Idiomarina sp. OT37-5b: C5610_10495
Help
Entry
C5610_10495 CDS
T05379
Name
(GenBank) CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter
KO
K15726
heavy metal efflux system protein
Organism
idt
Idiomarina sp. OT37-5b
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
idt00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
idt02000
]
C5610_10495
Transporters [BR:
idt02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
C5610_10495
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVJ56673
LinkDB
All DBs
Position
complement(2207350..2210427)
Genome browser
AA seq
1025 aa
AA seq
DB search
MIDRIIQWSLHNRLIVIALALVLLVWGGYSTIKAPVDVFPDLTAPSVTIVTEAHGMPPED
VEKLITFPIESAMNGASGVRRVRSNSGIGISVVTVEFDWETDVYLARQMVSERLQTLQNE
LPADVGAPQMAPVSSIMGEIMFLALTSEAHSEIELKTTADYTIRRRLLAVPGVAEVISTG
GQVKQYQVVAKPDALIANDLSLDDVTKALEGSNMTSSAGFVKQNQQEFLIQGMGRIESQS
DIEQTVIVNRGGIPVLVQDIANVEVGPALRRGTAAFNGRSGVVLGIQKQPNTNTLELTDD
LDRVINDINQSLPEGMTLQTDTFRQSDFIETSIGNLNSALRDGAILVVAIMFIFLFSARA
TGIALVAIPLSLLVAVLTIRHFGGSLNTMTLGGMTIALGALVDDAIIVVENVVKRLRENL
AKPAAEQLSKLKVIAGATREIESSIVFATFIIVLVFLPLFFLQGVEGRLLQPLGVAYIVS
ILASLLVAITITPVLSYYGLSGSKSLLASHDTRFISALKASYRPILNGSLQRPKLLLSSA
GVLLLIALVAVFQFGRGFLPEFNEGSLTVSVVTVPGTSLEKSDAIGERVERILLDEPEVV
ATTRRTGRAERDPHAQQVFASEIDVKLSMQSRSKEALLESLRQEFFFLTGVNVIIGQPIS
HRIDHMLSGTRANIAIKLFGNELYKLRQLGAQIESLVKEVPGAVDVAMDQQAEIPFITFD
FKRAQLAQYGMSIEQASHALETAFAGTSASRILEEQATFDLVVRYPYRYREDIESLKNTM
IKAPNGAVIPFSAIADINKTRGANTITRENVQRNLVVMANVSGRDLIGVVDDIEQRIAQS
IDLPTGYYIEFGGQFESAESANTRLMLLGIGVIIGIYLLLLTAFNSAKEAFLVMLNLPLA
LIGGVAGIYFAGGVINIAVIIGFITLFGIATRNGVILVDYIKQLMAKGVELTDAIKQASE
ERLVPILMTALATALALIPLSLGLGEPGSEIQAPMAIVILWGLISSTVLNMVIVPAGYFL
LNRHK
NT seq
3078 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattgatcgaattattcagtggtcgctccataataggctgattgttattgcgttggca
ttagtgcttttggtctggggtggttacagcaccattaaagcgcccgtcgatgtatttcct
gacttaaccgcgccatcggtcactattgtgacagaagctcacggtatgccgccggaagac
gttgaaaaactcattacctttccgattgagtccgcgatgaacggcgcctcgggggtacgt
cgggttcgctctaatagtggcattggtattagtgttgttaccgttgagtttgactgggaa
accgatgtttatttggctcgtcagatggtgtcggagcgtctgcaaacattacagaatgag
ttacccgcggacgtgggagcaccgcagatggcaccggtgtcctctattatgggcgaaatt
atgtttttagcactgacctcagaggcgcattcggagatagagctaaaaacaacggctgat
tacaccattagacggcggttgctggctgtgcctggcgttgctgaagtgatttcgaccggg
gggcaagttaagcaataccaagttgtcgcgaaaccggatgcactcattgctaatgattta
tcgcttgatgatgtgaccaaagctttagaaggctccaacatgacgtcatcggctggcttt
gtaaaacagaaccagcaggagtttctcatccagggcatgggacgcatagagtcgcaaagc
gatatcgaacaaactgtgatcgttaatcgcggtggtattccggtgttagtgcaggatatt
gccaacgttgaagttgggcctgccttacgtcgtgggactgcggcttttaatggtcgctcg
ggtgtggtgttgggtattcaaaagcaaccgaacaccaatacgctagaattaacggacgac
ttagatcgcgtcattaatgatatcaaccaaagtctgccagagggcatgacgctacagaca
gatacgttccgtcagtctgactttattgaaacatccattggcaacctaaacagcgcgctt
agagacggtgcgattttagtcgttgccattatgtttattttcctcttcagtgcccgagca
accggtattgccttagtggcaattccgctgtcgttattggttgctgtcttaaccattcgc
cacttcggaggctctctaaatacaatgaccttaggcggtatgacgattgccttaggtgcg
cttgttgatgacgccattattgtggttgaaaacgtggttaagcgactccgtgaaaatttg
gcgaagccggctgcggagcaactgtctaaattaaaagtgatcgctggcgcaacacgagaa
atagaaagctcgattgtgtttgcgacctttatcattgttttggtttttttaccgctgttc
tttttacaaggcgttgaagggcgtttgctgcaaccgttaggcgttgcctatattgtttct
attcttgcgtctctactggtcgcgatcacgattacgccggtactcagttactatggtttg
agcggcagtaagagtttactggcatcgcacgatacgcgctttattagcgcgcttaaggca
agctatcgacccattctcaatggctcactgcaacggccaaaacttttgctatcgtcagcg
ggcgtgctgttgctgattgcgttagtagcggtgttccaatttgggcgcggttttttgccg
gagtttaatgagggcagcttaacggtcagtgtggttacggtaccaggaacctcattagaa
aagtccgatgctatcggtgaacgtgtagagcggatcttactggacgagcccgaagtggtt
gcgacgacacgccgtaccggacgtgctgaacgagacccacacgcacagcaagtgtttgca
tcggagatcgacgttaagctcagtatgcagtcccgctctaaagaggcgctgctcgagagc
ctacgccaagagtttttctttcttaccggggttaacgtcattatcgggcaacccatatcg
catcgtatagaccatatgctgtcaggcacgagagcaaacatcgccattaagttatttggc
aatgagctgtacaaactgcgtcagctgggcgcccaaatcgaaagcttggtcaaagaagtt
ccgggagccgttgacgtagcgatggatcagcaagcggaaattccgtttattacctttgat
ttcaagcgggctcagttagcgcagtatgggatgagtatcgagcaggcatcgcatgcgttg
gaaacggcgtttgccggaacatcggccagtcgcattcttgaagagcaggcgacctttgac
ctggtggtacgctacccttatcggtatcgcgaagatattgagtcgttaaaaaataccatg
attaaggccccgaatggcgcggttattccgttctcagccatcgcagatatcaataagacg
cgcggtgctaacaccattacccgtgaaaatgtgcagcgtaacctggtggtcatggcaaac
gtgagtggtcgcgaccttattggtgtggttgacgatattgagcaacggatagcgcagagt
atcgacctgcccacgggttactatattgagtttggtggacagtttgagagtgccgagagc
gctaacacacggctaatgctgctaggtattggcgtaattattggcatttatttgttgcta
ctcacggcgtttaactcggctaaagaagcgtttctggtgatgttaaacctgccgttagcg
ctgattggtggtgtcgctggcatttactttgctggtggtgttatcaacattgctgtcatt
atcggttttatcacactgtttggtatagccacgcgaaatggcgttattttagtggactac
atcaagcagcttatggctaaaggtgtcgaattaacggatgccattaagcaagcatcagaa
gaacggttagtacctattttgatgacggcgctggcaacggcattagcgctcattccatta
tcattagggcttggtgagccaggcagtgaaatccaggcccctatggcgatagttatcctt
tggggtcttatttcttcgacggtgcttaatatggtgatagtgccggcgggctatttcttg
ctaaatagacataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system