Ignatzschineria rhizosphaerae: MMG00_06080
Help
Entry
MMG00_06080 CDS
T08009
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16087
hemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor protein
Organism
ign
Ignatzschineria rhizosphaerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ign00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ign02000
]
MMG00_06080
Transporters [BR:
ign02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MMG00_06080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNM97409
LinkDB
All DBs
Position
complement(1398894..1401881)
Genome browser
AA seq
995 aa
AA seq
DB search
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DBGET
integrated database retrieval system