KEGG   Iocasia fonsfrigidae: GM661_18465
Entry
GM661_18465       CDS       T07718                                 
Name
(GenBank) HAMP domain-containing protein
  KO
K03406  methyl-accepting chemotaxis protein
Organism
ifn  Iocasia fonsfrigidae
Pathway
ifn02020  Two-component system
ifn02030  Bacterial chemotaxis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ifn00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09132 Signal transduction
   02020 Two-component system
    GM661_18465
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   02030 Bacterial chemotaxis
    GM661_18465
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02035 Bacterial motility proteins [BR:ifn02035]
    GM661_18465
Bacterial motility proteins [BR:ifn02035]
 Flagellar system
  Chemotaxis proteins
   MCPs
    GM661_18465
SSDB
Motif
Pfam: MCPsignal HAMP dCache_1 TMP_3 ATG17_like Spectrin_SYNE1 MAD COG3_N Spectrin_Anc-1 IFT57 Laminin_II T7SS_signal CheZ DUF2203 GCIP_C Med9 HsbA TadB_TadC_N CENP-F_leu_zip DUF3450 ATG16 Fez1
Other DBs
NCBI-ProteinID: QTL99797
UniProt: A0A8A7KLT7
LinkDB
Position
complement(3849398..3851437)
AA seq 679 aa
MFKSLQLKWKISLIITFIAVIVMVVVSYLTYHNTSDMLLEQIDGKIGIIQQSQKNTIAEI
FSQSEKQVAQFAADRDVVNYLYMLHLTLEGDFKSDRLLKSFSYNVRNDSADLRKSIDSSI
TEIAFSYITSPDGIVLADSRMEEDDEMTDFIQVLMPEDEYKNTSSERIMSSDGGNYLLFN
SPIYRNNEDLMGYYVMAVPLSVLNKTLSQSYMADANIQLINKEGIVLNHTDTKLIGRECN
DPWYFSQIKEGVNSVEEKTDRQYKIIQRLAEDRNLYLAIDVPIKVINEPVNKVRNSILMV
AVIGVILIFVTGYFLIGWQLNPLKDLLKAFDLLGKGVIKEEVLLKDKDTERKDEIGILSK
AFNSMVLQLREVINNIIGAAGNVADSSQQLKVISDEVESSSEQVAEAIQEVASGADNQSE
NIDNINFKMKNLAEGIDTMDRSNQDVETLAVEVNQATEKGQNEIEKVSQQMNNIRLSINE
IASGINNLENISNEIDGILEIINSIANQTNLLALNAAIEAARAGEAGRGFTVVADEIRDL
AEESASSAGKIRDLIEDIKSETKDATSKMGEGSRQIETGEKTVESARGAFDDIKASIEKV
NRGIEKASQAVKSVSGESREITEGLDNIASISEETSASSEEVAASSQEQISYIEEMSSLA
DSFAAMADELNELIKRFEL
NT seq 2040 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtttaaatcattacaattaaaatggaaaattagtttgataattacttttattgcagta
atagttatggtggttgtttcttatcttacatatcacaataccagtgatatgttgttagaa
cagattgatggtaagattggtattatacagcagtctcagaaaaatacaattgcagagatc
ttctcccaatcagagaaacaggttgcccagtttgctgctgaccgggatgtagtaaactat
ctgtatatgttacacttaactttagagggtgattttaagtctgatagattgctcaagtca
tttagttataatgtaaggaatgattctgctgatttaagaaagagtatcgacagctcaatt
actgagattgctttttcctatattaccagccctgatgggattgtactggctgattcacgg
atggaagaagacgacgagatgactgattttatacaggtactgatgccagaagatgaatat
aaaaacacctcttctgaaagaataatgagcagtgatgggggaaattacttactatttaat
tcccctatttacaggaataatgaggatttaatgggctattatgtaatggcagtacccctt
agtgtcttaaataaaaccttaagtcagtcatatatggcagatgctaatattcagttgatt
aataaagagggaattgttttaaatcatactgatactaaattaatagggagagaatgtaat
gacccctggtatttttcgcagataaaagagggagttaattctgtagaggaaaaaacagac
aggcagtataagataattcagcggctggccgaagataggaatctgtatttggcaattgat
gttcctatcaaagtaataaatgagccggttaataaggtcagaaacagcattttaatggta
gcagtaattggtgttatcttaatttttgtaacaggttattttctgataggctggcagctt
aatccccttaaagacctcttaaaggcctttgatttacttggtaaaggggttataaaagaa
gaggttttacttaaagataaagatactgaacgtaaggatgaaatagggattttaagtaaa
gcctttaacagtatggttctacaactgagagaagtgattaataatattattggggctgct
ggtaatgttgcagactcctcacaacaattaaaggttatcagtgatgaagtagagtctagc
tctgaacaggttgctgaggctattcaggaggtagcaagcggggctgataatcaatcagag
aatatcgataatattaattttaagatgaaaaatctggctgagggtatagataccatggat
aggtctaaccaggatgttgaaactctggctgtagaggtaaaccaggccaccgaaaaaggt
cagaatgagattgagaaggtaagtcagcagatgaacaatatacggctttccatcaatgaa
atagctagtggtataaataaccttgagaatatctccaatgagattgatggtattttagag
ataattaatagtattgccaatcaaacaaatcttctggccttaaatgcagctattgaggct
gcacgggcaggtgaagcaggtagaggttttactgttgttgctgatgagatacgtgatctg
gctgaagaatctgccagttctgccggtaaaataagggatttgattgaagatatcaaatcc
gagacaaaggatgctaccagcaagatgggagaaggttcccgtcagatagagacaggtgaa
aagaccgttgaatcagccagaggggcctttgatgatatcaaagccagtattgaaaaagta
aacagaggtattgagaaagccagtcaggctgttaagagtgttagcggtgaaagcagggaa
ataactgaaggccttgataacatagccagcatctctgaagaaacctcagccagcagtgaa
gaggtggccgcttccagtcaggaacagatctcctatattgaagagatgagttccctggcc
gattcttttgctgccatggctgatgaactaaatgagcttattaagagatttgagttataa

DBGET integrated database retrieval system