAFTKSQMTWKLRKILPYLLSKNIFTSLKYYLTDDSN
QTKLFQLSSRIADIFDQYLIYRPDWINLWEEGKNVEGLHSRQEWQGILWKYLVKYTRKLG
QSKWHRANLYDFFIKTLKNNKISKNFPKRIFICGISALPPIYWHIFKTLGHYMDVHLLFT
NPCREYWEDIKLKHIIDKQSNTKNYFQPEKINPLLASWGKMGRENICVINQMDLVNDIEA
FVEINPDNLLHTLQADILNLEVIKKQRPLNSNDTSITFHSCHSIQRELEVLHDYLLTTME
EDRSIEPRDIIVMVTNIDSYVPFIQATFANAPSERYIPFSLSDRRAISTHPIILAFMTLL
NLPYSRCTSEEIIKLLEVSAFAAKFSISSEDMHLLRRCIIESGIRWGLDDDNIAELSLPV
TGQHTWHFGLKRMLLGYALDSISGDWQGILPYDESGDKLYKLVNNLAELLYKLTYWRKYL
SKSRNLNDWRSTCREIIDQFFISNTEINRYLLILEEEWMEIISYGVLAQYNKDITISLLQ
EDLQRRINQKYIKNYSLTDKINFCSLMPMRTVPFKIVCLLGMNDSIYPRSILPLSFDLMQ
QKPRQGDRSRRDDDCYLFLEALVSTQQKMYISYIGSSMYDNTKKYPSKLVKELLEYINSS
FYLSDHAQSELQNNSIDITKKIIHFHTRIPFAKENFLLTSCYNSFASEWLNAAQGLGYPP
KNFVQNLTKFHIKEININQLLKFWSHPVRYWFNRRLGIKFCSIDNQVPNTEPFILQGINL
YQIKKQILNFLILNQDINLLYKKYHTAGNLPYGVYGKILWNIQLEKMQYIAQIVRKYYRG
RVDLDVNLFIGDILINGCIKQIQNDGILRWNSNILNINDGLRLWIEHLIYCALGKKGISR
IYGDKNTIWYFDALPQKIAISKLQEFINGYCLGLNKPLMLLHKSGGEWASTIFNKNTRCI
KLDNLTKDKAKMKLLKTWHGNSKMPGEKNDPYLFRIWSSLNENRIKEIIYFAHKWYIPLL
QSNKYEKYKN
NT seq
3273 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcaaagtatatcattcgaatcaactagatttattaaaaactttgatggctaacatc
attaattctcaacctttaaaagacccttttgaaccagaaattatattagtacaaagtaag
ggaatggaacaatggttacaaatagaattagctaaggatatagggatttctgctaatata
aaattcatattaccagctagattcatttgggaaatgtttttgttaataataccagatgta
ccagaagaaagtgcttttactaaaagtcagatgacttggaagttaagaaaaattttacct
tacttactatcaaaaaatatctttacatcattgaaatactacctaactgatgatagtaat
caaactaagctatttcagcttagttcacgtattgctgatatttttgatcaatatttaatt
tatcgtcctgattggataaatctttgggaagaaggaaagaatgtagaagggttacatagt
aggcaagaatggcaaggtatactttggaaatacttggtaaaatatacacgtaaacttggt
caatcaaaatggcatagagctaatttatacgatttttttattaaaactctcaaaaataat
aaaatatctaaaaatttccccaagagaatatttatctgtggtatttccgcattaccccca
atttattggcatatatttaaaacattaggacattatatggatgtacatttactgtttaca
aatccatgtcgtgaatattgggaagatattaaattaaaacatatcatagataagcaatcc
aacactaaaaattattttcagccagaaaaaataaatcccttactagcttcttggggtaaa
atgggtagagaaaatatatgtgtaattaatcaaatggatttggtaaatgatatagaagct
tttgtagaaattaatcctgataatcttttgcatactctacaagcagatatcttaaatctt
gaagtaatcaagaagcaaagaccactaaattccaacgacacatcgattacattccattct
tgccatagtattcaacgagaattagaagttttacatgattatctacttacaacgatggaa
gaagatagatcaattgaaccacgtgatattatcgttatggtaacaaatattgattcttat
gtaccttttattcaagctacatttgcaaacgcaccttctgaacgttatatccccttttcc
ctttctgatcgccgagctatttctacccatccaataatactagcatttatgactttattg
aatttgccttatagtcgttgtacttctgaagagattattaaacttttagaagtttctgca
tttgcagcaaaattttctatttcttcagaagatatgcatctattacgtcgttgtattata
gaatctggtattagatggggattagatgatgataatatcgctgagttatcattacctgtt
actggacaacatacttggcattttggattaaaacgcatgctattaggatatgcattagac
agtataagtggcgattggcaaggaattttaccttatgacgaatcaggagataaattatac
aaattagtaaataatctggcagaattgttatataaattaacttattggcgtaaatatcta
tcaaaatcacgtaatttaaatgattggagatcaacatgtcgtgaaattatagatcaattt
tttatcagtaatacagaaataaatcgttatttgctaattctcgaagaagaatggatggaa
attatatcatatggagttttagcacaatataacaaggatattacaattagcttattacaa
gaagatttacaaaggcgcattaatcaaaaatatataaaaaattattccttaacagataaa
ataaatttttgtagtttaatgcctatgcgtactgttccttttaaaatagtatgtttactg
ggaatgaatgattctatatatccgcgcagtattctaccattaagttttgatttaatgcaa
caaaaacctcgtcaaggagatcgtagtcgacgtgatgatgattgttatcttttcttagag
gcgttagtatctactcagcaaaagatgtatattagttatattggaagttctatgtatgat
aatacaaaaaaatatccttctaaacttgttaaagaacttctagagtatattaattctagt
ttttatttatctgatcatgcacaatctgagttacagaataattctattgatatcaccaaa
aaaattattcattttcacactagaattccttttgctaaagaaaacttcttattaacatca
tgttataatagttttgctagtgagtggttaaatgctgctcaaggtttagggtatcctccg
aaaaattttgttcaaaatttaactaaatttcatataaaagaaataaatatcaatcaactt
ttaaagttttggtctcatccggtacgttattggtttaatagacggttaggtattaagttc
tgttcaatagataatcaagtacctaataccgaaccttttattttacaaggtataaatctt
tatcaaataaagaaacaaatacttaattttctaatattaaatcaagatattaatttgctt
tataaaaaatatcatactgcggggaatttaccatatggtgtatatggtaagattttgtgg
aatatacaactggaaaaaatgcaatatatagcacaaattgtgaggaaatattataggggt
agagtagatttagatgttaacttatttattggtgatattttaataaatggttgtataaaa
caaattcaaaatgacgggatattaagatggaattctaatatactgaatatcaatgatggt
ttaaggctatggatagaacatcttatttattgtgctcttggtaaaaaaggtattagtcgt
atttacggagacaaaaatactatttggtattttgacgcattacctcaaaagatagctatt
tcaaaattacaagaatttattaatggttattgcctagggttaaataaaccattgatgtta
ttgcataaaagtggaggagagtgggcatcaactatttttaacaaaaatactagatgcata
aagttagataatcttactaaagacaaagctaaaatgaaattattaaaaacttggcacgga
aacagtaaaatgccaggagaaaagaacgatccatatttatttagaatatggagttcgctt
aatgaaaataggataaaagaaattatatattttgctcataaatggtatataccattactt
caatcaaataaatatgaaaaatataaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
