Candidatus Ishikawaella capsulata: ICMP_360
Help
Entry
ICMP_360 CDS
T04149
Symbol
potB
Name
(GenBank) spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein
KO
K11071
spermidine/putrescine transport system permease protein
Organism
icp
Candidatus Ishikawaella capsulata
Pathway
icp02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
icp00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
ICMP_360 (potB)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
icp02000
]
ICMP_360 (potB)
Transporters [BR:
icp02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Mineral and organic ion transporters
Spermidine/putrescine transporter
ICMP_360 (potB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAH83213
UniProt:
C5WD07
LinkDB
All DBs
Position
416152..417018
Genome browser
AA seq
288 aa
AA seq
DB search
MRLMHNLFQKIVIALIVSWMTIFVLLPNLMVFITSFLTRSNDHLISPVFTFNNYSQLLNP
LYAKVIMHSLYMAFNATIFCLIIGYPFAWSITGISKQQLRSMMLILLILPFWTSSLIRIY
SLKNLLSAGGLLNRFLVWLGVITNPLHIIYTQQAVIIGLIYILFPFMVLPIYSSLEKLNK
IYLEASRDLGASKIQRFLHIIIPLTMPGIVAGCLLVFVPAMGMFFVSDLMGGAKNLLIGN
VIKNQFLNIRDWPLGSATSIIITLLMGFMLLCYWYTISRIHIYSNKVK
NT seq
867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggttaatgcataatttatttcaaaaaattgtaatagcattaattgttagttggatg
actatatttgttttattgcctaacttaatggtttttattactagttttcttaccagaagt
aatgatcatctaattagtccagtttttacttttaataattattcacaattattaaatcca
ctatatgctaaggtaataatgcactcattatatatggcatttaatgctactatattttgt
ctaataatagggtatccatttgcttggagtataacaggaatctccaagcagcagcttcgc
tcaatgatgctaatattattaatattgcctttttggacaagttctctaattcgtatatat
agcttaaaaaatttgcttagtgctggtggattgttaaatagatttttagtttggctaggt
gtaattactaacccgttacatattatatatacacaacaagcagtaataattggactaatt
tatattctatttcctttcatggtactaccaatttactctagtttagaaaagttaaataaa
atttatttagaagcctctcgagatcttggagctagtaaaatacagagatttttacatatt
attattcccttgactatgcctggcatagttgctggttgtttgctagtatttgtaccggca
atgggaatgttttttgtatcggacttgatgggaggtgcaaaaaatttgttaattggtaat
gtgattaaaaaccaatttttaaatatacgtgattggccattgggatcagcaactagtatt
ataataactttgctgatgggtttcatgttactatgttattggtatactatatcccgtatt
catatctactcaaacaaggtaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
