Idiomarina sp. OT37-5b: C5610_07410
Help
Entry
C5610_07410 CDS
T05379
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
idt
Idiomarina sp. OT37-5b
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVJ56154
LinkDB
All DBs
Position
complement(1589349..1593347)
Genome browser
AA seq
1332 aa
AA seq
DB search
MKPSRKSLALCGVLVLLFTTLVKAENEQYNIKPLDIEPDINNVDLLSGRFYPNLPELSIP
AAPRLTLNTLQQFDSKVIGKLYPRTTQRQESFSLTFGAKTSEYFDCESSDCEPQGNTGSM
FVGRVGGSSFRYIQGKTGIKVVYASKSSYFDYSGDPYASISAQTTYYATNVNYPDGESLQ
IYYDKVTQSGVTYHRPVKVTSDVGYQLILNYFSNDISTGSLGWSKLKRAHIAKISSPSDV
LAEVNYSSTGNFTDLGGLQWQFSGFSNALGASDFARSFTLKGPADTKNRLSLSSATRSYA
GIFHNNFVTSVTRNGQSYQYSYTAASGSGSDPRKQFSKLIITGPESYRRTVEYFVWGGAE
KRQLVKSDTDSLGNKTSYTYTTDKRVETVTFPEGNKVKFTYDSHGNITSKRSIAKPGFSL
PDKLERAVYPSTCTELTCYRPIYTVDANGNRTDYTFSSIHGGLLTKTEPADANGFRRKTI
NDYSQINGVYRLTKQTVCVVGQCGGAQAQVTNYTYWQNTGLIKTETRTNGNGTPAQQTTY
TYDDAGRLLIEDGPLGGVDDAVYFGYDDSGRQIWQANEKNAAGYFAAERISYPTASSRKR
VTERGTISSRTSTGLTVDVTVTEFLNSDNNVIKKELAAPTTPKQVWQYSHDSRGRVICEA
VRMNSGAFSQLPSSACTLGTEGLFGPDRVKRITYDKVSRTTSITTAVGTPIESVERINSY
SANGNLISVTDGNGNTTSYSFDGHDRLQRTTFPNSTYEKNTYDLNDNILTLRKRDGVVLT
YAYNSRNQPVSLAVPNESTVYYQYDGMGRRSEVSRGLSVITYQYDNLGRLAKSITNGRAL
SYAYTQANERKRLTFPDGFYVTFNHDHRGELVSILQNGSSTVLSYSYDRIGRIKTINRAA
GVTSSIQYDRMDRISQYNHSGITDISFSYTPSNQLASRAVSNDTHQIAIPTLSTESYSVN
NLNQYTKVTAGGINKSLTYSTAGNMTSYDGWSYQYTNQNRLKKATKSGTTVNLTYDALGH
LSSTTHNGSKIEYLYDGDELVAEYNGSGTLLRRYIHGSGIDDPVIRYDGGGTSSRRYLHR
DERGTIIAETTASGSILARHQYGPFGQPINGSNARFRYTGQILIPGTELYYYKARIYHPK
LGRFLQTDPVGYEDQMNLYAYVANDPINHTDPTGKFLNFLVGAAIGGGIDLAAQVYNSMS
DGASLGEALANADYGSVATSAALSSVGAMGTQLVKGGVTGAIKVGKETVNLTTKTERVIA
GADGATKVAAVGAIQAGRKGESMTEGAAVKVVDSVTSPVPAGTMAQKGMEYLNQQSESTQ
SNSTCTKKDGSC
NT seq
3999 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaccatcaaggaagagtctggccttatgcggcgtattggtattgctttttacaact
ttagtaaaagcagagaacgaacaatacaacattaaaccactcgatattgaacccgacatc
aacaatgtcgatttgttaagtggccgtttttaccctaatttacctgaactctccattccc
gcagcaccaaggttaacgttaaataccttgcaacagtttgatagtaaggtgatcggtaag
ttatacccacgaacaacccagcgtcaggaaagcttttctcttacatttggagcgaaaaca
tcagaatactttgactgtgaatccagcgactgtgaacctcaaggtaatacgggatcgatg
tttgtgggtagggttggaggctcaagttttcgctacatacaagggaagacaggaataaaa
gttgtttatgcatccaaatcgtcttatttcgattattcaggtgacccctatgcctccatt
agtgcacaaacaacttattacgcgacgaatgttaattatcctgatggagagtcgttgcag
atctattacgataaagtgactcagtcaggcgttacctatcaccggcctgtaaaggtaacc
tctgatgttggttatcagcttatcttaaattatttttcgaacgatatttcgacaggttca
ctggggtggagtaaacttaaaagagctcacatcgccaaaatatctagtccctctgatgta
ttggctgaagttaattacagttcaacaggtaatttcacggatttaggcgggcttcagtgg
cagttttctggattcagtaatgcgcttggagccagtgatttcgcgaggagctttacccta
aaagggcctgcagatacgaagaatagactgtctttatcaagtgcaaccagaagctatgca
gggatattccacaataactttgtaacctcagttacgcgtaacggtcagagctaccaatat
agctatacagccgcctctggctctggctcagatccaaggaaacagttctcgaaacttatt
ataacgggtcctgaaagctaccgaagaacagtcgagtattttgtgtggggcggtgcagag
aaacgccaattggttaagtcagatacagactcgctgggaaataaaacaagctacacgtac
acaaccgataaacgggttgaaacggtaacttttcctgagggaaataaagttaaatttact
tatgattcccatggcaatattacgagtaaacgaagcatcgctaagccaggttttagtcta
ccggataagttagagcgagccgtttatccaagtacatgcacagagctcacctgctatcga
ccgatttacactgttgatgccaacggcaatagaacggactatactttttcatcgattcat
ggcggtctgcttactaaaactgagcctgccgatgcgaatggctttcgcaggaaaacgata
aatgactattcgcaaattaatggagtttatcgattaacaaagcaaacggtttgtgtggtt
ggtcagtgtggcggagcacaggctcaagtgacgaattatacatactggcagaatacaggc
cttataaaaacagaaacacgaacaaatggtaatgggacgcctgctcagcagaccacttat
acgtatgatgatgccggacgcctactgatagaggatggtcctcttggcggggtcgatgac
gctgtatattttggttacgacgactcaggtagacagatctggcaagcaaacgaaaaaaat
gcagcgggctactttgctgcagagagaattagttaccccactgctagcagccgaaaacgc
gtgaccgagcggggaaccatctcttccaggacgagtacgggcctgacagtagacgtgacg
gtcacggagtttttaaatagtgacaataatgtcatcaaaaaagagttagcagccccaacg
acgcctaaacaagtctggcagtatagccatgactcacgggggcgtgtaatatgtgaggcg
gttaggatgaatagcggcgcattttcacagctaccgagctcggcttgcactctaggtact
gagggtctctttggccctgacagagtcaaacggataacatacgataaagtgtcaagaacg
acaagtattacaacggctgtcgggacgccgattgaatcagtcgaaagaataaatagttac
tctgcaaacggtaatctgatatctgttaccgatggaaatggaaacacgacatcatattcc
tttgacgggcatgaccggcttcagcgtacaacatttccaaacagcacgtatgagaaaaac
acgtatgatttaaatgacaacattcttaccttaagaaagcgagatggtgttgtccttact
tacgcttataactcgagaaaccagcccgtcagcttagctgttccgaatgaatcgacagtt
tactatcagtacgatgggatgggacggcgttcagaggtttcccggggcctgagtgtaata
acgtaccaatacgataatttagggcgtttggccaagtcgataacgaatggcagagctctg
agctatgcttacactcaagctaacgagcgaaaacggttaacgtttccggatgggttctat
gtaacatttaaccatgaccaccggggcgagttagtcagtatactgcaaaatggaagcagc
accgttctgtcttatagctatgaccggataggtcgtattaagacgataaaccgtgcagca
ggcgtaacgtccagtattcagtatgaccgcatggatcggatttcccaatacaaccatagt
gggataactgatattagctttagctatacaccgtcgaatcaattagcatcaagagcggtc
agtaatgacacacatcagatagccattccgacactcagcactgaaagctattcggttaat
aacctcaaccagtatacgaaagtgacagcgggtgggataaataagtcactcacttattcg
actgccggaaatatgacgtcatatgacggttggagctaccagtacaccaaccagaatagg
cttaaaaaggcgaccaagtcaggaacaaccgtcaacctgacgtatgatgcgctgggacat
ttaagttcaacgactcacaatggcagtaagattgaatatctctatgatggcgatgagttg
gttgctgagtataatggtagtggcacgttgctgcgcagatatatccatggttcaggtatc
gatgacccggttatccggtatgacggcggcggcacttcgagtcgccgttatttacaccgt
gatgaacgggggacaataatcgctgaaacaaccgcttcagggagtattctggcaaggcat
caatacgggccttttggtcagcctattaacgggagcaatgcacggtttcgctataccggg
cagatattgatcccaggaactgagctatattactacaaagcacggatttatcatccaaag
ctaggccgattcctgcaaactgacccggtgggttatgaagaccagatgaacctgtatgct
tatgttgctaatgatccaattaaccacactgatccaacgggcaaattccttaacttttta
gttggagctgcgataggaggcggtattgatttggctgcacaggtttacaactctatgagt
gatggtgctagtcttggagaagcgttggctaatgctgattacggaagtgttgcaacttca
gcagctttaagctctgttggtgcaatgggcactcagcttgtgaaaggtggtgtaactggt
gcgatcaaggtaggtaaggaaactgtaaacttaactacaaagacagaaagagttattgct
ggtgctgatggagcaactaaagtcgcagcagttggagcaatccaagctggccgaaaagga
gagagtatgaccgaaggagctgctgttaaagtcgttgatagtgttactagtccagtacca
gcaggaacaatggctcaaaaaggtatggagtatttgaaccaacaatctgaaagtactcaa
agtaatagcacatgtactaaaaaagatggaagctgttga
DBGET
integrated database retrieval system