Candidatus Ishikawaella capsulata: ICMP_219
Help
Entry
ICMP_219 CDS
T04149
Symbol
sppA
Name
(GenBank) protease IV
KO
K04773
protease IV [EC:3.4.21.-]
Organism
icp
Candidatus Ishikawaella capsulata
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
icp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
icp01002
]
ICMP_219 (sppA)
Peptidases and inhibitors [BR:
icp01002
]
Serine peptidases
Family S49: protease IV family
ICMP_219 (sppA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S49
CLP_protease
NfeD1b_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAH83079
UniProt:
C5WCM3
LinkDB
All DBs
Position
264421..266196
Genome browser
AA seq
591 aa
AA seq
DB search
MYILWRMIYNVYIYMVNIVNAIAKFIINKKITILIVIFIVSFWIPIENHSQDSLIITTKP
RALELNINGPIVDEDPYDIRIYQQKVYPSFNMNSMYTIANIINKAKSDSTISCILMNLHN
FTGADQTCLEYVGKYLKDFSSCKPIYVYSCNYDQERYYLASYATQINLERFSEIDLHGLT
ESHIYFNRLLRIFRLVPYIFRVGIYKSATEPFTRDNMSKEDKIASLSVIQQRWNRFIETI
ANNRHTSVQDIFPTNIRNKLNELKMLGDSSQYALNHHMVDNICSEYEFKENLKSIVGMDE
SNQHLNIINMFDYITPENVSVEDNNTNIDIISINFLINRGAKLDNICHKMNELISKKNIK
VVILCMNSPGGDFFSSLKIRELVILLKKSGKKIVVSMGNAATSGAYLIASAADYIIANPI
SMTGSIGAFNIINNFSKILNFLGIHRDGVSISPLHSIAPEEPLTPEQKEMLEIILENNYK
HFVQMIAESRNKTFDQINNIAQGRIWTGKDAMDNGLIDSLGDLDDAIAKAIELGNITDSH
VAWCVNYNTSNIFQPRRVVYDNSGESNDFARSLLDTFKSISNSLNLVSNSD
NT seq
1776 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatattttatggagaatgatttataatgtttatatttacatggttaacattgttaat
gcaatagcaaaatttataattaataaaaaaataactattttaatagttatttttattgta
tccttttggatacccatagaaaaccatagccaggattcgcttataattactactaaacca
agagcattagaactaaatataaacggccctattgtggatgaagatccttatgacatccgc
atataccagcaaaaagtctatccttcctttaatatgaactctatgtatacaatagctaat
ataattaataaggcaaagtctgattcaacaattagttgtattctaatgaatctacataat
tttacaggcgctgatcaaacttgtttagaatatgttggcaaatatctcaaagattttagc
agttgtaaacctatttatgtatattcatgtaattatgatcaagaaagatattatctggct
agttatgctacacaaattaacttagaaaggttctcagagattgatctacatggattaaca
gaatctcatatttatttcaatcgtctactgagaatatttagattagttccttatatcttt
cgagtagggatttataaatctgctacagaaccttttacccgcgataatatgtctaaagag
gataaaattgcctctttatctgtgattcagcaacgttggaacagatttatagagactatt
gcaaataatagacatacttcggtgcaagatatctttcctacgaacataagaaataagttg
aatgaattaaaaatgctcggagattcatcacaatatgcacttaatcatcatatggtagat
aatatttgttctgaatatgaattcaaggaaaatttaaaatctatagttggtatggatgaa
tcaaatcaacatttgaacattatcaatatgtttgattatattacaccggaaaatgtatca
gtagaagataataatactaatattgatattatatcaattaattttctaattaatagagga
gctaaattagataatatttgtcataaaatgaacgaacttatatcgaaaaaaaatattaag
gttgtcattctttgtatgaatagtccaggaggtgacttttttagttcactaaaaattaga
gaattagtaattttattgaaaaaatcaggaaaaaaaatagtagtatccatgggaaacgca
gctacttccggagcttatctgattgctagtgctgcagattatattatagcaaatcctatt
tcaatgactggatcaataggtgcttttaatataataaataatttttcaaaaattcttaat
tttttaggtatacatagagatggagtttctatttcaccattacatagcattgcacctgaa
gaaccattaactccagaacaaaaagaaatgctagaaattattctggaaaataattataag
cattttgtacaaatgatagctgaatcacgtaataaaacatttgatcaaattaataatatt
gctcaaggacgtatatggactggaaaagatgcaatggataatggtttaatcgattcttta
ggagatttggatgatgctattgcaaaagcaatagaattaggaaatataacagattcgcac
gtagcatggtgtgtaaattataatacttcaaatattttccaacccagaagagtagtatat
gataatagtggtgagtctaatgattttgctaggtcgttattggatacttttaaatcgata
agtaattcattgaatttggtgtctaatagtgattag
DBGET
integrated database retrieval system
