Ictalurus furcatus (blue catfish): 128604043
Help
Entry
128604043 CDS
T09387
Name
(RefSeq) serine-rich adhesin for platelets-like
Organism
ifu
Ictalurus furcatus (blue catfish)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
128604043
NCBI-ProteinID:
XP_053474790
LinkDB
All DBs
Position
29:12933580..12948535
Genome browser
AA seq
3037 aa
AA seq
DB search
MPVVDLEIVLDGGSDVTPADVFVDNEETDDGSDVTPVDVSSVKAVVDPEAEVDGFSDVTP
VEVSIVIALVDSEVEVDDELGDVEDVTAGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVT
VGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELG
DVEDVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRLVEVPSVVSASV
PVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPS
VVSASVPVDELGDVEDVTVGNSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTVGNSDVSLR
PVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTAGD
SDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVA
DVTVGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVD
ELGDVADVTTGDSDVSLRLVEVPTVVSASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRPVEVPSVVS
ASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRLVE
VPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTTGDSDV
SLRLVEVPTVVSASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVT
TGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELDDVADVTAGDSDVSLRLVEVPSVGSASVPVDELA
DVEDVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPTVVSASV
PVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPS
VVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTTGDSDVSLR
PVEVPSVVSASVPVDELDDVEDVTAGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTVGD
SDVSLRLVEVPSVVCASVPVDELGDIADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVA
DVTMGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELDDVEDVTAGDSDVSLRPIEVPSVVSASVPVD
ELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTAGDSDVSLRPVEVPSVVS
ASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVCASVPVDELGDIADVTVGDSDVSLRPVE
VPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDV
SLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTAGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELDDVEDVT
AGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGVSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELG
DVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPSVVSASV
PVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPS
VVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTAGDSDVSLR
LVEVPSVVSASVPVDELDDVEDVTAGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGD
SDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVA
DVTMGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVD
ELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVCASVPVDELGDIADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVS
ASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVE
VPSVVSASVPVDELGDVADVTAGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELDDVEDVTAGDSDV
SLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVT
VGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTAGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELD
DVEDVTAGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASV
PVDELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTMGDSDVSLRLVEVPS
VVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVCASVPVDELGDVADVTTGDSDVSLR
PVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTAGDSDVSLRLVEFPSVVSASVPVDELDDVEDVTAGD
SDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTTGDSDVSLRLVEVPSVVSASVPVDELGDVA
DVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVD
ELGDVEDVTAGDSDVSLRLVEVPTVVSASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVEVPSVVS
ASVPVDELGDVADVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVEDVTVGDSDVSLRLVE
VPSVVCASVPVDELGDIADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTTGDSDV
SLRLVEVPSVVSASIPVDELGDVADVTVGDSDVSLRPVEVPSVVCASVPVDELGDIADVT
VGDSDVSLRPVEVPSVVSDSVPVDELGDVADVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELG
DVEDVTVGDSDVSLRLVEAPSVVSASVPVDELGDVAGVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASV
PVDELGDVADVTTGDSDVSLRPVEVPSVVSASVPVDELGDVADVTTGDSDVSLRHVEVPS
VVSASVPVDELGDVEDVTMGDSDVSLTVVEVPSVLSVVLSMHADCPNEICRMTPIVARDI
IIIIIIISSSSSSSSSSSSSSSSISYKICNNKLWVKC
NT seq
9114 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagtagttgatcttgaaatagtactagatggtggttctgatgtaacacctgctgat
gtttttgttgataatgaagaaacagatgatggctctgatgtaacacctgttgatgtttct
agtgtgaaagctgtagttgatcctgaagcagaagttgatggtttttctgatgtaacacct
gttgaggtttccattgtgatagctttagttgattctgaagtagaagttgatgacgaactt
ggtgatgttgaagatgtgacagcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggtt
cccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgaca
gtgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttct
gttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttca
ctaagaccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggt
gatgttgaagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttccc
agtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtg
ggagattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgtt
ccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcacta
agactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgat
gttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagt
gttgtttctgcttctgttccggtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtggga
aattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttcca
gtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggaaattctgatgtttcactaaga
ccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgtt
gcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgtt
gtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagcgggagat
tctgatgtttcactaagaccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagta
gacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaagacta
gttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgca
gatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtt
tctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgtggcagatgtgacagtgggggattct
gatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagac
gaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggagattctgatgtttcactaagactagtt
gaggttcccactgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagat
gtgacagtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttct
gcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgat
gtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaa
cttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagactagttgag
gttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtg
acagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgct
tctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggagattctgatgtt
tcactaagactagttgaggttcccactgttgtttctgcttctgttccagtagatgaactt
ggtgatgttgaagatgtcacagtgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggtt
cctagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgaca
acgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggtacccagtgttgtttctgcttct
gttccagtagacgaacttgatgatgttgcagatgtgacagcgggagattctgatgtttca
ctaagactagttgaggttcccagtgttggttctgcttctgttccagtagacgaacttgct
gatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgaggttccc
agtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaatg
ggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccactgttgtttctgcttctgtt
ccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcacta
agactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgat
gttgcagatgtgacaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagt
gttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggg
gattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttcca
gtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaaga
cctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagatgaacttgatgatgtt
gaagatgtgacagcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgtt
gtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagat
tctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttgtgcttctgttccagta
gacgaacttggtgatattgcagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagacct
gttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgca
gatgtgacaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtt
tctgcttctgttccagtagacgaacttgatgatgttgaagatgtgacagcgggggattct
gatgtttcactaagacctattgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagac
gaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggagattctgatgtttcactaagactagtt
gaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagat
gtgacagcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttct
gcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgat
gtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttgtgcttctgttccagtagacgaa
cttggtgatattgcagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgag
gttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtg
acaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgct
tctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtt
tcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaactt
ggtgatgttgcagatgtgacagcgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggtt
cccagtgttgtttctgcttctgttccagtagatgaacttgatgatgttgaagatgtgaca
gcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttct
gttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggagtttctgatgtttca
ctaagaccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggt
gatgttgaagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttccc
agtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaatg
ggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgtt
ccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcacta
agacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgat
gttgcagatgtgacaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagt
gttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggg
gattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttcca
gtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagcgggagattctgatgtttcactaaga
ctagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagatgaacttgatgatgtt
gaagatgtgacagcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgtt
gtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggagat
tctgatgtttcactaagaccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagta
gacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaagacta
gttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgca
gatgtgacaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtt
tctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattct
gatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagac
gaacttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagactagtt
gaggttcccagtgttgtttgtgcttctgttccagtagacgaacttggtgatattgcagat
gtgacagtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttct
gcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaatgggggattctgat
gtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaa
cttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgag
gttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtg
acagcgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgct
tctgttccagtagatgaacttgatgatgttgaagatgtgacagcgggggattctgatgtt
tcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaactt
ggtgatgttgaagatgtgacaacgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggtt
cccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgaca
gtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttct
gttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagcgggagattctgatgtttca
ctaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagatgaacttgat
gatgttgaagatgtgacagcgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttccc
agtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacg
ggagattctgatgtttcactaagaccagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgtt
ccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggggattctgatgtttcacta
agactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgat
gttgcagatgtgacaatgggggattctgatgtttcactaagactagttgaggttcccagt
gttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggg
gattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttgtgcttctgttcca
gtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaaga
cctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgtt
gcagatgtgacagcgggagattctgatgtttcactaagactagttgagtttcccagtgtt
gtttctgcttctgttccagtagatgaacttgatgatgttgaagatgtgacagcgggggat
tctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagta
gacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaacgggagattctgatgtttcactaagacta
gttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgca
gatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtt
tctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattct
gatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagac
gaacttggtgatgttgaagatgtgacagcgggggattctgatgtttcactaagactagtt
gaggttcccactgttgtttctgcttctgttccagttgatgaacttggtgatgttgaagat
gtgacagtgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggttcctagtgttgtttct
gcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggggattctgat
gtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaa
cttggtgatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagactagttgag
gttcccagtgttgtttgtgcttctgttccagtagacgaacttggtgatattgcagatgtg
acagtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgct
tctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtt
tcactaagactagttgaggttcccagtgttgtttctgcttctattccagtagacgaactt
ggtgatgttgcagatgtgacagtgggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggtt
cccagtgttgtttgtgcttctgttccagtagacgaacttggtgatattgcagatgtgaca
gtgggagattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgattct
gttccagtagacgaacttggtgatgttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtttca
ctaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggt
gatgttgaagatgtgacagtgggagattctgatgtttcactaagactagttgaggctccc
agtgttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgcaggtgtgacaacg
ggggattctgatgtttcactaagacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgtt
ccagtagacgaacttggtgacgttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtttcacta
agacctgttgaggttcccagtgttgtttctgcttctgttccagtagatgaacttggtgat
gttgcagatgtgacaacgggggattctgatgtttcactaagacatgttgaggttcccagt
gttgtttctgcttctgttccagtagacgaacttggtgatgttgaagatgtgacaatggga
gattctgatgtttcactaacagtagttgaggttcccagtgtgttgtctgtagttctttca
atgcatgctgattgcccaaatgaaatttgcagaatgacacctatagtagcaagagatatt
attattattattattattattagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagtagt
agtagtagtatatcatacaaaatctgcaataataaattatgggtgaaatgttaa
DBGET
integrated database retrieval system