Ipomoea nil (Japanese morning glory): 109176494
Help
Entry
109176494 CDS
T04663
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
ini
Ipomoea nil (Japanese morning glory)
Pathway
ini03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ini00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
109176494
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
ini03019
]
109176494
Messenger RNA biogenesis [BR:
ini03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
109176494
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109176494
NCBI-ProteinID:
XP_019181481
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETNEDKLREYFQSYGEIMQTVVMRDKISGKPRGFGFVVFADPSVL
DTVLQDRHTIDGRTVEAKRALSREEQQGSKTGNPNSGRSLGGGGGSTRTKKIFVGGLPPT
LNEDGFRMYFETYGNVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDFNPGSGGRSMGGGGGGNYQGYGASGNNPNSYDSRMDSKYMPPQNTGGGYPP
YASSGYGSAGYGYGPSNNGMGYGGYGNYAGANPGYGGGNPGYGGAAGSAYGNPNLPGSGY
GSGPADGPRSSWSSQGPAYGNMGYGTSHWGNPNVGGGGPTGQSPTEAAGYGNQGYGYGGY
GGNDGSYGNPAAYGAVGRSAGGPSSNSPAGGGGTGELQAGAGGYGAYGDASGNSGYGNAG
WRSDASQPSGNYGSNGSQVSYGGGYGGAPGRQTQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcagatcaaggcaagcttttcatcggtgggatttcttgggagacaaatgaagat
aaactgagggagtatttccagagctacggtgagattatgcagactgttgttatgagagac
aaaatctccgggaagcccagaggctttggcttcgttgtgtttgcagatccgagtgttctt
gataccgtgctccaggataggcacaccattgatggccgtacggttgaggccaaaagggcc
ttatctagagaggaacaacagggctcaaaaactgggaatcccaatagtggcagaagtctt
ggaggtggtggtggtagtaccaggaccaagaaaatatttgttgggggattacctcctact
ctgaatgaggatggcttccggatgtattttgaaacttatggtaatgtaactgatgttgta
attatgtatgatcaacagaccaaccgaccacgtgggtttggtttcatttcatttgattct
gaggatgcagtagatagggttttacataagaccttccatgatttgaatggtaagcaagta
gaagtaaaacgtgctcttcctaaagattttaaccctggttctggtggccgttccatggga
ggaggcggtggtggaaattatcaggggtatggagcatctggaaacaatcctaattcttat
gacagtcggatggattccaagtacatgccgccacaaaacactggagggggttatcccccc
tatgcttcctctggatatggttcggctggttatgggtatgggccttccaacaatgggatg
ggttatggtggttatggaaattatgctggagctaatcctggttatggtggtggtaatcct
ggctatggtggtgctgctggttctgcatatggaaatccaaaccttcctggtagtggctat
gggagtggtccagctgatggaccaagaagctcatggagttcccaaggtcctgcttatgga
aatatgggctatggaacttcccactggggtaatcctaatgttggaggtggaggacctacg
ggtcagtctccaactgaagctgcaggttatgggaaccaaggttatggttatggtggctat
ggtggaaatgatggatcttatggaaatccagctgcttatggggctgtaggacgttctgct
ggtggtccaagtagcaattcccctgctggtggtggtggtacaggagagctgcaagctggt
gctggtggttatggggcgtatggtgatgccagtggaaattctggatatggaaatgcagga
tggaggtctgatgcatcacagccttctgggaattatggatcaaatggcagccaagttagc
tatggaggtggatatggtggtgcgccaggtcggcaaactcaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
