Candidatus Improbicoccus pseudotrichonymphae: CfP315_0709
Help
Entry
CfP315_0709 CDS
T09760
Name
(GenBank) D-alanine-D-alanine ligase
Organism
ips
Candidatus Improbicoccus pseudotrichonymphae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Dala_Dala_lig_C
Dala_Dala_lig_N
ATP-grasp_4
ATP-grasp_3
CPSase_L_D2
GARS_A
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BED92123
UniProt:
A0AA48I8N4
LinkDB
All DBs
Position
759168..761525
Genome browser
AA seq
785 aa
AA seq
DB search
MKLAVICGGPSPEHSISLNSARSVYDALFSPDNFRNNIEIKIIFINKNYEKYLIDEEFIY
SNTVFDFNFKLEDKDRLNNKEFLSFLKSCDLVFPIMHGIYCEDGEIQKTFEKEKISFVGS
SSKSCYDLYNKKKSDLILKENNYFTIKKLFLNLDENSDSLEDLISDFLKENNLKKIIIKP
VQGGSSLGVSCADSFEKILNVVRSMHKSGEKNLVIEEMCQGKEFTIIIIESHVNNEPIAL
IPIEIEIKDSENLIFDTRRKYLATNETHYHFPPRFSYDLTNKIREQSQKLFKLFKARDFL
RIDGWVLNNDKLYFSDFNPISGMEQNSFIFQQASKIGISHKNMISYIIKNSAIRNNVVFE
EDNVDNNREKKKVNVLFGGTTSERQVSLLSGSNVWLKLLKSNKFSPKPFLLYSENSEFYV
LELSYDMVLYHTVEEIMYQHKNNKTENKFLELINKIRESLGLSGKYDKKKSEILKISDFL
EKSKRENAYIFSALHGGFGENGEIQNLFEKYGLKFNGSGSVASKICMNKFETGQIVNSFG
LKKFRSAKKIIFNIFEKTPSWREINDYIGQQAIIKPNDDGCSTGVVLISNEKELEFYINS
IKNKDKFIKNNSFKFQNRNIMLSCACENYLVEEFIKTNEIRIENKSVILKDSDDFVELTI
GVIEKDGFYHAFNPSITIAESGALLSVEEKFQGGQGVNITPPPDFIISKDLLKTIKSNVE
KLCEKVKIKDYCRIDLFANNKTNEIVIIEINTLPALTPSTVLFQQAAKEPSPINPLNLLE
NIIKI
NT seq
2358 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagcttgctgtaatttgtggtggcccttcgccggaacatagtatttcattgaattct
gcacgttctgtctatgatgctttgttttctcccgacaattttcgcaacaacatcgaaata
aagataatttttataaacaaaaattatgaaaagtacttgatagatgaagaatttatttat
tctaacacggtgtttgattttaattttaaattagaagacaaagatcgcctaaataataaa
gaatttctttcttttttaaaaagctgtgatcttgttttccctattatgcatggaatttat
tgcgaagacggcgaaattcagaaaacgttcgagaaagaaaagatatctttcgtaggttct
tcgtcaaaatcgtgttatgatctgtataataaaaaaaaatccgatctaattttaaaagaa
aacaattactttactattaaaaaattgtttttgaatttggacgaaaattccgattcttta
gaagatttgatatctgattttttaaaagaaaataatttaaaaaaaataattataaagccc
gtccaggggggatcatctttaggggtaagttgtgccgatagttttgaaaaaatcctaaac
gtagtaagaagtatgcataagagtggcgaaaaaaatttagtaatagaagaaatgtgtcag
ggaaaagaatttacaataataataattgaaagtcatgtgaacaatgaaccgattgcttta
attccgatagaaatagaaatcaaagattctgaaaatttgatatttgacacaaggcgtaaa
tatttagcgacaaacgaaactcactatcactttcccccaagattttcctatgacttaact
aacaaaatacgagaacaatcgcaaaaactctttaaacttttcaaggcacgcgattttctt
aggatcgatggttgggttttaaataacgacaaattgtatttttcagattttaatccaata
agcggcatggaacaaaatagttttatttttcagcaagcatcaaaaataggaattagccac
aaaaacatgataagttatataataaaaaactctgcgattcgaaataacgtagtttttgag
gaagataatgtagacaataatcgcgaaaaaaagaaagttaatgttttattcggcggaaca
acgtcagaacgtcaggtttcgttgttaagcggctcaaacgtctggcttaaattacttaaa
tcaaataaattttcaccaaaaccctttcttttgtacagtgaaaattctgaattttatgtg
ttagagctttcctatgatatggttttgtatcatactgtcgaggaaataatgtatcagcat
aaaaataataaaacggaaaataagtttttagaattaataaataaaataagagaatctttg
gggttgagtggaaaatatgacaaaaagaaaagtgaaattttaaagattagtgactttttg
gaaaaatccaaaagagagaatgcttacatattctcagcgttgcatgggggttttggagaa
aacggtgaaattcaaaacctttttgaaaaatacggtttaaaatttaatgggtccggttct
gtagcgtccaagatttgtatgaacaaattcgaaacaggtcagatagtaaactcttttggt
ttaaaaaaatttagaagtgccaaaaaaatcatatttaatatctttgaaaaaacaccaagt
tggcgggaaattaacgattatataggccaacaagcaataattaaaccaaacgacgatgga
tgttccaccggggttgttctgatttcaaatgaaaaagagctagagttttatattaactcc
attaaaaacaaagataagttcataaagaataattcttttaaatttcaaaacagaaacatc
atgctttcgtgcgcttgtgaaaattacctagtagaagaatttattaaaacgaatgaaata
agaatcgaaaacaaaagcgttattcttaaagatagtgacgattttgtggagttgacgata
ggtgttatcgaaaaagatgggttttatcatgcttttaacccgagtattacaatagctgaa
tcaggcgcattattaagcgtagaagaaaaattccaaggtgggcaaggagtcaacataacc
ccgccaccggattttataataagtaaagatcttttaaaaacaataaaatcaaatgtggaa
aaattgtgcgaaaaagtaaaaataaaagattattgccggatagatctgtttgccaacaat
aaaacaaacgaaatagtaataatagaaataaataccttaccggctttgactccgtcgact
gttttgtttcaacaagcggcgaaagaaccttcgcccatcaatccgctgaatttattggaa
aacataataaagatttag
DBGET
integrated database retrieval system
