Ignatzschineria rhizosphaerae: MMG00_09525
Help
Entry
MMG00_09525 CDS
T08009
Name
(GenBank) heme lyase CcmF/NrfE family subunit
KO
K02198
cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Organism
ign
Ignatzschineria rhizosphaerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ign00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ign02000
]
MMG00_09525
Transporters [BR:
ign02000
]
Other transporters
Others
MMG00_09525
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CcmF_C
Cytochrom_C_asm
ResB
DUF5334
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNM95464
LinkDB
All DBs
Position
complement(2167720..2169687)
Genome browser
AA seq
655 aa
AA seq
DB search
MLPLGQLALYLALGVSIALFILPLIGIKLRSPQLMYSARPLTIWLFVLVGFSFVYLGHLF
WISDFSYSYVFQNSNTKLPDIYKITAIWGGHEGSMLLWVFTLTAWMLGVVFVTRKMPLEL
SAATLAVLGGITVGFIAFLIFTSDPFGRNLSLDLYDGRDLNPLLQDVGLIIHPPLLYMGY
VGFAVPYAFMCAILLTGHIDRLSIRWVRPWALAAWGFLTLGITVGSWWAYYELGWGGWWF
WDPVENASLIPWILGAALIHSLAATEKRKAFTLWTVIIAILTFCLSVLGTFLVRSGVLTS
VHSFAADPSRGQFILMLLAIVTLFGFLLLLFRSHKIRQESHLSLVSKESGILFNNIFLSV
ACFVVLLGTLYPLIVDILQIGKISVGEGYFNEYTVPITMLILVVLGFTPLLRFKEDKFSR
IKTPLIIMGVSAVVLGFATNYLYVGRLDLWVVLGLTLSYWVVFGILFEIKLNGRKTDNYF
QAMKRQTLSRWGMNLGHLGLVITIIGITLTSHYSDEQDRLVRVGETVEVREYGFELLALE
DVKGSNYVGTKGTIQVYQNGKPLRMMYPEKRTYTVSGMPISEVALRPSLIDDLYVAMAEE
RAENAWAIRLYVKPFVRWIWLGGLIISIAALLSILDRRYRIGRKQLQTDAKIQEG
NT seq
1968 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttccgttaggtcaactcgcgctctatctagcgctcggtgtttcgatagcactcttt
attttgccacttatcggcatcaagttacgcagtccccaattaatgtatagtgcaaggcca
ttaactatatggctttttgtgcttgtgggattctcatttgtctatttggggcatctattt
tggattagtgatttctcctactcttatgtcttccaaaactccaatacaaagctccctgat
atctataagattacggcaatttggggggggcatgaagggtcaatgttgctctgggtcttt
accttaacggcgtggatgcttggggttgtatttgtaactcggaaaatgccacttgagctc
tcagcggcaacgcttgcggtacttgggggaattacagttggctttatcgctttcttgatt
tttacctcagatccatttggcagaaatttaagtttagatctttatgatgggcgtgactta
aacccattattacaagatgtggggttaatcattcacccgccgcttctttatatgggttat
gtgggttttgcggtgccttatgcttttatgtgtgcgattttattaacagggcatatcgat
cgattatcgattcgttgggtgcgaccttgggcattagccgcatggggctttttaacatta
ggaattacggtaggtagctggtgggcttattatgagcttggctggggcggttggtggttc
tgggaccctgttgaaaatgcttctcttattccttggattttaggcgctgcacttattcac
tctttagctgcgacagaaaaacgtaaagcctttacgctctggacggtaatcattgcaatt
ttaacgttctgcttaagtgtattaggaacattcttagtgcgttcaggggttttaacttct
gttcactcatttgccgcggacccatcacgagggcagtttatcttaatgcttcttgcgatc
gtgacgctttttgggtttctccttttactctttagatcccataagattcgtcaagagtcg
catttaagcttagtgtcaaaagaatcaggaatcttatttaataatattttcttatctgta
gcctgttttgtggtgttactaggaacgctctacccgctaattgtggatattttacagatt
gggaaaatatctgtaggtgaaggttactttaatgagtataccgtgccaattacgatgttg
attttagtggtattaggatttacgccgctgcttcgctttaaagaagataagtttagccgt
attaaaaccccattaatcattatgggcgttagtgctgtagtgcttggctttgcaacgaac
tacctttatgtggggcgtttagatctttgggtcgttcttggtttaacattgagttattgg
gttgtctttgggattctttttgaaattaaactcaatggccgcaaaacagataattacttc
caagcaatgaagcgtcaaacgctttctcgttgggggatgaatcttggacatttaggttta
gtcattaccattatcgggattaccttaacctcacattatagtgatgaacaagatcgtctt
gttcgagtaggtgaaacggtagaggtacgggaatatggttttgagcttttagcattagaa
gatgtgaaaggatcaaactatgtgggaacaaaaggcacgatccaagtttaccaaaatggg
aagccacttcgtatgatgtatccggaaaaacgtacctatacagttagcggaatgcctatt
agtgaagtggcacttagaccctctttaattgatgacctttatgttgcaatggcagaagag
cgtgcagaaaatgcatgggcaattcgcctatatgtgaagccgtttgtccgctggatttgg
cttgggggcttaatcatctctattgcggcactgttatcgattttagatcgacgttatcga
attgggcgcaagcaactacaaacagatgctaagattcaagaaggttag
DBGET
integrated database retrieval system
