Iocasia fonsfrigidae: GM661_16100
Help
Entry
GM661_16100 CDS
T07718
Name
(GenBank) S1 RNA-binding domain-containing protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
ifn
Iocasia fonsfrigidae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ifn00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
GM661_16100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
Tex_N
Tex_central_region
HHH_3
S1
HHH_9
HHH_7
YqgF
S1_RRP5
T2SSK
DUF4164
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QTM00082
UniProt:
A0A8A7KFA2
LinkDB
All DBs
Position
complement(3352924..3355089)
Genome browser
AA seq
721 aa
AA seq
DB search
MAKELIGIIADELGIKDRQVKGTVALLDEGNTIPFIARYRKEVTGGLDETQLREIEERLE
YLRNLEKRKEEVIRLIDEQDKLTEELADKINKATVLQEVEDLYRPYRQKRETRASKARQK
GLEPLAELIWKQEDTVVNLEELAQEYINPELEIESISDVYQGVRDIIAEMVSDNAEIRKK
LRHDSFEQGIIESCCTDKGLDEQGKYEIYYEYSELLKKLPPHRVLALNRGEKEGVLQVRV
LTPDEMILDYIKNEIIITDQDVFKQQLEMAIEDSYKRLIAPSIERELRGKLTEQADEHAI
GVFARNLRSLLLQPPLKGHVVMGIDPGFRTGSKVCVIDSTGKLFDTATIYPHPPQNDVES
SRKKITAMLKKHGVNSIAIGNGTASRETELFIVEIIREINIEVKYIIVNEAGASVYSASK
IAREEFPELDVSMRGAVSIARRLQDPLAELVKIEPRSIGVGLYQHDVNEKQLVESLGKVV
ESAVNYVGVDLNTASQSLLQYVAGINSSVAKNIVKYREENGVFKTRSQLKEVYRLGAKTF
TQAAGFLRIDNGDDPLAQTPIHPESYQPTRELLKDLGFLPEDIRNKDRLNLLRSKLSRIS
IVDKAKELEIGIPTLRDIIRALKQPGRDPREELPKPIFRTDVLSLADLKPEMTLQGTVRN
VVDFGAFVDIGVKEDGLVHISEMSSDYVTDPLNIVNVGDIVTVKILAVDEKRKRISLTMK
I
NT seq
2166 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgaaggaattgattggtataattgctgatgaactgggtattaaggatagacaggtt
aagggaacagtagctctgcttgatgagggtaatactattccctttattgccaggtaccgc
aaggaagttactggtggacttgatgagactcagcttagagagattgaagaacgcctggag
tatttacgtaatctggaaaaacgcaaggaagaggttatccgcttaatagatgaacaagat
aaattaacagaggaattagcagataagataaataaggctactgttttgcaggaagttgaa
gacctctatcgcccgtaccggcaaaaacgggaaacaagggcaagtaaggctcgtcaaaag
ggattggagccactggcagagttaatctggaaacaggaagatacagtagttaaccttgaa
gaattagctcaggaatatataaatcctgaattagaaatagagagtataagtgatgtttat
cagggtgtcagggatataattgcggaaatggtttctgataatgcagaaataagaaaaaag
cttagacatgatagctttgagcagggaataattgaaagctgctgtaccgataaagggctt
gatgaacagggtaaatatgagatctactatgagtatagtgaattattaaaaaaactcccc
ccacacagggttctggctttaaacaggggagaaaaggagggtgttttacaggtaagggtc
cttacaccagatgaaatgatcctggattatataaaaaacgaaattattataacagaccag
gatgtatttaaacagcagttagagatggctatagaggatagttataaaaggttaatagcc
ccatcgatagagagagagctcagaggtaagttgactgaacaggcagatgaacatgccatc
ggtgtttttgcacgcaatcttagatcactattattgcaaccacctttaaagggacatgtt
gtcatggggatagacccaggttttagaacaggttcaaaggtctgtgttattgattcgact
ggaaaactatttgacacggcaactatctatcctcatcccccacaaaatgatgtagaatca
tccaggaaaaaaataactgctatgttaaaaaaacatggtgttaattcgattgctattggt
aatggtactgcttctagagaaacagaattatttatagtggaaataattagggagataaat
attgaggtaaagtatataattgttaatgaagcaggcgcttctgtttattcagcatcaaag
atagcccgcgaggaattccctgaacttgatgtttcaatgagaggagcagtgtcaattgcc
agaagattacaagacccactggctgagcttgtgaagattgaaccccgttccattggagta
gggctttatcaacatgatgtcaatgaaaaacagctggtagaatccctgggaaaggttgtt
gaatcagctgttaattatgttggtgttgatttaaatactgcttctcaatcattactgcag
tatgtggcaggtattaatagtagtgtagccaaaaatattgttaaatatcgtgaggaaaat
ggggtttttaagaccaggagtcagttaaaagaggtatatcgtcttggtgctaaaacattt
acacaggctgctgggtttttaagaattgataatggtgatgatcctctggcccaaacccct
atccatccagaatcatatcagcctaccagggaactgttaaaggacttagggtttttaccg
gaagatatcaggaataaagacaggcttaatcttttgagatcaaaattatccaggatatcc
attgttgataaggctaaagaactggagataggtattcccaccctgagggatattatcagg
gccttaaaacagccagggcgtgatcccagagaggaactgcctaaacctatatttaggaca
gatgtccttagtctggcagatttaaaaccagagatgactctccagggaacagtacgcaat
gtagtagattttggtgcttttgttgatattggtgttaaagaagatggtcttgttcatata
tcggagatgagttcagactatgtaacagacccacttaatattgtaaatgttggtgatata
gtcacggttaagatactggctgttgatgaaaagagaaaaaggatttctcttactatgaaa
atataa
DBGET
integrated database retrieval system