Ipomoea nil (Japanese morning glory): 109173773
Help
Entry
109173773 CDS
T04663
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
ini
Ipomoea nil (Japanese morning glory)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109173773
NCBI-ProteinID:
XP_019178615
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1036 aa
AA seq
DB search
MLSEFSRRPMMGNNENSFGDDFEKEIGLLLSEHRRQEADDLEKELNLYRSGSAPPTVEGS
FTAVGGLFKHGAGGGSSGVGGSSTIQEFARNKNGNGFISEEELRSDPAYLSYYYANVNLN
PRLPPPLMSKEDWRFAQRLQGGNSAIGDRRKVNKNDGAMVGRSLFSMPPGFNSKKEETEN
ESDKLQGSVEWGGDGLIGLQGLELGTKQKSIAEIFQNDLNRVPASGGRLSRPASRNAFDA
SDDNLNSAEPDISHLRHDISSLDPLRSAANAQGSSVQHVGPASSYSYAAVVGASLSRSTT
PDAQRVATAPSPCITPIGGGRIVTSEKKSINSPKTFNGVTSHTNGPTDLVAALSSMNLSN
GMVAEYNCFSCIGNNSGDSVDDLFNFAGSQSNAKQHAYLKKSESAHYNIPSASQQTRAQY
TEAGASNVDDLHSSILQSDLHKSTVNSNNSYLKGSPTSTLNGGAGLLSHHLNLDSSNTPY
SSYGLSGNSANPMSSQHGNFNLPPLFENAAAASAMGVPGMDSRMLGGVNLNAAASEQYLG
RMGNQMAGGALQAQFMDPLYAQYLVQFAALNDPSMDRSYMGNSYMDLLQKAYVGNMLSPQ
KSQYGVPLNSKSMGSNHHGYYGNPAFGVGFSYPGSPLANSPIGPGSPMRHSDHSMRFSGG
LRNLGASVGGSWNLDNMETSFPSSLLEEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQ
QKLETATAEEKSMVFQEIIPHAITLVTDVFGNYVIQKFFEHGMATQRRELANKLFGSVLT
LSLQMYGCRVIQKAIEVVDVDQKIKMVEELDDHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDHIQ
FIVSTFFGQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCNDPQTQSKVMEEILGSVSTLAQDQYGNYVV
QHVLEHGKPHERSTIIKELAGNIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGNASERQLLVNEMLGTTD
ENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCSDQERELILSRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKL
VAAGERRMAAQTPNPA
NT seq
3111 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatctgaattcagtaggaggccaatgatgggaaacaatgaaaactcgtttggagat
gattttgagaaggagatagggcttttactttctgaacatcgtcgtcaagaggctgatgat
cttgaaaaggaacttaatttatatagaagtggctcagctcctcctactgtggagggttct
tttactgcagttggtggtttgtttaaacatggtgctggaggtggtagcagtggcgttgga
gggagctccaccattcaggaatttgcgcggaacaaaaatgggaatggtttcatatcagaa
gaggagcttaggtcagaccctgcttacttgtcttactattatgctaatgtgaatctgaac
cctaggttgcctcctcctctgatgtccaaagaggattggaggtttgcacagcgcttacaa
ggagggaactctgcaataggggataggaggaaagtaaacaagaatgatggtgccatggtt
ggtaggtcactattttccatgccaccaggatttaactcaaagaaagaggagactgagaat
gaatcagacaaattacagggttcagttgagtggggtggggatgggctgattggtttgcag
ggattagaattgggtaccaaacaaaagagcattgctgagatatttcagaatgatttgaac
cgtgttcctgcatctggtggtcgcctttcacgcccagcaagccgtaatgcatttgatgct
agcgatgataacttgaattctgcagaacctgatatttctcaccttcgtcatgacatttca
tccttagacccattaaggtctgcagcaaatgcccagggttcatctgttcaacatgtagga
ccggcctcatcatattcatatgctgctgttgtgggtgcttcattgtcaagaagcaccact
cccgatgctcaacgtgttgctactgctcctagtccttgcattactcctattggtggtggg
aggattgttacatcagagaaaaaaagtattaatagtccaaaaacatttaatggtgtcact
tctcatacaaatgggcccacagatctggttgctgctttgtctagtatgaacctttcaaat
ggtatggtagctgaatataattgcttttcttgtattggaaataatagtggtgacagtgtg
gatgatctatttaactttgcaggtagtcagagtaatgcaaaacagcatgcttacttgaag
aaatctgaatctgcacattataatattccttctgcttctcagcagactagagcacaatac
actgaggccggtgctagcaacgttgatgaccttcatagttctattctccaatctgacctt
cacaaatctactgttaactctaataactcatacctaaaaggatctcctacttcaacgctc
aatggtggagctggcttactttctcatcacctgaatttggacagttccaatacaccatat
tcaagttatgggttgagtggcaattctgccaatccaatgtcgagtcagcatggcaacttt
aatcttccacccttatttgaaaatgctgcagcagcatctgctatgggtgttccgggaatg
gactcaagaatgttgggtggtgtaaatttgaatgctgctgcatctgagcagtaccttggt
aggatgggaaatcagatggctggtggtgctttgcaggcacaatttatggatccactatat
gctcagtacttagttcagtttgcagcacttaatgatccttccatggatcggagctatatg
ggcaattcatatatggacttgcttcagaaagcttatgttggcaacatgctatctcctcag
aaatcacagtatggtgttccattgaatagcaaaagcatgggttctaatcatcatggctac
tatgggaatcctgcatttggtgtaggtttctcatatcccgggagtccattggcaaactct
cctataggacctggaagtcctatgaggcacagtgatcatagtatgagattttctggagga
ttgagaaatttaggtgcaagtgttggaggctcctggaacttagataacatggaaaccagt
tttccatcctctctcctggaagagttcaagagcaataaaactaaatgttttgagctatca
gagattgctggtcatgttgttgagttcagtgctgaccaatacgggagccgattcattcag
caaaaattagagactgccacagcagaagagaaaagcatggttttccaggaaattattcct
catgcaattacattggtgactgatgtctttggtaactatgtaatccaaaagttttttgaa
catggaatggcaactcagaggagagaactagctaacaagctctttgggagtgtattaaca
ttaagccttcaaatgtatggctgtcgagtgatccagaaggcaatagaagtagttgatgtg
gaccagaagattaagatggttgaggagctcgatgatcatgtcatgcgttgtgtacgtgat
cagaatgggaatcatgtcatccagaagtgtattgaatgtgtgccagaagatcacattcaa
tttattgtttcaacattttttggtcaagttgtgacgctatctactcatccatatggatgt
cgagtaatacagagagtactagaacactgcaacgatccacaaacccaaagtaaagtcatg
gaagagattctaggatctgtaagcacattggcacaggatcagtatggtaattatgttgta
cagcatgtactggagcatggaaagccgcatgagaggtctactattattaaggaattagct
ggtaacattgttcagatgagccagcagaagttcgcttcaaatgttgtagagaaatgcttg
acattcggtaatgctagtgaaagacaacttctcgtgaatgagatgcttggcacaactgat
gaaaatgagccacttcaggcgatgatgaaagatcagtttgcaaattacgtcgtacaaaaa
gttttggaaacttgcagtgatcaggagcgtgaactgatcctttcacgcataaaagtccac
ttgaatgcattgaagaaatacacctacgggaagcacattgttgcacgtgttgagaaactc
gttgctgccggggaaaggagaatggctgctcagactccaaatcccgcatag
DBGET
integrated database retrieval system