Iocasia frigidifontis: GM661_04520
Help
Entry
GM661_04520 CDS
T07718
Name
(GenBank) exopolygalacturonate lyase
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
ifn
Iocasia frigidifontis
Pathway
ifn00040
Pentose and glucuronate interconversions
ifn01100
Metabolic pathways
ifn01120
Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ifn00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
GM661_04520
Enzymes [BR:
ifn01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
GM661_04520
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pel9A-like_beta_helix
Big_3
PelX_N
PelX_Ig
Beta_helix
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTL97297
UniProt:
A0A8A7KEH4
LinkDB
All DBs
Position
937065..940892
Genome browser
AA seq
1275 aa
AA seq
DB search
MKYNLKGGLWFILTSVLLVSFIISAVILAEDEMISVSSDWQGSIFGNLGGQNKITKENFE
INENTDGTVRLRSSNNRGKIESKSEGIAYYFKEVPADANFELSATATVESFEMHNQVSFG
LMVRDKVLINESNKEDIGYTLAAGILNAKKDVPKIGFYRTAEGQTKLGELVNDAVPSAGN
TYDLSIKKSGDVYILKFGNEEPVIIENFSGFETGKLFAGLYTARNTTVIFSDINFSLDTR
KVKDLHVDTTAMPTDYLLEEELDLTGLKVTAEFSDGSKEILSEDDYIVTGFDSNTVGTNP
ISINYNGVSRTVNLEINSLTCTGLKIKYYPAKTDYYLGDRFDPEGFAVMAEYNEGYKSEE
LTVDKYTFSIAGESMPGSDYVFDSAGEKIVTVSSMENPAISISFAVNVKTAEITGLEISK
VPEKELYFLSDKLNLTGMTVYAKYSDGSRIRLMKDEFSVSSLDTTSPGEKKVIISHKGKE
AVLNLTVKMKELTGLEVTEYPQTTFYLGDDFTSRGLEVSLVYDNGDKEVLAGSNYTVDFS
NFDNTKMGVYDVKIIPTDSLITAITYPVTVREKTEYEWKYTRFGQSTSEEDNFIDIKEDG
TIELASINGGGKVATDHDGISFYYTVIDASKDNFVLSADIKVIEYAKSPHDGQEAFGIMA
RDAIGEFGDTGVFASNMVGLGGYSGGTKEPNGTQLFMRTGVESSDGAGSNGTSSMMIKEE
KPKTSNTYPAKEYRLTLAKTNSGYTGRLNGGKEVMLFEPNFLNVQDSKVYLGFFAGRVGH
IEVSNVDFKVSAAKTDAPKVGPSEEAVTPTLDFLSLDKTSKTDYNFLLKSNVKGIVIVKQ
GRKVIARDQVVKAKQEYLIETELAENTKTNFSVSFLPDDTQYLTSCDKLVKNFTVEMKSY
VEDGDIYVSPTAISGGAGTLEDPLDLDTAISFVREGQKIILLEGRYVRDSKLEIKKYNDG
TAEARKYLIAAANTNPIIDFDKKTEGVLLSGDYWQVKGIEFTRSAANEKGFVVGGNHNII
EECLFYENGNTGLQISRTDINEDDKSKWPSYNLILNCTSFDNRDPSDNNADGFAAKLTSG
VGNVFRGCIAHHNIDDGWDLYTKVGTGAIGPVVIEDSIAYSNGTLTDGTVGNGDKNGFKL
GGEGVHVPHIIKNCLAFDNGAVGFTSNSNPAVIAINNIALNNIGRNLEFTTYKEIAVDFE
IDGFMSIATKDIPADNFPVELESAKNYMFNGSVSENQLDNRINKNDFVTLIPQLPFERDD
NGRIMIGDFLKLTTK
NT seq
3828 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagtataatttaaaaggtggattatggtttatattaacatcggttttattagtatca
ttcataatatcagcagttattctggctgaagatgaaatgataagtgtttccagtgattgg
caggggagtatctttggtaatcttggtggtcaaaataagatcacaaaagaaaactttgaa
attaacgaaaatactgatggaactgttaggcttaggagttctaataataggggtaagatt
gaaagtaaatcagagggaatagcctactactttaaagaagtacctgctgatgctaacttt
gaattaagtgctacagctactgtcgaatcttttgagatgcataatcaggtatcttttggt
ttaatggttagggataaggtgctcattaatgagagtaataaagaagatattggttatact
ctggctgctggaattcttaatgccaaaaaagatgttcctaaaataggtttttatagaaca
gctgaggggcagacaaagctaggggagttggtaaatgatgctgtccctagtgctggtaat
acctatgatttaagtattaagaaatctggtgatgtatatatattaaagtttggtaatgaa
gaacctgttataattgaaaattttagtggatttgaaactggaaaattatttgccggtctc
tatactgccagaaatacaacagttatctttagtgatattaatttcagtttggataccagg
aaggtcaaggacttacatgtagatacaactgcaatgccgaccgattatcttttagaagaa
gagttagatttaacaggattgaaagtcacagcagaattttctgatggatcaaaagagata
ctgtcagaggatgattatattgtaaccggttttgatagtaacacagtagggactaacccc
attagcataaattataatggagtaagtagaacggttaatttagagataaattctttgacc
tgtacaggtttgaaaataaagtactatccggcaaaaacagattattatctaggagataga
tttgaccctgagggttttgctgtaatggcagaatataatgaaggatataaaagtgaagaa
ctaacagttgataaatataccttttctattgcaggagaatctatgccaggaagtgactat
gtatttgatagtgcaggagaaaaaatagttactgtaagctcaatggagaatcccgctata
tctataagctttgctgtaaatgttaaaactgctgaaattactggcttagaaattagtaaa
gtaccagaaaaggaattatattttcttagtgataaattaaaccttacaggtatgactgtc
tatgctaaatatagtgatggttctagaattagactgatgaaagatgaattctcagtatct
tctttagatactacgagtcctggtgaaaaaaaggttataatttcccacaaaggaaaagag
gcagtattaaatttaactgttaaaatgaaggagttaacaggtcttgaagtcacagaatac
ccacagacaacattttatcttggtgatgattttacaagtagagggttagaggtatcttta
gtatatgacaatggtgataaagaggtattagcaggaagtaattatacagttgatttttcg
aattttgataatactaagatgggagtatatgatgttaagattattcctactgatagttta
atcacagctattacttatccagtaactgtacgagaaaagactgaatatgaatggaaatat
actagatttggtcaatctactagtgaagaggataattttatcgatataaaagaagatggt
acaatagagcttgcttctattaatggtggtggaaaagttgccacagaccatgatggcatc
agtttttattatacagtgattgatgcctccaaagataattttgtattatcggctgatatt
aaagtgattgaatatgctaaaagtccacatgatggtcaggaagcctttggtattatggcc
agagatgccatcggagaatttggtgataccggggtatttgcttctaatatggtaggtcta
ggtggttatagtggaggaaccaaggagcctaatggaacacagttatttatgagaactggt
gttgaatcttcagatggtgcaggaagtaatgggacctcaagtatgatgatcaaggaagag
aaacctaaaaccagtaatacctatcctgctaaggaatataggttgactttagcgaaaaca
aatagtggttatacaggaagacttaatggtggtaaagaggtaatgttatttgaacctaat
tttctaaatgttcaagattcaaaggtttatttaggtttctttgctggtcgtgttgggcat
attgaagtaagtaatgtagactttaaagtctcagcagcaaaaactgatgcaccaaaggtg
gggccttctgaagaggctgtaacaccgaccttggatttcttatcattagataagacttct
aagactgattataatttcttattaaaatctaatgttaaggggatagttattgttaaacaa
gggagaaaagtaatagctagagaccaggtagttaaagctaagcaggaatacttaatagaa
acagaacttgctgagaatactaagactaattttagtgtcagctttttacctgatgatact
cagtatttaacatcatgcgataaattagttaagaactttactgttgagatgaaaagctat
gtagaagatggtgatatctatgtttcaccaactgccattagtggtggtgcaggtacttta
gaagatccactagatcttgatacagcaatttcctttgtacgtgaaggtcagaagatcatc
ttacttgagggtagatatgtacgtgattccaaattggagattaaaaaatataatgatggt
actgctgaggcaaggaagtatctgatagcggcagcaaacacaaatccaatcatagatttt
gataaaaaaactgagggtgttctcttaagtggtgattactggcaggtgaaagggattgaa
tttactcgttcagcagcaaatgagaaaggctttgttgttggtgggaaccataacataatt
gaggaatgtctattctatgagaatggtaatacaggtttacagataagccgtaccgacata
aatgaagatgataagtctaaatggccgtcttataatttaatccttaactgtacatctttt
gataatcgtgatccatctgataataatgctgatgggtttgctgctaagcttacatcaggt
gtaggtaatgtatttaggggatgtattgcccatcataatattgatgatgggtgggattta
tatactaaggtaggaacaggtgctatcggtccagttgtgatagaggactctattgcctat
agtaatggtaccttaacagatggtacagtaggtaatggtgataagaatgggttcaaactt
ggtggtgaaggtgttcatgtaccccatattattaaaaactgcctagcctttgacaatggg
gctgttggttttacaagtaatagtaatccagctgttattgctatcaataatattgctttg
aataatattgggagaaatctggaatttactacttataaagaaattgctgttgattttgaa
attgatggttttatgtctattgctaccaaagatattccagcagataattttcctgtagaa
ttggaatcagctaaaaattatatgtttaatggtagtgtatcagaaaaccagctggacaat
agaataaacaaaaatgattttgtgactttaataccacaactcccttttgaaagggatgat
aacggaaggataatgataggtgattttctaaagttaactactaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system