Idiomarina sp. OT37-5b: C5610_11155
Help
Entry
C5610_11155 CDS
T05379
Name
(GenBank) sodium:proline symporter
Organism
idt
Idiomarina sp. OT37-5b
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_8
PAS_4
PAS
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVJ56793
LinkDB
All DBs
Position
2353215..2356577
Genome browser
AA seq
1120 aa
AA seq
DB search
MLSVSLTLATAVIYLLILFAIAYRGDRSATQPVKPYRYALAQGVHCTSWAFFGTVTQSAH
YGWAFAPTYIGAIVVFLFLHAVQLRLLSYCKQQNITSIADLIGTRYGKSPLLASVVAITA
LIAVVPYISLQLRAVTASFSAVTGFEPNPFWLFDLSALVALVMIGFGFLFGTRRLSLAEQ
HGGLMDAVAFESLVKLGAFIIVGLFATYGLFDGLADLLDKSFAEPVTQAALNGVEGGGYI
YLVHILLGALSMFCLPRQFHVSYVENTHSDELRVARWAFPLYLFAINFFILPIALAALLI
APEQASTDTFMLVIPLSSDTAWLSLIAFIGGLAAATSMVIIALLALSIMISNDVVMPLWL
RIGHQQLTRLQFTPSRILWVRRITIMVVMLLAYVYYQLTIDTLPLVNSGLLSLALLAQLG
PAIIGSVVWRRNSQLAVISGLAIGTGIWFITLFLPALDTANPISDVQVADGVLLSLGSNL
LLYLLVSIVYRPASNGRDSSGFDEMTQDPSLTWGRLRALLERLYNDEQLVTLQQKLGTDL
VSQDSQSYVPARTLMRLERELSGIIGTSATRLLFDTITEQQNLPVAKVVDWATEASKLYQ
FNRELLQASVENIPQGISVIDRELRLVAWNRRYLEIFDYPEGLVKAGMPVADLLYYNAQR
GLLSCSEDNDVNAEIEKRLNYLRAGSAYKYQRAQGDSIIELQGNPMPGGGFVTTYSDITD
RVEAQQALQRINTELEQRVNERTEQLLLAKQAEEKAHLSKSRFFAAVSHDLMQPFNAASL
FCEMLQSRADSEQLPLALNLRRSLDHAEELLTMLLDMTKLDAGNLSPEWQSIALDQVLSP
LVDRYQAMASEKGLTFHYQRSSAVIRSDRKLLTRIVQNLLSNALRYTGQGRIILGSKRNG
NRLTLWVIDTGEGIPAHKQQEIFREFHQLRSEGDNPGLGLGLSIVERICRLMEVPIEVRS
EPGMGTAFGIQLPVEHWLRQRSAPASVPAVSVDEDLLRGLCVLVIDNDVRVLNATASLLQ
QWGAKVLTATSLADVKSSTKVDLIFADYHLDHGATGIDAVRALRERWQHHTAAIINSADP
DEVLREQALEVGAHFIPKPLKSGALKRLIKRLRSIQHLPK
NT seq
3363 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctttcggtcagtttaacactcgcaacggcggtcatttatttattgattctgtttgcc
attgcttatcgcggcgaccgttctgcaacacagcccgttaaaccctatcgttacgccctg
gcacagggtgtgcattgtacctcttgggcgttttttggcacggttacgcagtcggctcac
tatggctgggcgtttgcgccaacctacatcggcgccatcgtggtgtttttgtttttacat
gcggtacaactgcgcctgttaagctattgcaaacaacaaaatattacctcgattgcggat
ctcatcggcacccgctatggcaagtcacccttgttagccagcgttgtcgccatcaccgcg
ttgatcgccgttgtgccctatatttccctgcaattgcgggccgtaactgcgagcttctct
gccgtcaccgggttcgaaccgaatccattctggctgtttgatttatccgcgttggtggct
ttggtcatgattggttttggcttcttattcggtacccgtcgcttaagcctcgccgaacag
catggtggcttaatggacgccgtggcgtttgagtcgctggtcaagctgggcgcttttatt
attgtcggactgtttgccacttatggcctgttcgatggtttagccgacttacttgataag
agctttgctgagccggtcactcaagcggctctgaacggtgtcgagggcggcggttatatt
tacttagtgcacattttgttaggcgcattgtcgatgttttgtctgcccagacagtttcac
gtcagctacgtcgagaatacacacagtgatgaattacgtgttgcccgctgggcatttccg
ctttacctgttcgcgattaacttctttattttgcccatcgccctggcagcactcttaatc
gcgccggagcaggcatcaacggatactttcatgctggtgattccgctttccagcgacact
gcatggctgtctcttatcgcctttatcggtggactggcagcagcaaccagcatggtcatc
atcgcgctgctggcactcagcatcatgatttcgaacgatgtcgtgatgccgctgtggttg
cggattggtcatcaacagctgactcgcctgcaatttaccccttcgcgaatactgtgggta
aggcggattaccattatggtggtgatgttacttgcctacgtttactatcaactcaccatt
gatacgctccccttggttaactccggattattgtcactggcgttgcttgcacaattaggt
ccggccatcatcggcagtgttgtgtggcggcgtaacagccaactggcggtgatcagtggt
ttagccattggcacaggtatctggtttatcaccttatttttaccagcgcttgataccgct
aatccaatttctgatgtgcaggtagccgatggtgtgctgttgagtctcgggagtaatctg
ttgctttacctgctggtttccattgtttatcggcccgcaagcaacggcagagatagcagc
ggttttgacgagatgacgcaagaccccagcttaacctggggacgtctgcgcgccttgctt
gagcgcctctataacgatgagcaactggtcactctgcaacagaagcttggtactgatctt
gtcagccaggattcgcaaagctacgtaccggcacgaacattaatgcgcctggaacgcgag
ctgtccggtattatcggaacttcggccacgcgcttgctgtttgataccatcaccgaacaa
cagaacctacccgtggctaaggtggttgactgggccactgaagcatccaaactgtaccaa
tttaaccgtgaactgttacaggcgtcggtagagaatattccacagggcatcagcgtcatt
gaccgtgaactcagactggttgcctggaatcgccgttacctggaaatctttgattatcct
gaaggcctcgtgaaagccggaatgcctgttgccgatctgctctattacaacgcccagcgc
ggcctactcagttgctcggaggataatgacgtcaacgccgaaattgagaaacggctgaat
tatctacgagccggcagcgcttataaatatcaacgagcgcaaggcgattcgattattgag
ctgcaaggcaatccaatgcccggcggtggctttgtcaccacctacagcgatatcaccgac
cgtgtcgaggctcagcaggcgttgcagcggattaacaccgagctcgaacaacgtgttaac
gaacgcaccgagcagctattgctggccaaacaggcggaagagaaagcacatctgagtaaa
tcgcgcttttttgcggctgtcagccatgatttgatgcaaccgtttaacgccgccagcctc
ttttgcgaaatgctgcagtcgcgggctgacagcgaacaactgccgttagcgttaaacctt
cgccgttcacttgatcacgcagaagagctgctgaccatgctgttggatatgaccaagctg
gatgctggtaacctcagcccggagtggcaatcgattgcactggatcaggtactgtcccca
ttggttgaccggtatcaggctatggcgtccgaaaaaggactgacctttcattatcaacgc
agttctgccgtaatacgcagtgacagaaagttattaacccgcatcgttcagaacctgtta
tccaatgccctccgttataccggtcagggccggatcattcttggcagtaaacgtaatggc
aatcgcctaacactgtgggttatcgataccggcgaaggtatacctgcgcacaaacagcag
gaaattttcagagagtttcatcaattacgatccgaaggcgataatcccggcctggggctg
ggtttgtcgattgtcgagcgcatctgtcgactaatggaagtacccatcgaagtccgctca
gagcccggtatgggcacggcatttggtattcaattaccggtcgaacactggcttcgacag
cgttcagcgccagcctccgttccagccgttagcgttgacgaagacttattgcgtggcctc
tgtgtcttggttatcgataacgatgttcgcgtgctcaatgcgaccgcgtcactgctacag
caatggggcgcaaaagtccttaccgcaacttccctcgccgacgtcaaatcctcaactaag
gtcgacctgatttttgccgattatcacctcgaccatggcgccaccgggattgatgcggtt
cgggcgctgcgtgaacgttggcagcatcacaccgctgcgatcattaattcggctgacccg
gacgaagtgctgcgtgaacaagcattagaagtaggtgctcactttattcccaaaccatta
aaaagtggcgcattaaagcggctcattaaacgtctcagaagtatccagcatctgccgaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system