Imperialibacter roseus: RT717_09890
Help
Entry
RT717_09890 CDS
T09469
Name
(GenBank) S8 family serine peptidase
Organism
iro
Imperialibacter roseus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_S8
Big_9
Por_Secre_tail
Inhibitor_I9
Cadherin_5
Cadherin_3
FixG_C
LBP_C
G2F
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOK08944
LinkDB
All DBs
Position
2366328..2371487
Genome browser
AA seq
1719 aa
AA seq
DB search
MYIHKASAQQVLSVRDKLGYSNSYGSGSHVANTFSNKDTLGVTLYAKGSSNALTEPEAKR
GEFIVKFKQGIPSASQSKQSGFNAKPFKDPALFDKLRSDLNLLHSARTKGSKNTSTVSSL
EKEYSKAFFGAHIRVSEELVEEIQKLDYVESVHPNGVVKAFLDTSVPLVRAPEVWDTYDT
RGEGIVVGIIDTGIDYNHPALGGGFGPDFKVVGGYDFVNDDNDPFDDNEHGTHVAGIVAA
NGGGLVGVAPEAKLVALKVLNQYGFGYDDDILDAIEWAVDPNGDGDYSDRLDVVNMSLGG
PGDYQSPTAIAVNAAVEMGIVFCVAAGNSGGFKTIGSPGTAERAITVGASDDNDMLAYFS
SKGPNAGNYAIKPDLLAPGVNITSSVPGGGTANFNGTSMATPHVAGVAALLRDIHPDWTV
DQVKAALTTTAKDLGLEVMQQGSGRLDAVKAAGVSCTAYPTQLSYGLNATDQANWGGSRT
VTVTNNSDSDQSYSITVTGTQAGVTLTPTETAFTLSSGQSTTVGFSLAVDNNVFEQEPKA
SQSTGGRVTIAGEEDMLVIPWAFVSGTIVRIAFEDNQLNRDYNKLIQLFNDDFSYGANDA
SFSEDGLTATFLVPNATYNAFFLFEDWSKIALKENIVVDGSTTISITSADVENKITFAAS
DENGESLAGRYQGTLTLLIQSKSSRFGNIVSYGTALRELNFSDFSSEYFAITNYTFDVRN
EAGNKLYNIELGAFDGLSESVDIQRTPQDLYHFGLDFDLPGPSAVHDITFFVNAHWFDDY
GGGGNTVGFGWNWGSSLNLPVDIWHADAYITESSVINNWGLGLDAHVSKNVNDSYHSLRT
KLLRVFDDKIVSFDGKWPLSDTPGMNVGQTINFGGGVLHPGTYLNNYDIRSSAFLGSFGE
ETYFLYDQMNVKVSANDLVLFNGTGRDFFSDWGFYQAGQYQFDFTVPHEQMPGQEGIIKY
TTNSIVQNEGGSVMSPFMPGFYFQDKSGELTIQFEKVLDGKVRFSVRPGLSSLVSSQLYL
QKSGSDGYEIVPVEFITTENLDGRKVFEGSVFNKPSADTYYDIKLVAKGASGDSMQYVMT
SALFVKANKIPEVVNQQPVTIFRGASHEISLDDLIILDDDSNASEMSLIVENGDNYAVDG
KKILAPIDFVGTIEVPITVNDGYDSSEPFLLNIKVANQPPVITGQVAVEIDKNSSYTLSL
SDITATDADDIYPTKHTLLVLPGEHYVVEGMTVFPDETYGGKLQVNIVVDDGFSNSAVYK
FEIQVTNEPPLITGQKVTSIWKSASREVGVDDLIVEDSDNHYPDGFVVKVLAVSSGQLEG
NVVTPPNDFKGILTASVVVNDGADDSNIFELKIEVMNVAPSIVGQQPKQVTKNNNFSVSI
DDLQIIDENDGPDFAYQLSIGQGEDFSSTEDGMIRPVTGFVGTIVIPLTVSDGVDNSPVF
EFAVDIVNHKPIITGQVATTLGKNTPIGIDLGLLTVTDADDPLDSLTLKLVEGNGYQIVE
GKIQPSANFVGVLKINVTVTDGIDDSDLFEFSVNLSNDVPQIIGQQELSIDKNTSLKILP
QYVFVDDDDDEFPTNHSLKIGVGENYSISGQTVTPALDYIGELEVPVVVSDPNSTSLAYN
LIIMVNAISGIQDSLSQFIDVYPVPVNDYLNIRFKNQISGQIMLSIVDLVGQTLTEDNLE
NVQPNSEYALATSHIRPGVYLLLVSTSSGDSFSTRIVKD
NT seq
5160 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacattcacaaggcatcagcgcaacaggtattgtctgttagagacaaattaggatat
tcaaattcctacggtagcgggagccacgttgcaaacaccttttccaacaaagataccctg
ggagtaacactgtatgcgaaaggatcatcgaatgccttaacagaaccagaggcaaagcgt
ggtgaatttattgttaaattcaaacaaggcataccctctgcttcgcaaagcaagcaaagt
ggatttaatgccaagcctttcaaggatccggctctgttcgataagttacgttcagacctg
aatttgctgcactcggcccgaacaaaagggagtaaaaatacatcgactgtttcttcgctt
gaaaaggagtattcaaaagctttctttggggcccatataagagttagtgaagagttggtt
gaagaaatacaaaaactggactatgtcgaatccgtccacccaaacggtgttgtaaaggct
tttctggatactagtgtacctttagttcgtgccccggaggtgtgggacacttatgataca
cggggggagggaattgttgttggtataattgatacaggtattgattacaatcaccccgct
ctgggtggtggctttggtcctgattttaaagtagttggtgggtatgattttgtgaacgat
gataatgaccccttcgatgacaatgaacatgggacacacgtagctggtattgttgcagcc
aatggaggtgggcttgtgggcgttgcgcctgaggctaagctagtggcacttaaagtatta
aaccaatatggatttgggtacgatgacgacatccttgatgccatagaatgggcagttgat
cccaatggtgacggcgattatagcgaccggctggatgttgtgaatatgagccttggcggg
ccaggtgactaccagtcgccaacagcgattgctgtcaatgctgctgtggaaatgggaatt
gttttttgcgtagccgctggtaattctggtggttttaagacaatcggcagcccaggcaca
gcggaaagagccatcacagttggagccagcgacgacaacgacatgttagcctactttagc
agcaagggcccaaatgcagggaattatgcaatcaagcccgatttgttggctccaggcgta
aatataacgtcgagtgttcctggaggaggtactgcgaattttaatggaacatccatggct
acccctcacgttgcgggagtagctgcccttttaagagacattcatcccgactggactgta
gatcaggtaaaggcagcactcacaacaaccgccaaagacctcgggttggaagtaatgcaa
cagggttctggcaggttagatgcagtgaaagctgcaggtgtcagctgtactgcatatcca
acccaattgagttatggactaaatgcaaccgatcaagccaattggggtggatcaaggacg
gtgactgttacgaataatagtgattctgaccaatcgtattccataacagtgacaggaacg
caagcaggggtaacactgactccaactgagacagcttttacgctaagttccggccagtca
accaccgtaggcttttctcttgccgttgacaataatgtatttgaacaggagcccaaggcc
tcacaatccaccggaggtagggtgacaattgcaggcgaagaagatatgcttgtaataccc
tgggctttcgttagcgggactattgtcagaatagcttttgaggataatcaattgaacagg
gattacaataagctaatccaattattcaacgacgatttttcttatggggccaacgatgct
tcattttcggaagatgggttaactgcaacctttcttgtgcccaacgctacttacaatgca
tttttcctgtttgaagattggagcaagattgcgctgaaagaaaatattgtcgttgatgga
agtaccactatttcgataacctcggccgatgtagaaaacaaaataacctttgctgcttca
gatgagaatggtgaaagtttagcaggcaggtatcagggaaccttaaccttactgatccag
tcaaaaagcagcaggtttggaaatattgtttcctacggcactgcgcttcgtgaattaaat
ttttccgatttttcctccgagtacttcgctataacaaactacacatttgatgttcggaat
gaggctggcaacaagttgtataacatagagttgggtgcttttgatggactctctgaaagt
gtagacattcagcgaaccccgcaagatctttaccactttggtcttgattttgatttaccg
ggcccatctgctgttcatgatattaccttctttgttaatgcgcattggtttgacgactat
ggtgggggcggaaataccgttggttttggttggaattggggcagtagtttaaatttgcct
gtagacatatggcatgcagacgcatatattactgagtcctcagttattaacaactggggc
ttagggcttgatgcacatgtttctaagaatgtcaacgattcatatcattcgttgcgaact
aaactactcagggtctttgatgataagattgttagcttcgatggcaaatggccactgagc
gacacgccgggaatgaatgtggggcaaacaatcaattttggcggtggagttctgcaccca
gggacctaccttaataattacgatatccgttcaagtgcttttttgggatcattcggagag
gaaacctatttcctgtatgatcagatgaatgtgaaagtttcggcgaacgacttggttctt
ttcaatggaacaggaagagactttttctcagactggggtttttatcaggccggacagtat
caatttgatttcactgttccacatgaacaaatgcctggccaggagggcatcatcaaatac
acaaccaattccattgttcaaaatgaaggcggcagtgttatgtccccttttatgccgggg
ttttattttcaagataaatcgggcgagcttactatccaatttgaaaaggtattggatggt
aaggtaaggttttcagtaaggcctgggttgtcgtcgcttgttagcagccagctttaccta
cagaaaagtggttcggatggctatgagatcgttccggtggaatttatcactacggaaaac
ctcgatggaagaaaagtgttcgaagggagtgttttcaacaagccatctgccgatacatac
tatgatataaaactagtggccaagggtgcttccggcgactccatgcaatatgtaatgacc
tctgcgctgttcgtaaaagcgaacaaaattccggaagttgttaaccagcagccagtcacc
atattcagaggtgcctctcacgagatatctttggatgacttgatcattttggatgacgat
tccaatgcttctgagatgagcctcattgtggaaaatggggataattatgctgttgatggc
aaaaagattttagcgccgatcgatttcgttggtacaattgaggttcccattacggttaac
gatggctatgatagtagtgagccatttctattgaacattaaagttgctaatcagcctccg
gttattacaggacaagtggccgttgaaatagataaaaatagctcttatactttgtccttg
tcagatatcactgcgacagacgccgatgacatttacccaacaaaacatacgctacttgtt
ctgcctggcgagcactatgtagtggaaggtatgacggtctttcctgacgaaacgtatgga
ggtaaacttcaggtaaacattgttgttgatgatggattttcaaacagtgcagtatataag
tttgaaattcaggtaacaaatgagcctccgctgatcacaggccagaaagttacaagtatt
tggaagtcagcatcaagagaggtcggagtagatgatcttattgttgaagattcagataac
cattatcctgatggatttgtggtaaaggtattggctgtttcaagtggacagttggaagga
aacgtggttacaccaccgaatgattttaaaggtatattaaccgcttcggttgttgtgaac
gatggagctgacgacagtaatatatttgagttgaaaattgaagtgatgaatgttgcgcca
tcgatcgttgggcagcagccaaagcaagtgactaagaataataatttttctgtatcaatt
gatgacttacaaatcattgatgagaacgatgggcctgattttgcttaccagctttcgatc
gggcaaggcgaagacttttctagtaccgaagacggcatgattcggccggtcacagggttt
gtcggtaccatagttattccattgacagtgagtgatggggtggataatagcccggttttt
gagttcgcagtagacattgttaaccacaagccaataattacgggtcaggtagcgacgacg
cttggcaaaaatacgccgattggtatcgatttggggctgctaactgtgactgatgcggat
gatccgctggatagtctgaccctgaaactggttgaggggaatggttaccagattgttgaa
ggtaagattcagccatcagctaactttgttggagtgttaaaaatcaatgttacagtaact
gatggcattgatgacagcgacctgtttgagttttcagtaaacctgagcaacgacgttccg
caaattattggtcaacaggaactgagtattgacaaaaatacttcgctaaaaattctgcct
caatatgtatttgttgatgacgatgatgatgaattcccaaccaaccattcgttaaaaata
ggagttggcgaaaattatagcatatcagggcaaacggtaactcctgctttggactacatt
ggggagctggaagtgccggtcgtagtgagtgacccaaacagcaccagtctggcttataat
ctaatcatcatggtgaatgcaataagtggcattcaggatagtttgtctcagtttattgat
gtttacccagttccagttaatgattacctaaacattcggtttaaaaaccaaataagtggg
caaatcatgctaagcatcgttgacctggtggggcaaacactcacggaagataatctggag
aatgtccaacctaatagtgaatatgccttggctacaagccatatccgtcctggagtttat
ctcttgctcgtttcgacttcttcaggggatagtttcagtactcgtatcgtcaaagactag
DBGET
integrated database retrieval system