Ignavigranum ruoffiae: M0R79_02135
Help
Entry
M0R79_02135 CDS
T08083
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel
Organism
iru
Ignavigranum ruoffiae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_1st_1
DUF2621
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPQ86200
LinkDB
All DBs
Position
214311..215588
Genome browser
AA seq
425 aa
AA seq
DB search
MNLDNFFRSIVNALPGIFGALLLLVVALVVAWAIKRFTITVLNKIDFDQQLQHWGFAKSK
EEANVFIETIASILYFIVIILFLPSILAGLNIGGALNPIVAMFATFLAFIPNLLMALIIL
IIGGYFCNFIKRLVKNILTGLNIDKWYRKVTKQSVHGLNVNENQMADVLSSVVYVLLYIP
ILTVALETLGIQSISQPIIDVLNQILGAIPNIFAAVVMLIIGSFVGKLLGDVVEGLLSTS
GIDQYSKYLNFKGESQLKISGVIGVLVQSLLTLFFIVEAINILNLDVLNAIGSSIIAYIP
AVISAVIILALGLIGGNIFANFIKQVSGSSLFSELVRFTIIALAIFMTLDQLKIAQTIVN
SAFVIILGALAGAFVLAFGLGGKDYAHRKLEEIDHTLAKEGEQSNQIITDPQQTLNEDDH
LDHQV
NT seq
1278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccttgataattttttccgctcaattgtcaatgctctgccgggtatctttggtgct
ttattattattagtcgtagccttagtggtggcttgggcgattaaacgcttcaccatcacc
gttttaaataagattgatttcgatcaacagttacaacattggggttttgccaaaagcaag
gaagaagccaatgtatttattgaaacgattgcttctatactatactttattgttattatt
ctattcttaccaagtattctcgcaggtctaaatattggtggagctttaaatccaattgtg
gccatgtttgctactttcttagcctttattcctaacctattgatggccttgattattcta
attattgggggctatttctgtaactttattaagcgtttagtcaagaacattcttaccggt
ttgaacattgacaaatggtatcgtaaggtgactaaacaatcggttcacggattgaatgtg
aatgaaaatcaaatggcggatgtcttatcttctgtggtttatgttctcttgtatattccg
attcttacggtcgctttagagactctagggattcaatctatttctcaacccatcattgat
gtcttaaaccaaattctcggtgccattccgaatatctttgcagcggtagttatgctaatt
attggtagcttcgtcggcaaactgctaggcgatgtcgttgaaggcttattatctacctct
ggaattgatcaatattctaaatatttaaatttcaaaggagaaagccaactcaaaatttca
ggagtcattggtgtattagttcaaagtctcttgaccctattctttatcgttgaagcgatt
aacatcctaaatctggatgtcctaaatgcaattggttcttcaattattgcctatattcca
gcggtgatttcagcggtgattatcttggcgcttgggctcatcggaggaaatatcttcgcc
aactttattaaacaagtatctggatcaagcttatttagtgaattggttcgctttacaatt
attgctttggctatctttatgaccttagaccaattgaaaatcgctcaaaccattgtaaac
tctgcctttgtgattattcttggtgctttagccggtgccttcgtcctagcctttggttta
ggcggcaaagattatgctcatcgcaagctagaagaaatcgaccatactctggccaaagaa
ggagaacaatccaatcaaattatcaccgaccctcaacaaacactgaatgaagatgatcat
ttagaccatcaagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
