Ipomoea triloba (trilobed morning glory): 116004564
Help
Entry
116004564 CDS
T07384
Name
(RefSeq) nicastrin
KO
K06171
nicastrin
Organism
itr
Ipomoea triloba (trilobed morning glory)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nicastrin
Ncstrn_small
Peptidase_M28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116004564
NCBI-ProteinID:
XP_031100529
LinkDB
All DBs
Position
14:17443546..17457023
Genome browser
AA seq
662 aa
AA seq
DB search
MLYWLGLLCFVACLQLSLSGQENSFESVPDLEKSMYVAIDGYPCVRLLNISGEIGCSNPG
RGNVVAPVVRFKDTIKLDKQSAILTSLEEFDSFFTRFSSDPDFAKHVAGMLVESGTRSTN
ELKGFSPDKKFPLVEFAPYNSGSFEWNPTGSGVMWEAYSFPVFLLSESSTLTLREVAIKN
EKRKNSYTSNVVDFDLVMQTTKSGTRDSESCLRQQTCLPLGGYSVWSALPPINLSSEKSR
PVILAVASMDSASFFRDRSIGADSPISGLISLLAAVDALSRFDYSRDFIKQLVFVVFTGE
SWGYLGSRRFLLELDQHSDAVRGLDFSMIETVLEIGSVGKSTAQDVTTFFAHTTGGAYTN
ETLNALFHAQDSLKTQNIKISKAKKTNPGLPPSSLMAFVRKNPQTSGIVLEDFDDAYRNK
FYHSHLDDQSNVNSSAIVAAASLVARSLYVLASDKKEVNASLLTTINANSSLVEELLGCL
LSCEPGLSCGLVKSYIAPSMSCPSHYVGVILGEPSSVPYLGNVGDVSRFIWNFLAEKTSI
RPTNTSSACPKDCGRDGEACIQTETDGKGICVISTTRYIPAYSTRLKYESDTWMVLPSNS
TEPDPDPVWTESNWDMIRLRAYTVQGASYDRFVLLLGIVVTLLAYLIIVMARAFITKAMK
CD
NT seq
1989 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatattggctcggtcttctctgcttcgtggcgtgtcttcaactctctctctcagga
caggaaaactcttttgaatcagttcctgatcttgagaagtccatgtatgtggccattgat
ggatatccatgcgtacgactgcttaacatttctggggagattggctgttcgaaccctggc
cgtgggaatgttgttgctccagttgttaggttcaaggatacaattaagttggacaaacaa
tctgctattttgacttcacttgaagaatttgatagctttttcacaagattttcaagtgat
ccagattttgcaaagcatgtagctggtatgttagttgaatcaggtactcggtctacaaat
gaattaaaaggattttcacctgacaaaaagtttccattggtggaatttgctccttacaat
agtggcagttttgagtggaatccaactggatctggtgttatgtgggaagcttatagtttt
cctgtattcttactttcagagagtagcacactgacattgagggaggttgcgataaaaaat
gagaagaggaagaattcatatacttcaaatgtggttgattttgatttagtaatgcagaca
acgaagtctggaactcgtgactcagaatcatgtcttagacaacaaacctgcctgccattg
ggtggatacagtgtctggtcagcacttccaccaattaacttgtcttcagaaaagtcaagg
cctgttatattagcagtggcttctatggattctgcatctttttttcgtgacagaagtatt
ggtgcagattcgcccatatctggattaatctcactcttggctgcagtagatgctctttca
cgttttgattactcaagggacttcattaaacagcttgtatttgtggttttcacaggagaa
tcctggggataccttggtagcaggaggtttcttcttgaacttgatcaacattcagatgct
gttaggggtcttgacttttcaatgattgagacggtactggaaattggatcagttgggaag
agtactgctcaggatgttacgacattctttgctcatactacagggggtgcttacacaaat
gaaactttgaatgctttgtttcatgctcaagattcactgaagacgcaaaacattaagatc
tcaaaggcaaagaaaacgaaccctgggttacctccatcttcattaatggcatttgtgaga
aagaatccacaaacttctggcattgttttggaagattttgatgatgcatacaggaacaaa
ttctatcacagtcaccttgatgatcaatctaatgttaactcttcagccatagtggcagct
gcttcccttgttgctcgaagtctctacgtccttgccagtgacaaaaaggaagttaatgct
tcacttctgaccactattaatgcaaattcctccttggttgaagaacttctcggttgtctt
ttaagttgtgaaccaggcttatcatgtggattggtgaaaagctatattgctccctctatg
agttgcccgagtcattatgtaggtgttatccttggggaaccttcctctgtgccttatctt
ggcaatgtgggggatgtatctcggtttatatggaattttttggctgaaaaaacatctatc
cggcctacaaataccagttctgcttgcccaaaagattgtggaagggatggggaagcatgc
atccaaacagaaacagatgggaagggcatatgtgtcatctctactacaaggtacatacca
gcatattcaacgagattgaagtacgagtctgatacttggatggttttaccttccaactcc
accgaacctgatcctgacccagtttggacagagagtaattgggacatgataagacttcga
gcttacacagtccaaggtgcttcttatgatcgctttgttctgctactgggtattgttgtt
acgcttttggcttacctcataatagtgatggctagagctttcatcaccaaagccatgaag
tgtgattga
DBGET
integrated database retrieval system