Ignatzschineria rhizosphaerae: MMG00_11940
Help
Entry
MMG00_11940 CDS
T08009
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
ign
Ignatzschineria rhizosphaerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ign00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
ign02000
]
MMG00_11940
Transporters [BR:
ign02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
MMG00_11940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
MurJ
DUF3054
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UNM95895
LinkDB
All DBs
Position
complement(2647689..2649074)
Genome browser
AA seq
461 aa
AA seq
DB search
MQISLLDAWRNLSIHRKVWALTLPMILSNISVPLVGTVDTMIVGHLHSANNMASVGIGSS
IYVFLVAILNFLRMGTTGFTAQAFGNKDGNRVRQILLQSLGLALILALLLAIFALPISKI
AFTLMQPSPALYEGASQFFYWRLLGMPAALMNFALIGWFLGMQNARIPFYMLLATNILNV
LLTLLFILKLNLGITGVAKAAVIAEWFGLLVGLLFLPKLLQKTVGQWLLKPLRSWQNWKP
LIFVNRDIFIRSLTLNLVFFLVTLQGTRLGGDTVAANMIILNGLLIMSYLLDGFAHAIEA
LTGKAIGEASPKSLMSVMVIAGGWALLISVGFFIGFLSFGHYFINLISNIPSVREAAYPL
IPYLTLLPLISVWSYLLDGLFIGATKAKEMRNAMLLAFIIALPIGFLLLPFKNNGLWLTF
LLFMLLRGIIMMMMARRIQTQESWIPLPIKTPIKTTKASPS
NT seq
1386 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagatatctcttttggatgcttggcgcaatctatctattcaccgcaaagtttgggcg
ctaacactgccgatgattctttctaatatctctgttccccttgtgggcacagtggatacg
atgattgtcggtcacttacatagtgccaataatatggctagcgttgggattggcagtagt
atctatgtttttttagtggccattttaaactttctaagaatgggaacaacgggttttacc
gcccaagcttttggcaataaagatggcaaccgtgtccgccagattctgctacagagctta
gggctcgcactaatccttgcgcttttattagcgattttcgctcttcccatctccaagatc
gcctttacgcttatgcaaccatctccagcgctgtatgagggtgcatcacaatttttttac
tggcgcttacttggtatgccggcggcattaatgaactttgccttaattggttggttttta
ggaatgcaaaatgcacgtatccccttttacatgttgcttgcgactaatattttaaatgtc
ttactcaccttgctctttattcttaaacttaatttaggaattactggcgttgcgaaagct
gccgtgattgctgaatggtttggcttactggtaggacttctctttttgcccaaacttctt
caaaaaacagtaggacaatggttattaaagccgcttcgctcatggcagaactggaaaccg
ctgatctttgttaatcgcgatatttttattcgaagcttaacccttaaccttgtcttcttt
ttagtcacgctacagggaactcgattagggggagataccgttgccgcaaacatgattatc
ttaaatggcttactgattatgtcttatctcctagatggctttgcgcatgctattgaagcg
ttaacagggaaagccattggggaagcttcgcctaaaagcttaatgtctgtaatggttatt
gccggcggctgggcactacttattagtgtcggcttttttataggatttttaagttttggg
cattactttatcaatctaatctccaacatcccttcggtaagagaagctgcttacccgctt
attccttacttaacactactccctttaatcagcgtgtggagctatcttttagatgggctt
tttatcggcgctacaaaagcaaaagagatgcgtaatgccatgctcttagcctttatcatc
gccctacctattggctttttactcttaccctttaaaaataatggcttatggctgacgttt
ttactctttatgttattaagaggaatcatcatgatgatgatggcaagacgtattcaaacg
caagagagctggatacctctacccattaaaacgccgattaaaacaactaaagcctcccct
tcttaa
DBGET
integrated database retrieval system