Ipomoea triloba (trilobed morning glory): 116010735
Help
Entry
116010735 CDS
T07384
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
itr
Ipomoea triloba (trilobed morning glory)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
116010735
NCBI-ProteinID:
XP_031106109
LinkDB
All DBs
Position
2:10465733..10472593
Genome browser
AA seq
1169 aa
AA seq
DB search
MRSRGGGLTRGRRLPNILVVLALLAISNVVSGDISYLYSSPPPPVYQYKSPPPPSPSPPP
PYEYKSPPPPVHPPPPPYAYKSPPPPSQSPPPPYAYKSPPPPSQSPPPPYAYKSPPPPSP
SPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPSYYYKSPP
PPSPSPPPPYYYTSPPPPKKSPPPPYYYTSPPPPVKLPPPSYHYSSPPPPVKSPPPPYYY
SSPPPPVKSPPPLYYYSSPPPPVKSPPPPYYYSSPPPPKKSPAPLPYNYKSPPPPTYYYK
SPPPPSPLPTPTYSYKSPPPPSTYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYRS
PPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYHYKSPPPPSPSPPPPY
YYKSPPPPLPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSP
PPPSPSPPPAYYYKSPPPPSPSPPQPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSSSLPPPYY
YKSPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYYYQSPPPPSPSPPPPYYYHSPPPPSPSPP
QRTYIYSSPPPPTNYLYSLHQPPVYQHKSTPPPSQSPLPPNEYKSLSPPSPSPPPPYAYK
CAPPPSPSPPPPYYNVSPPPPSPSLPPPYYYKSPPPPLLSPPPPPPYYYKSPPPPSPSPP
PPSPSPPPYYYKSPPPPSPSPHPPYDYISPPPPSPSPPPPYYYKSHPPPSPSPPQPYEYT
SPPPPYYYKSPPPPSPSTPPYEYTSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYDYISPPPPSPSPPP
PYYYKSPPPPSPSPPQPYEYTSPPPPYYYKSPPPPSPSTPYYYKSPPPPSPSTPPYEYTS
PPPSPSTPPYEYTSPPPPYYYKSPPPPSPSPPPPYDYISPPPPSPSPPPPYYYKSPPPPS
PSPPQPYEYTSPPPPYYYKSPPPPSPSTPYYYKSPPPPSPSTPPYEYTSPPPSPSTPPYE
YTSPPPSSSLHPPYYYKSPPPPSPSPPPPSPSPPPPYYYKSPLPSPFPPPPYDYIPAPPP
SSSPPPPSPSPPPPYDYISPPPPSPSPPPPYHYKSPPPPYYYESPPPPSPSPPPPYYYKS
LPPSSPSQPPPYYYRSPLPPSPSPLAPYY
NT seq
3510 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggagtcgcggtggtggcctcacccgaggtcgccggttgccaaacatcttggtggtg
ttagccttgttggctatttctaatgtagtttctggagatattagttatttgtattcttca
cctccgcctcctgtgtatcaatacaaatctcctccgccaccttctccgtctccaccacct
ccctatgagtataagtctccaccaccgcccgtgcatccgcctcccccaccatatgcatac
aagtctcctccaccgccatcacaatcacctccaccaccatatgcttacaagtctcctccc
ccgccatcacaatcacctccaccaccatatgcttacaagtcccccccaccaccttcacct
tcacctccacctccatactattacaaatctccaccgccaccctcaccctcccctcctcca
ccttactactacaaatctccaccgccaccctcaccgtctcctcctccaccttactactac
aaatctccaccaccaccgtcgccatctcctcctccctcatactattacaaatctcctcct
ccaccctcaccttcaccgccacccccctactactacacctctccacctccacccaagaaa
tcaccaccccctccttattactacacctctcccccaccaccagttaaattaccaccccct
tcataccattactcatcaccacccccacctgtaaagtctcctcctccaccatactactac
tcttctccaccaccaccagttaaatcaccccctcctctatactactactcttctccgcca
ccaccagttaaatcaccccctcctccatactactactcttctccgccaccacctaaaaag
tctcctgcccctcttccatacaattacaaatctcccccaccaccaacttactactacaaa
tcaccaccccctccttcaccattgcctacaccaacctattcttataagtcacctccacca
ccatccacgtattactacaagtctcctccacccccatctccatcaccaccaccaccatat
tattacaaatctcctcctccaccatcgccatctcctcctccaccttattattatagatcc
ccacctcctccgtcaccgtctcctccgccaccatactattacaagtctccacctcctcca
tcaccgtcacccccgccaccctactattataagtctccaccaccaccatctccatcacca
ccgccaccttaccactacaaatctcctcctccaccctcaccatctcctcccccaccctac
tattacaagtctccacctcctccattgccatcaccaccaccaccatactattataagtct
ccaccacccccatctccatcgccaccaccaccctactactacaaatctcctcctccaccc
tcaccatctcctcccccaccctactattacaaatctcctcctccaccctcaccatctcct
cccccaccctcaccatctcctcccccagcctactattacaagtctccgcctcctccatca
ccatcacccccacaaccatactattataaatctccaccaccaccgtctccatcaccacca
ccaccctattattacaaatctcctcctccaccatcatcgtctctccctccaccctattat
tacaagtcaccacctcctccatcaccatcacccccaccaccatactactacaagtctcca
ccaccaccatcgccatctcctccacccccatactactatcaatcccctcccccaccatct
ccttctccccctccaccgtattactaccattcacctcccccaccatccccatctccccca
caacgaacatacatttactcttctccacccccaccaaccaattacttgtattctttacac
cagcctccagtgtatcaacacaaatctactccgccaccatctcagtccccactacctccc
aatgagtacaagtcgctttcgccgccatcaccatcgcctccaccaccatatgcttacaag
tgtgccccaccaccttcaccttcacctccacctccatactataacgtatctccaccgcca
ccctcaccttcccttcctccaccttactattacaaatctcctccaccacctttactatct
cctccaccaccaccaccttattactataaatctccaccaccaccttcaccatctcctcca
ccaccttcaccatcccctccaccttattactacaaatctccccctccgccttcaccatct
cctcatccaccttacgactatatatctcctccaccaccttcaccatctcctcctccacct
tattactacaaatctcatcccccgccttcaccatctcctcctcaaccttatgaatataca
tctcctcctccaccttattactataaatctcctcccccgccttcaccatctactccacct
tatgaatatacatctcctcctccaccttattactacaaatctccccctccgccttcacca
tctcctcctccaccttacgactatatatctcctccaccaccttcaccatctcctcctcca
ccttattactacaaatctcctcccccgccttcaccatctcctcctcaaccttatgaatat
acatctcctcctccaccttattactataaatctcctcccccgccttcaccatctactcct
tattactataaatctcctcccccgccttcaccatctactccaccttatgaatatacatct
cctccgccttcaccatctactccaccttatgaatatacatctcctcctccaccttattac
tacaaatctccccctccgccttcaccatctcctcctccaccttacgactatatatctcct
ccaccaccttcaccatctcctcctccaccttattactacaaatctcctcccccgccttca
ccatctcctcctcaaccttatgaatatacatctcctcctccaccttattactataaatct
cctcccccgccttcaccatctactccttattactataaatctcctcccccgccttcacca
tctactccaccttatgaatatacatctcctccgccttcaccatctactccaccttatgaa
tatacatctcctccaccttcatcatctcttcatccaccttattactacaaatctccccct
ccgccttcaccatctcctccaccaccttcaccatctcctcctccaccttattactacaaa
tctcctctgccttcaccatttcctcctccaccttacgactatatacctgctccaccacct
tcatcatctcctcctccgccttcaccatctcctcctccaccttatgactatatatctcct
ccaccaccttcaccatctcctcctccaccttatcattacaaatctcctcctccaccctac
tattacgagtcaccacctcctccatcaccatcacccccaccaccatactattataaatcc
ctaccaccctcatctccatcacaaccaccaccctattattacagatctcctcttccacca
tcaccgtcgccccttgcaccctattattag
DBGET
integrated database retrieval system
